RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-210	ENST00000440825	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	42.9	■■■■■ 4.46
FAAP20-210	ENST00000440825	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		42.89	■■■■■ 4.46
FAAP20-210	ENST00000440825	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		42.88	■■■■■ 4.46
FAAP20-210	ENST00000440825	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		42.88	■■■■■ 4.45
FAAP20-210	ENST00000440825	KIF15	Q9NS87	1388 aa		42.87	■■■■■ 4.45
FAAP20-210	ENST00000440825	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.87	■■■■■ 4.45
FAAP20-210	ENST00000440825	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		42.86	■■■■■ 4.45
FAAP20-210	ENST00000440825	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	42.82	■■■■■ 4.44
FAAP20-210	ENST00000440825	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	42.8	■■■■■ 4.44
FAAP20-210	ENST00000440825	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		42.78	■■■■■ 4.44
FAAP20-210	ENST00000440825	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		42.76	■■■■■ 4.44
FAAP20-210	ENST00000440825	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	42.74	■■■■■ 4.43
FAAP20-210	ENST00000440825	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		42.74	■■■■■ 4.43
FAAP20-210	ENST00000440825	STRC	Q7RTU9	1775 aa		42.73	■■■■■ 4.43
FAAP20-210	ENST00000440825	PZP	P20742	1482 aa		42.7	■■■■■ 4.43
FAAP20-210	ENST00000440825	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		42.7	■■■■■ 4.43
FAAP20-210	ENST00000440825	ABCC3	O15438	1527 aa		42.68	■■■■■ 4.42
FAAP20-210	ENST00000440825	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		42.68	■■■■■ 4.42
FAAP20-210	ENST00000440825	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	42.66	■■■■■ 4.42
FAAP20-210	ENST00000440825	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	42.66	■■■■■ 4.42
FAAP20-210	ENST00000440825	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	42.66	■■■■■ 4.42
FAAP20-210	ENST00000440825	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		42.66	■■■■■ 4.42
FAAP20-210	ENST00000440825	TNR	Q92752	1358 aa		42.65	■■■■■ 4.42
FAAP20-210	ENST00000440825	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		42.65	■■■■■ 4.42
FAAP20-210	ENST00000440825	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	42.65	■■■■■ 4.42
FAAP20-210	ENST00000440825	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	42.64	■■■■■ 4.42
FAAP20-210	ENST00000440825	CEP152	O94986	1710 aa		42.63	■■■■■ 4.42
FAAP20-210	ENST00000440825	NCOA1	Q15788	1441 aa		42.63	■■■■■ 4.41
FAAP20-210	ENST00000440825	ADGRL2	O95490	1459 aa		42.57	■■■■■ 4.41
FAAP20-210	ENST00000440825	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		42.55	■■■■■ 4.4
FAAP20-210	ENST00000440825	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	42.55	■■■■■ 4.4
FAAP20-210	ENST00000440825	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		42.53	■■■■■ 4.4
FAAP20-210	ENST00000440825	ITGAE	P38570	1179 aa		42.53	■■■■■ 4.4
FAAP20-210	ENST00000440825	KANK1	Q14678	1352 aa		42.52	■■■■■ 4.4
FAAP20-210	ENST00000440825	DEPDC5	O75140	1603 aa		42.49	■■■■■ 4.39
FAAP20-210	ENST00000440825	PTPRT	O14522	1441 aa		42.48	■■■■■ 4.39
FAAP20-210	ENST00000440825	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	42.46	■■■■■ 4.39
FAAP20-210	ENST00000440825	ERVK-7	P63135	1459 aa		42.44	■■■■■ 4.38
FAAP20-210	ENST00000440825	PLA2R1	Q13018	1463 aa		42.43	■■■■■ 4.38
FAAP20-210	ENST00000440825	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		42.43	■■■■■ 4.38
FAAP20-210	ENST00000440825	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		42.42	■■■■■ 4.38
FAAP20-210	ENST00000440825	NLRP1	Q9C000	1473 aa		42.42	■■■■■ 4.38
FAAP20-210	ENST00000440825	PKD2	Q13563	968 aa		42.39	■■■■■ 4.38
FAAP20-210	ENST00000440825	CERK	Q8TCT0	537 aa		42.37	■■■■■ 4.37
FAAP20-210	ENST00000440825	FBXO41	Q8TF61	875 aa		42.37	■■■■■ 4.37
FAAP20-210	ENST00000440825	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		42.35	■■■■■ 4.37
FAAP20-210	ENST00000440825	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		42.32	■■■■■ 4.37
FAAP20-210	ENST00000440825	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	42.32	■■■■■ 4.37	1e-7	■■■■□ 21
FAAP20-210	ENST00000440825	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	42.32	■■■■■ 4.37
FAAP20-210	ENST00000440825	ROCK1	Q13464	1354 aa		42.3	■■■■■ 4.36
