RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429159.6

MEG3-208, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEG3, Length 1,608 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-208ENST00000429159 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.73■■□□□ 1.87
MEG3-208ENST00000429159 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.73■■□□□ 1.87
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MEG3-208ENST00000429159 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
MEG3-208ENST00000429159 KANK1Q14678 1352 aa26.72■■□□□ 1.87
MEG3-208ENST00000429159 DEPDC5O75140 1603 aa26.66■■□□□ 1.86
MEG3-208ENST00000429159 A2MP01023 1474 aa26.66■■□□□ 1.86
MEG3-208ENST00000429159 RICTORQ6R327 1708 aa26.63■■□□□ 1.85
MEG3-208ENST00000429159 KIF3BO15066 747 aa26.63■■□□□ 1.85
MEG3-208ENST00000429159 RAPGEF3O95398 923 aa26.61■■□□□ 1.85
MEG3-208ENST00000429159 TSPOAP1O95153 1857 aa26.6■■□□□ 1.85
MEG3-208ENST00000429159 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.59■■□□□ 1.85
MEG3-208ENST00000429159 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.57■■□□□ 1.84
MEG3-208ENST00000429159 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
MEG3-208ENST00000429159 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.57■■□□□ 1.84
MEG3-208ENST00000429159 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
MEG3-208ENST00000429159 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
MEG3-208ENST00000429159 ATP10AO60312 1499 aa26.55■■□□□ 1.84
MEG3-208ENST00000429159 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.55■■□□□ 1.84
MEG3-208ENST00000429159 ABCA6Q8N139 1617 aa26.55■■□□□ 1.84
MEG3-208ENST00000429159 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.54■■□□□ 1.84
MEG3-208ENST00000429159 TET3O43151 1660 aa26.54■■□□□ 1.84
MEG3-208ENST00000429159 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.54■■□□□ 1.84
MEG3-208ENST00000429159 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
MEG3-208ENST00000429159 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.51■■□□□ 1.83
MEG3-208ENST00000429159 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.49■■□□□ 1.83
MEG3-208ENST00000429159 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.47■■□□□ 1.83
MEG3-208ENST00000429159 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.46■■□□□ 1.83
MEG3-208ENST00000429159 E9PCH4 1651 aa26.45■■□□□ 1.83
MEG3-208ENST00000429159 PLA2R1Q13018 1463 aa26.43■■□□□ 1.82
MEG3-208ENST00000429159 TRPM2O94759 1503 aa26.41■■□□□ 1.82
MEG3-208ENST00000429159 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.4■■□□□ 1.82
MEG3-208ENST00000429159 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.4■■□□□ 1.82
MEG3-208ENST00000429159 PTPRTO14522 1441 aa26.4■■□□□ 1.82
MEG3-208ENST00000429159 GGT6Q6P531 493 aa26.4■■□□□ 1.82
MEG3-208ENST00000429159 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.4■■□□□ 1.82
MEG3-208ENST00000429159 REREQ9P2R6 1566 aa26.38■■□□□ 1.81
MEG3-208ENST00000429159 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.37■■□□□ 1.81
MEG3-208ENST00000429159 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.37■■□□□ 1.81
MEG3-208ENST00000429159 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.81
MEG3-208ENST00000429159 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
MEG3-208ENST00000429159 CEP152O94986 1710 aa26.34■■□□□ 1.81
MEG3-208ENST00000429159 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.33■■□□□ 1.81
MEG3-208ENST00000429159 STAC3Q96MF2 364 aa26.33■■□□□ 1.81
MEG3-208ENST00000429159 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.32■■□□□ 1.8
MEG3-208ENST00000429159 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.32■■□□□ 1.8
MEG3-208ENST00000429159 ABCC3O15438 1527 aa26.31■■□□□ 1.8
MEG3-208ENST00000429159 AGLP35573 1532 aa26.31■■□□□ 1.8
MEG3-208ENST00000429159 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
