RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439830.5

ANKRD28-203, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 5

Gene ANKRD28, Length 592 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-203ENST00000439830 PTPRTO14522 1441 aa39.76■■■■□ 3.96
ANKRD28-203ENST00000439830 KIF3BO15066 747 aa39.75■■■■□ 3.95
ANKRD28-203ENST00000439830 CERKQ8TCT0 537 aa39.74■■■■□ 3.95
ANKRD28-203ENST00000439830 APLP2Q06481 763 aa39.69■■■■□ 3.94
ANKRD28-203ENST00000439830 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
ANKRD28-203ENST00000439830 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
ANKRD28-203ENST00000439830 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.67■■■■□ 3.94
ANKRD28-203ENST00000439830 PZPP20742 1482 aa39.63■■■■□ 3.94
ANKRD28-203ENST00000439830 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.63■■■■□ 3.93
ANKRD28-203ENST00000439830 PLA2R1Q13018 1463 aa39.62■■■■□ 3.93
ANKRD28-203ENST00000439830 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
ANKRD28-203ENST00000439830 A2ML1A8K2U0 1454 aa39.59■■■■□ 3.93
ANKRD28-203ENST00000439830 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa39.59■■■■□ 3.93
ANKRD28-203ENST00000439830 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
ANKRD28-203ENST00000439830 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.55■■■■□ 3.92
ANKRD28-203ENST00000439830 TNRQ92752 1358 aa39.53■■■■□ 3.92
ANKRD28-203ENST00000439830 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
ANKRD28-203ENST00000439830 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.53■■■■□ 3.92
ANKRD28-203ENST00000439830 LTBP4Q8N2S1 1624 aa39.53■■■■□ 3.92
ANKRD28-203ENST00000439830 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.91
ANKRD28-203ENST00000439830 MROH1Q8NDA8 1641 aa39.51■■■■□ 3.91
ANKRD28-203ENST00000439830 ABCC3O15438 1527 aa39.5■■■■□ 3.91
ANKRD28-203ENST00000439830 CEP152O94986 1710 aa39.49■■■■□ 3.91
ANKRD28-203ENST00000439830 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa39.49■■■■□ 3.91
ANKRD28-203ENST00000439830 FGD6Q6ZV73 1430 aa39.48■■■■□ 3.91
ANKRD28-203ENST00000439830 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
ANKRD28-203ENST00000439830 PKD2Q13563 968 aa39.47■■■■□ 3.91
ANKRD28-203ENST00000439830 ABCC5O15440 1437 aa39.46■■■■□ 3.91
ANKRD28-203ENST00000439830 DAPK1P53355 1430 aa39.42■■■■□ 3.9
ANKRD28-203ENST00000439830 KIF15Q9NS87 1388 aa39.41■■■■□ 3.9
ANKRD28-203ENST00000439830 NLRP1Q9C000 1473 aa39.41■■■■□ 3.9
ANKRD28-203ENST00000439830 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
ANKRD28-203ENST00000439830 ERBINQ96RT1 1412 aa39.39■■■■□ 3.9
ANKRD28-203ENST00000439830 IQSEC2Q5JU85 1478 aa39.38■■■■□ 3.9
ANKRD28-203ENST00000439830 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa39.38■■■■□ 3.89
ANKRD28-203ENST00000439830 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP39.37■■■■□ 3.89
ANKRD28-203ENST00000439830 NEURL4Q96JN8 1562 aa39.33■■■■□ 3.89
ANKRD28-203ENST00000439830 UGGT1Q9NYU2 1555 aa39.33■■■■□ 3.89
ANKRD28-203ENST00000439830 DEPDC5O75140 1603 aa39.33■■■■□ 3.89
ANKRD28-203ENST00000439830 ERVK-7P63135 1459 aa39.31■■■■□ 3.88
ANKRD28-203ENST00000439830 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.29■■■■□ 3.88
ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP39.29■■■■□ 3.88
ANKRD28-203ENST00000439830 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa39.23■■■■□ 3.87
ANKRD28-203ENST00000439830 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP39.23■■■■□ 3.877e-13■□□□□ 10.3
ANKRD28-203ENST00000439830 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP39.22■■■■□ 3.87
ANKRD28-203ENST00000439830 UBR1Q8IWV7 1749 aa39.19■■■■□ 3.86
ANKRD28-203ENST00000439830 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa39.17■■■■□ 3.86
