RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430930.5

TNS1-207, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-207ENST00000430930 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
TNS1-207ENST00000430930 AMPHP49418 695 aa16.32■□□□□ 0.2
TNS1-207ENST00000430930 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
TNS1-207ENST00000430930 CHMP3Q9Y3E7 222 aa16.32■□□□□ 0.2
TNS1-207ENST00000430930 PHF14O94880 888 aa16.32■□□□□ 0.2
TNS1-207ENST00000430930 KIF3AQ9Y496 699 aa16.32■□□□□ 0.2
TNS1-207ENST00000430930 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa16.31■□□□□ 0.2
TNS1-207ENST00000430930 CHMP4CQ96CF2 233 aa16.31■□□□□ 0.2
TNS1-207ENST00000430930 ST18O60284 1047 aa16.31■□□□□ 0.2
TNS1-207ENST00000430930 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
TNS1-207ENST00000430930 SMARCA4P51532 1647 aa16.29■□□□□ 0.2
TNS1-207ENST00000430930 CCDC146Q8IYE0 955 aa16.29■□□□□ 0.2
TNS1-207ENST00000430930 SLC4A10Q6U841 1118 aa16.28■□□□□ 0.2
TNS1-207ENST00000430930 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
TNS1-207ENST00000430930 CGNL1Q0VF96 1302 aa16.27■□□□□ 0.2
TNS1-207ENST00000430930 EVC2Q86UK5 1308 aa16.27■□□□□ 0.2
TNS1-207ENST00000430930 KIF16BQ96L93 1317 aa16.27■□□□□ 0.19
TNS1-207ENST00000430930 JPH4Q96JJ6 628 aa16.27■□□□□ 0.19
TNS1-207ENST00000430930 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.26■□□□□ 0.19
TNS1-207ENST00000430930 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
TNS1-207ENST00000430930 E9PSI1 815 aa16.26■□□□□ 0.19
TNS1-207ENST00000430930 VGFO15240 615 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
TNS1-207ENST00000430930 DDX11L8A8MPP1 907 aa16.26■□□□□ 0.19
TNS1-207ENST00000430930 NGEFQ8N5V2 710 aa16.25■□□□□ 0.19
TNS1-207ENST00000430930 USP35Q9P2H5 1018 aa16.24■□□□□ 0.19
TNS1-207ENST00000430930 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
TNS1-207ENST00000430930 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
TNS1-207ENST00000430930 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
TNS1-207ENST00000430930 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP16.24■□□□□ 0.195e-17■□□□□ 9
TNS1-207ENST00000430930 G3V3G9 751 aa16.23■□□□□ 0.19
TNS1-207ENST00000430930 DCAF8Q5TAQ9 597 aa16.23■□□□□ 0.19
TNS1-207ENST00000430930 COG3Q96JB2 828 aa16.23■□□□□ 0.19
TNS1-207ENST00000430930 CUX1P39880 1505 aa16.23■□□□□ 0.19
TNS1-207ENST00000430930 PANK3Q9H999 370 aa16.23■□□□□ 0.19
TNS1-207ENST00000430930 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.23■□□□□ 0.19
TNS1-207ENST00000430930 TRAK1Q9UPV9 953 aa16.23■□□□□ 0.19
TNS1-207ENST00000430930 CLUAP1Q96AJ1 413 aa16.22■□□□□ 0.19
TNS1-207ENST00000430930 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
TNS1-207ENST00000430930 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa16.21■□□□□ 0.19
TNS1-207ENST00000430930 RASSF8Q8NHQ8 419 aa16.21■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 C1orf141Q5JVX7 400 aa16.2■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa16.2■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 USP47Q96K76 1375 aa16.2■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 PTPRGP23470 1445 aa16.2■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa16.2■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 ZBED9Q6R2W3 1325 aa16.19■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 FAM161AQ3B820 660 aa16.19■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 ROCK1Q13464 1354 aa16.18■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa16.17■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 STAC3Q96MF2 364 aa16.17■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.17■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.17■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 RRP1P56182 461 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 TPM3P06753 285 aa16.15■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 TOMM22Q9NS69 142 aa16.15■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 H3BQV1 296 aa16.15■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 IFFO2Q5TF58 517 aa16.15■□□□□ 0.18
TNS1-207ENST00000430930 RUFY2Q8WXA3 655 aa16.14■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 DDX19BQ9UMR2 479 aa16.13■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 ANKRD45Q5TZF3 282 aa16.13■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 NEXNQ0ZGT2 675 aa16.12■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 MARCH6O60337 910 aa16.12■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 FAM184AQ8NB25 1140 aa16.12■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP16.12■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 RILPL2Q969X0 211 aa16.11■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 TEFQ10587 303 aa16.11■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.11■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 TTC5Q8N0Z6 440 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 REC8O95072 547 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 TPM2P07951 284 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 AAMPQ13685 434 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa16.1■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 CEP89Q96ST8 783 aa16.09■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.09■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 PDE4AP27815 886 aa16.09■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 AMOTL1Q8IY63 956 aa16.09■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 MIA2Q96PC5 1412 aa16.09■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 EVA1CP58658 441 aa16.09■□□□□ 0.17
TNS1-207ENST00000430930 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 NUTM2FA1L443 756 aa16.08■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 DDX58O95786 925 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 CRBNQ96SW2 442 aa16.07■□□□□ 0.16
TNS1-207ENST00000430930 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms