RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441883.5

MRPL28-204, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, humanhuman

TSL 5

Gene MRPL28, Length 800 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28-204ENST00000441883 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.39■■■■■ 4.38
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MRPL28-204ENST00000441883 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.38■■■■■ 4.37
MRPL28-204ENST00000441883 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.37
MRPL28-204ENST00000441883 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP42.35■■■■■ 4.37
MRPL28-204ENST00000441883 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP42.35■■■■■ 4.37
MRPL28-204ENST00000441883 PTPN23Q9H3S7 1636 aa42.35■■■■■ 4.37
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MRPL28-204ENST00000441883 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
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MRPL28-204ENST00000441883 FGD6Q6ZV73 1430 aa42.29■■■■■ 4.36
MRPL28-204ENST00000441883 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa42.27■■■■■ 4.36
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MRPL28-204ENST00000441883 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.26■■■■■ 4.36
MRPL28-204ENST00000441883 A2ML1A8K2U0 1454 aa42.24■■■■■ 4.35
MRPL28-204ENST00000441883 PLA2R1Q13018 1463 aa42.24■■■■■ 4.35
MRPL28-204ENST00000441883 SHANK2Q9UPX8 1470 aa42.24■■■■■ 4.35
MRPL28-204ENST00000441883 CROCC2H7BZ55 1655 aa42.24■■■■■ 4.35
MRPL28-204ENST00000441883 TNRQ92752 1358 aa42.24■■■■■ 4.35
MRPL28-204ENST00000441883 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.22■■■■■ 4.35
MRPL28-204ENST00000441883 DAPK1P53355 1430 aa42.2■■■■■ 4.35
MRPL28-204ENST00000441883 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.2■■■■■ 4.35
MRPL28-204ENST00000441883 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
MRPL28-204ENST00000441883 ABCC3O15438 1527 aa42.19■■■■■ 4.34
MRPL28-204ENST00000441883 PKD2Q13563 968 aa42.18■■■■■ 4.34
MRPL28-204ENST00000441883 KIF15Q9NS87 1388 aa42.17■■■■■ 4.34
MRPL28-204ENST00000441883 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa42.16■■■■■ 4.34
MRPL28-204ENST00000441883 LTBP4Q8N2S1 1624 aa42.15■■■■■ 4.34
MRPL28-204ENST00000441883 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.34
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MRPL28-204ENST00000441883 CHIC2Q9UKJ5 165 aa42.06■■■■■ 4.32
MRPL28-204ENST00000441883 CEP152O94986 1710 aa42.05■■■■■ 4.32
MRPL28-204ENST00000441883 NLRP1Q9C000 1473 aa42.04■■■■■ 4.32
MRPL28-204ENST00000441883 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa42.02■■■■■ 4.32
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MRPL28-204ENST00000441883 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
MRPL28-204ENST00000441883 ERVK-7P63135 1459 aa41.98■■■■■ 4.31
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MRPL28-204ENST00000441883 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
MRPL28-204ENST00000441883 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.96■■■■■ 4.31
MRPL28-204ENST00000441883 DEPDC5O75140 1603 aa41.95■■■■■ 4.31
MRPL28-204ENST00000441883 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
MRPL28-204ENST00000441883 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.95■■■■■ 4.31
MRPL28-204ENST00000441883 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.93■■■■■ 4.3
MRPL28-204ENST00000441883 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
MRPL28-204ENST00000441883 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.93■■■■■ 4.38e-6■□□□□ 8.2
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MRPL28-204ENST00000441883 ADGRL2O95490 1459 aa41.91■■■■■ 4.3
MRPL28-204ENST00000441883 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.9■■■■■ 4.3
MRPL28-204ENST00000441883 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.89■■■■■ 4.3
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MRPL28-204ENST00000441883 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.81■■■■■ 4.28
MRPL28-204ENST00000441883 MED14O60244 1454 aa41.79■■■■■ 4.28
MRPL28-204ENST00000441883 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.77■■■■■ 4.28
MRPL28-204ENST00000441883 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.75■■■■■ 4.27
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MRPL28-204ENST00000441883 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.62■■■■■ 4.25
MRPL28-204ENST00000441883 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.62■■■■■ 4.25
MRPL28-204ENST00000441883 PIK3C2BO00750 1634 aa41.62■■■■■ 4.25
MRPL28-204ENST00000441883 CPS1P31327 1500 aa41.6■■■■■ 4.25
MRPL28-204ENST00000441883 SLIT1O75093 1534 aa41.59■■■■■ 4.25
MRPL28-204ENST00000441883 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.59■■■■■ 4.25
MRPL28-204ENST00000441883 LTKP29376 864 aa41.59■■■■■ 4.25
MRPL28-204ENST00000441883 NOS1P29475 1434 aa41.59■■■■■ 4.25
MRPL28-204ENST00000441883 IDI1Q13907 227 aa41.58■■■■■ 4.25
MRPL28-204ENST00000441883 ROCK1Q13464 1354 aa41.58■■■■■ 4.25
MRPL28-204ENST00000441883 SYNMO15061 1565 aa41.57■■■■■ 4.25
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MRPL28-204ENST00000441883 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.48■■■■■ 4.23
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MRPL28-204ENST00000441883 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.33■■■■■ 4.21
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MRPL28-204ENST00000441883 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
MRPL28-204ENST00000441883 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.22■■■■■ 4.19
MRPL28-204ENST00000441883 SLC26A8Q96RN1 970 aa41.2■■■■■ 4.19
MRPL28-204ENST00000441883 DISP3Q9P2K9 1392 aa41.2■■■■■ 4.19
MRPL28-204ENST00000441883 ZFYVE9O95405 1425 aa41.19■■■■■ 4.18
MRPL28-204ENST00000441883 HSPA1LP34931 641 aa41.16■■■■■ 4.18
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