RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		28.09	■■■□□ 2.09
MRPL28-203	ENST00000429738	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		28.08	■■■□□ 2.09
MRPL28-203	ENST00000429738	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		28.05	■■■□□ 2.08
MRPL28-203	ENST00000429738	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		28.05	■■■□□ 2.08
MRPL28-203	ENST00000429738	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
MRPL28-203	ENST00000429738	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		28.01	■■■□□ 2.07
MRPL28-203	ENST00000429738	KIF3B	O15066	747 aa		27.98	■■■□□ 2.07
MRPL28-203	ENST00000429738	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MRPL28-203	ENST00000429738	MIA2	Q96PC5	1412 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MRPL28-203	ENST00000429738	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
MRPL28-203	ENST00000429738	TNR	Q92752	1358 aa		27.94	■■■□□ 2.06
MRPL28-203	ENST00000429738	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MRPL28-203	ENST00000429738	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TSPY4	P0CV99	314 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TSPY10	P0CW01	314 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-203	ENST00000429738	PZP	P20742	1482 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		27.87	■■■□□ 2.05
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		27.87	■■■□□ 2.05
MRPL28-203	ENST00000429738	APLP2	Q06481	763 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MRPL28-203	ENST00000429738	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
MRPL28-203	ENST00000429738	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MRPL28-203	ENST00000429738	TOM1	O60784	492 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MRPL28-203	ENST00000429738	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
MRPL28-203	ENST00000429738	CPS1	P31327	1500 aa		27.82	■■■□□ 2.04
MRPL28-203	ENST00000429738	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		27.82	■■■□□ 2.04
MRPL28-203	ENST00000429738	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	27.82	■■■□□ 2.04
MRPL28-203	ENST00000429738	HSPA1L	P34931	641 aa		27.8	■■■□□ 2.04
MRPL28-203	ENST00000429738	PIP4K2B	P78356	416 aa		27.8	■■■□□ 2.04
MRPL28-203	ENST00000429738	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
MRPL28-203	ENST00000429738	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		27.8	■■■□□ 2.04
MRPL28-203	ENST00000429738	NLRP1	Q9C000	1473 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
MRPL28-203	ENST00000429738	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
MRPL28-203	ENST00000429738	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MRPL28-203	ENST00000429738	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		27.75	■■■□□ 2.03
MRPL28-203	ENST00000429738	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MRPL28-203	ENST00000429738	MED14	O60244	1454 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ABCC5	O15440	1437 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MRPL28-203	ENST00000429738	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
MRPL28-203	ENST00000429738	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MRPL28-203	ENST00000429738	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		27.71	■■■□□ 2.03
MRPL28-203	ENST00000429738	DEPDC5	O75140	1603 aa		27.7	■■■□□ 2.02
MRPL28-203	ENST00000429738	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
MRPL28-203	ENST00000429738	DAPK1	P53355	1430 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ABCC3	O15438	1527 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MRPL28-203	ENST00000429738	KIF15	Q9NS87	1388 aa		27.64	■■■□□ 2.02
MRPL28-203	ENST00000429738	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		27.62	■■■□□ 2.01
MRPL28-203	ENST00000429738	IQGAP1	P46940	1657 aa		27.62	■■■□□ 2.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ERVK-7	P63135	1459 aa		27.59	■■■□□ 2.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ALK	Q9UM73	1620 aa		27.59	■■■□□ 2.01
MRPL28-203	ENST00000429738	CEP152	O94986	1710 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MRPL28-203	ENST00000429738	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
MRPL28-203	ENST00000429738	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
MRPL28-203	ENST00000429738	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		27.57	■■■□□ 2
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		27.56	■■■□□ 2
MRPL28-203	ENST00000429738	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		27.55	■■■□□ 2
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		27.53	■■■□□ 2
MRPL28-203	ENST00000429738	ADGRL2	O95490	1459 aa		27.52	■■■□□ 2
MRPL28-203	ENST00000429738	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
MRPL28-203	ENST00000429738	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		27.5	■■□□□ 1.99
MRPL28-203	ENST00000429738	LTK	P29376	864 aa		27.49	■■□□□ 1.99
MRPL28-203	ENST00000429738	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		27.49	■■□□□ 1.99
MRPL28-203	ENST00000429738	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		27.49	■■□□□ 1.99
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		27.49	■■□□□ 1.99
MRPL28-203	ENST00000429738	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	27.48	■■□□□ 1.99
MRPL28-203	ENST00000429738	SYNM	O15061	1565 aa		27.47	■■□□□ 1.99
MRPL28-203	ENST00000429738	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	27.46	■■□□□ 1.99
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		27.44	■■□□□ 1.98
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	27.44	■■□□□ 1.98
MRPL28-203	ENST00000429738	EID1	Q9Y6B2	187 aa		27.44	■■□□□ 1.98
MRPL28-203	ENST00000429738	SLIT1	O75093	1534 aa		27.43	■■□□□ 1.98
MRPL28-203	ENST00000429738	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		27.43	■■□□□ 1.98
MRPL28-203	ENST00000429738	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	27.4	■■□□□ 1.98	8e-6	■□□□□ 8.2
MRPL28-203	ENST00000429738	KANK1	Q14678	1352 aa		27.39	■■□□□ 1.98
MRPL28-203	ENST00000429738	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		27.36	■■□□□ 1.97
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		27.35	■■□□□ 1.97
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		27.35	■■□□□ 1.97
MRPL28-203	ENST00000429738	IDI1	Q13907	227 aa		27.32	■■□□□ 1.96
MRPL28-203	ENST00000429738	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	27.32	■■□□□ 1.96
MRPL28-203	ENST00000429738	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		27.31	■■□□□ 1.96
MRPL28-203	ENST00000429738	PIK3C2B	O00750	1634 aa		27.31	■■□□□ 1.96
MRPL28-203	ENST00000429738	ROCK1	Q13464	1354 aa		27.29	■■□□□ 1.96
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		27.29	■■□□□ 1.96
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNA6	P17658	529 aa		27.28	■■□□□ 1.96
MRPL28-203	ENST00000429738	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	27.28	■■□□□ 1.96
MRPL28-203	ENST00000429738	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	27.27	■■□□□ 1.96
MRPL28-203	ENST00000429738	NOS1	P29475	1434 aa		27.26	■■□□□ 1.95
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM94	Q12767	1356 aa		27.25	■■□□□ 1.95
MRPL28-203	ENST00000429738	UNC13B	O14795	1591 aa		27.25	■■□□□ 1.95
MRPL28-203	ENST00000429738	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	27.23	■■□□□ 1.95
MRPL28-203	ENST00000429738	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	27.23	■■□□□ 1.95
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		27.23	■■□□□ 1.95
MRPL28-203	ENST00000429738	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	27.23	■■□□□ 1.95
MRPL28-203	ENST00000429738	TET3	O43151	1660 aa		27.22	■■□□□ 1.95

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms