RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 PZPP20742 1482 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRJ-202ENST00000440289 ROCK1Q13464 1354 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRJ-202ENST00000440289 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRJ-202ENST00000440289 NUP160Q12769 1436 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRJ-202ENST00000440289 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRJ-202ENST00000440289 CRBNQ96SW2 442 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRJ-202ENST00000440289 PANK3Q9H999 370 aa24.2■■□□□ 1.47
PTPRJ-202ENST00000440289 RGS3P49796 1198 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-202ENST00000440289 NLRP13Q86W25 1043 aa24.17■■□□□ 1.46
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PTPRJ-202ENST00000440289 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.17■■□□□ 1.46
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PTPRJ-202ENST00000440289 ATP10BO94823 1461 aa24.15■■□□□ 1.46
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PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRJ-202ENST00000440289 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.13■■□□□ 1.45
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PTPRJ-202ENST00000440289 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRJ-202ENST00000440289 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.05■■□□□ 1.44
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PTPRJ-202ENST00000440289 NEUROD2Q15784 382 aa24.04■■□□□ 1.44
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PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.01■■□□□ 1.43
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PTPRJ-202ENST00000440289 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
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PTPRJ-202ENST00000440289 MBD5Q9P267 1494 aa23.9■■□□□ 1.42
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PTPRJ-202ENST00000440289 PDE3BQ13370 1112 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRJ-202ENST00000440289 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.9■■□□□ 1.42
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PTPRJ-202ENST00000440289 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRJ-202ENST00000440289 ADGRL2O95490 1459 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRJ-202ENST00000440289 NFKBIBQ15653 356 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRJ-202ENST00000440289 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.8■■□□□ 1.4
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PTPRJ-202ENST00000440289 MS4A1P11836 297 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRJ-202ENST00000440289 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRJ-202ENST00000440289 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
PTPRJ-202ENST00000440289 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.77■■□□□ 1.4
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PTPRJ-202ENST00000440289 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRJ-202ENST00000440289 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.77■■□□□ 1.4
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PTPRJ-202ENST00000440289 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.75■■□□□ 1.39
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PTPRJ-202ENST00000440289 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-202ENST00000440289 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-202ENST00000440289 PLA2R1Q13018 1463 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-202ENST00000440289 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM161AQ3B820 660 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRJ-202ENST00000440289 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRJ-202ENST00000440289 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
PTPRJ-202ENST00000440289 GSE1Q14687 1217 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRJ-202ENST00000440289 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.68■■□□□ 1.38
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