MEG3-208ENST00000429159 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.28■■□□□ 1.8
MEG3-208ENST00000429159 RGL3Q3MIN7 710 aa26.28■■□□□ 1.8
MEG3-208ENST00000429159 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.27■■□□□ 1.8
MEG3-208ENST00000429159 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.27■■□□□ 1.8
MEG3-208ENST00000429159 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.26■■□□□ 1.79
MEG3-208ENST00000429159 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.25■■□□□ 1.79
MEG3-208ENST00000429159 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.25■■□□□ 1.79
MEG3-208ENST00000429159 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.25■■□□□ 1.79
MEG3-208ENST00000429159 CLTCL1P53675 1640 aa26.24■■□□□ 1.79
MEG3-208ENST00000429159 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.24■■□□□ 1.79
MEG3-208ENST00000429159 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
MEG3-208ENST00000429159 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
MEG3-208ENST00000429159 NPATQ14207 1427 aa26.23■■□□□ 1.79
MEG3-208ENST00000429159 KIF1BO60333 1816 aa26.2■■□□□ 1.79
MEG3-208ENST00000429159 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.2■■□□□ 1.78
MEG3-208ENST00000429159 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
MEG3-208ENST00000429159 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.16■■□□□ 1.78
MEG3-208ENST00000429159 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
MEG3-208ENST00000429159 NOS1P29475 1434 aa26.14■■□□□ 1.77
MEG3-208ENST00000429159 USP47Q96K76 1375 aa26.13■■□□□ 1.77
MEG3-208ENST00000429159 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.11■■□□□ 1.77
MEG3-208ENST00000429159 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
MEG3-208ENST00000429159 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.1■■□□□ 1.77
MEG3-208ENST00000429159 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
MEG3-208ENST00000429159 LAMC1P11047 1609 aa26.08■■□□□ 1.77
MEG3-208ENST00000429159 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
MEG3-208ENST00000429159 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.07■■□□□ 1.76
MEG3-208ENST00000429159 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.07■■□□□ 1.76
MEG3-208ENST00000429159 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.06■■□□□ 1.76
MEG3-208ENST00000429159 MYOM2P54296 1465 aa26.06■■□□□ 1.76
MEG3-208ENST00000429159 ADGRB3O60242 1522 aa26.06■■□□□ 1.76
MEG3-208ENST00000429159 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
MEG3-208ENST00000429159 MIER1Q8N108 512 aa26.04■■□□□ 1.76
MEG3-208ENST00000429159 PIK3C2BO00750 1634 aa26.03■■□□□ 1.76
MEG3-208ENST00000429159 MADDQ8WXG6 1647 aa26.03■■□□□ 1.76
MEG3-208ENST00000429159 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
MEG3-208ENST00000429159 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.03■■□□□ 1.76
MEG3-208ENST00000429159 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.02■■□□□ 1.76
MEG3-208ENST00000429159 SYNMO15061 1565 aa26.01■■□□□ 1.75
MEG3-208ENST00000429159 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
MEG3-208ENST00000429159 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
MEG3-208ENST00000429159 MLECQ14165 292 aa26■■□□□ 1.75
MEG3-208ENST00000429159 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.99■■□□□ 1.75
MEG3-208ENST00000429159 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.99■■□□□ 1.75
MEG3-208ENST00000429159 IFT172Q9UG01 1749 aa25.98■■□□□ 1.75
MEG3-208ENST00000429159 MROH2AA6NES4 1674 aa25.97■■□□□ 1.75
MEG3-208ENST00000429159 CCDC7Q96M83 1385 aa25.97■■□□□ 1.75
MEG3-208ENST00000429159 ERVK-7P63135 1459 aa25.97■■□□□ 1.75
MEG3-208ENST00000429159 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.94■■□□□ 1.74
MEG3-208ENST00000429159 IDI1Q13907 227 aa25.93■■□□□ 1.74
MEG3-208ENST00000429159 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
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