ANKRD28-203ENST00000439830 ANKLE2Q86XL3 938 aa39.17■■■■□ 3.86
ANKRD28-203ENST00000439830 ADGRL2O95490 1459 aa39.17■■■■□ 3.86
ANKRD28-203ENST00000439830 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.16■■■■□ 3.86
ANKRD28-203ENST00000439830 IQGAP1P46940 1657 aa39.16■■■■□ 3.86
ANKRD28-203ENST00000439830 KANK1Q14678 1352 aa39.13■■■■□ 3.85
ANKRD28-203ENST00000439830 MED14O60244 1454 aa39.12■■■■□ 3.85
ANKRD28-203ENST00000439830 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
ANKRD28-203ENST00000439830 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP39.11■■■■□ 3.85
ANKRD28-203ENST00000439830 VWDEQ8N2E2 1590 aa39.1■■■■□ 3.85
ANKRD28-203ENST00000439830 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP39.09■■■■□ 3.85
ANKRD28-203ENST00000439830 CPS1P31327 1500 aa39.08■■■■□ 3.85
ANKRD28-203ENST00000439830 LMTK2Q8IWU2 1503 aa39.08■■■■□ 3.85
ANKRD28-203ENST00000439830 PIK3C2BO00750 1634 aa39.02■■■■□ 3.84
ANKRD28-203ENST00000439830 EFCAB6Q5THR3 1501 aa39■■■■□ 3.83
ANKRD28-203ENST00000439830 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP38.98■■■■□ 3.83
ANKRD28-203ENST00000439830 SLIT1O75093 1534 aa38.96■■■■□ 3.83
ANKRD28-203ENST00000439830 UBAP1LF5GYI3 381 aa38.96■■■■□ 3.83
ANKRD28-203ENST00000439830 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa38.96■■■■□ 3.83
ANKRD28-203ENST00000439830 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
ANKRD28-203ENST00000439830 ARHGAP23Q9P227 1491 aa38.94■■■■□ 3.82
ANKRD28-203ENST00000439830 SYNMO15061 1565 aa38.92■■■■□ 3.82
ANKRD28-203ENST00000439830 STRCP1A6NGW2 1772 aa38.92■■■■□ 3.82
ANKRD28-203ENST00000439830 TET3O43151 1660 aa38.88■■■■□ 3.81
ANKRD28-203ENST00000439830 UNC13BO14795 1591 aa38.87■■■■□ 3.81
ANKRD28-203ENST00000439830 GCC2Q8IWJ2 1684 aa38.86■■■■□ 3.81
ANKRD28-203ENST00000439830 NOS1P29475 1434 aa38.84■■■■□ 3.81
ANKRD28-203ENST00000439830 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP38.83■■■■□ 3.81
ANKRD28-203ENST00000439830 ADGRB3O60242 1522 aa38.8■■■■□ 3.8
ANKRD28-203ENST00000439830 TXNDC2Q86VQ3 553 aa38.8■■■■□ 3.8
ANKRD28-203ENST00000439830 STAG3Q9UJ98 1225 aa38.8■■■■□ 3.8
ANKRD28-203ENST00000439830 ROCK1Q13464 1354 aa38.8■■■■□ 3.8
ANKRD28-203ENST00000439830 TMEM2Q9UHN6 1383 aa38.79■■■■□ 3.8
ANKRD28-203ENST00000439830 LTKP29376 864 aa38.78■■■■□ 3.8
ANKRD28-203ENST00000439830 EID1Q9Y6B2 187 aa38.78■■■■□ 3.8
ANKRD28-203ENST00000439830 IDI1Q13907 227 aa38.76■■■■□ 3.8
ANKRD28-203ENST00000439830 MYO5BQ9ULV0 1848 aa38.75■■■■□ 3.79
ANKRD28-203ENST00000439830 DISP3Q9P2K9 1392 aa38.74■■■■□ 3.79
ANKRD28-203ENST00000439830 TOM1O60784 492 aa38.73■■■■□ 3.79
ANKRD28-203ENST00000439830 LRRC7Q96NW7 1537 aa38.73■■■■□ 3.79
ANKRD28-203ENST00000439830 IQGAP3Q86VI3 1631 aa38.71■■■■□ 3.79
ANKRD28-203ENST00000439830 E9PCH4 1651 aa38.7■■■■□ 3.79
ANKRD28-203ENST00000439830 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.69■■■■□ 3.78
ANKRD28-203ENST00000439830 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
ANKRD28-203ENST00000439830 SLC52A1Q9NWF4 448 aa38.68■■■■□ 3.78
ANKRD28-203ENST00000439830 ALKQ9UM73 1620 aa38.67■■■■□ 3.78
ANKRD28-203ENST00000439830 PIP4K2BP78356 416 aa38.65■■■■□ 3.78
ANKRD28-203ENST00000439830 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP38.65■■■■□ 3.78
ANKRD28-203ENST00000439830 ITGAEP38570 1179 aa38.62■■■■□ 3.77
ANKRD28-203ENST00000439830 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa38.6■■■■□ 3.77
ANKRD28-203ENST00000439830 HSPA1LP34931 641 aa38.53■■■■□ 3.76
ANKRD28-203ENST00000439830 NUP155O75694 1391 aa38.51■■■■□ 3.76
ANKRD28-203ENST00000439830 ZFYVE9O95405 1425 aa38.5■■■■□ 3.75
ANKRD28-203ENST00000439830 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP38.5■■■■□ 3.75
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