FAAP20-210	ENST00000440825	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		42.3	■■■■■ 4.36
FAAP20-210	ENST00000440825	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		42.27	■■■■■ 4.36
FAAP20-210	ENST00000440825	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	42.25	■■■■■ 4.35
FAAP20-210	ENST00000440825	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		42.23	■■■■■ 4.35
FAAP20-210	ENST00000440825	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	42.22	■■■■■ 4.35
FAAP20-210	ENST00000440825	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		42.2	■■■■■ 4.35
FAAP20-210	ENST00000440825	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	42.17	■■■■■ 4.34
FAAP20-210	ENST00000440825	UNC13B	O14795	1591 aa		42.15	■■■■■ 4.34
FAAP20-210	ENST00000440825	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		42.15	■■■■■ 4.34
FAAP20-210	ENST00000440825	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		42.14	■■■■■ 4.34
FAAP20-210	ENST00000440825	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		42.13	■■■■■ 4.34
FAAP20-210	ENST00000440825	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		42.12	■■■■■ 4.33
FAAP20-210	ENST00000440825	PIK3C2B	O00750	1634 aa		42.09	■■■■■ 4.33
FAAP20-210	ENST00000440825	TET3	O43151	1660 aa		42.08	■■■■■ 4.33
FAAP20-210	ENST00000440825	SYNM	O15061	1565 aa		42.06	■■■■■ 4.32
FAAP20-210	ENST00000440825	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	42.05	■■■■■ 4.32
FAAP20-210	ENST00000440825	IDI1	Q13907	227 aa		42.04	■■■■■ 4.32
FAAP20-210	ENST00000440825	NUP155	O75694	1391 aa		42.03	■■■■■ 4.32
FAAP20-210	ENST00000440825	NOS1	P29475	1434 aa		42.03	■■■■■ 4.32
FAAP20-210	ENST00000440825	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		42.03	■■■■■ 4.32
FAAP20-210	ENST00000440825	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	42.02	■■■■■ 4.32
FAAP20-210	ENST00000440825	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		41.98	■■■■■ 4.31
FAAP20-210	ENST00000440825	MED14	O60244	1454 aa		41.98	■■■■■ 4.31
FAAP20-210	ENST00000440825	IQGAP1	P46940	1657 aa		41.98	■■■■■ 4.31
FAAP20-210	ENST00000440825	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		41.97	■■■■■ 4.31
FAAP20-210	ENST00000440825	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	41.95	■■■■■ 4.31
FAAP20-210	ENST00000440825	EID1	Q9Y6B2	187 aa		41.94	■■■■■ 4.3
FAAP20-210	ENST00000440825	LTK	P29376	864 aa		41.93	■■■■■ 4.3
FAAP20-210	ENST00000440825	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		41.93	■■■■■ 4.3
FAAP20-210	ENST00000440825	SLIT1	O75093	1534 aa		41.93	■■■■■ 4.3
FAAP20-210	ENST00000440825		E9PCH4	1651 aa		41.93	■■■■■ 4.3
FAAP20-210	ENST00000440825	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		41.92	■■■■■ 4.3
FAAP20-210	ENST00000440825	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		41.89	■■■■■ 4.3
FAAP20-210	ENST00000440825	NAIP	Q13075	1403 aa		41.88	■■■■■ 4.3
FAAP20-210	ENST00000440825	ADGRB3	O60242	1522 aa		41.88	■■■■■ 4.29
FAAP20-210	ENST00000440825	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	41.87	■■■■■ 4.29
FAAP20-210	ENST00000440825	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		41.86	■■■■■ 4.29
FAAP20-210	ENST00000440825	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	41.82	■■■■■ 4.29
FAAP20-210	ENST00000440825	CPS1	P31327	1500 aa		41.78	■■■■■ 4.28
FAAP20-210	ENST00000440825	HFM1	A2PYH4	1435 aa		41.77	■■■■■ 4.28
FAAP20-210	ENST00000440825	TRIM52	Q96A61	297 aa		41.75	■■■■■ 4.27
FAAP20-210	ENST00000440825	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		41.74	■■■■■ 4.27
FAAP20-210	ENST00000440825	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		41.74	■■■■■ 4.27
FAAP20-210	ENST00000440825	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	41.73	■■■■■ 4.27
FAAP20-210	ENST00000440825	BCAN	Q96GW7	911 aa		41.71	■■■■■ 4.27
FAAP20-210	ENST00000440825	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		41.69	■■■■■ 4.27
FAAP20-210	ENST00000440825	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		41.66	■■■■■ 4.26
FAAP20-210	ENST00000440825	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	41.66	■■■■■ 4.26
FAAP20-210	ENST00000440825	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		41.64	■■■■■ 4.26
FAAP20-210	ENST00000440825	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		41.64	■■■■■ 4.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms