RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, human

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIOBP-209	ENST00000428075	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		43.83	■■■■■ 4.61
TRIOBP-209	ENST00000428075	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	43.83	■■■■■ 4.61
TRIOBP-209	ENST00000428075	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		43.82	■■■■■ 4.61
TRIOBP-209	ENST00000428075	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	43.8	■■■■■ 4.6
TRIOBP-209	ENST00000428075	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	43.8	■■■■■ 4.6
TRIOBP-209	ENST00000428075	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		43.78	■■■■■ 4.6
TRIOBP-209	ENST00000428075	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		43.77	■■■■■ 4.6
TRIOBP-209	ENST00000428075	ABCC5	O15440	1437 aa		43.76	■■■■■ 4.6
TRIOBP-209	ENST00000428075	PZP	P20742	1482 aa		43.76	■■■■■ 4.6
TRIOBP-209	ENST00000428075	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	43.75	■■■■■ 4.59
TRIOBP-209	ENST00000428075	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		43.73	■■■■■ 4.59
TRIOBP-209	ENST00000428075	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		43.73	■■■■■ 4.59
TRIOBP-209	ENST00000428075	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		43.7	■■■■■ 4.59
TRIOBP-209	ENST00000428075	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	43.7	■■■■■ 4.59
TRIOBP-209	ENST00000428075	PLA2R1	Q13018	1463 aa		43.69	■■■■■ 4.58
TRIOBP-209	ENST00000428075	TNR	Q92752	1358 aa		43.68	■■■■■ 4.58
TRIOBP-209	ENST00000428075	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	43.68	■■■■■ 4.58
TRIOBP-209	ENST00000428075	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		43.67	■■■■■ 4.58
TRIOBP-209	ENST00000428075	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		43.67	■■■■■ 4.58
TRIOBP-209	ENST00000428075	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		43.67	■■■■■ 4.58
TRIOBP-209	ENST00000428075	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		43.65	■■■■■ 4.58
TRIOBP-209	ENST00000428075	ABCC3	O15438	1527 aa		43.64	■■■■■ 4.58
TRIOBP-209	ENST00000428075	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	43.64	■■■■■ 4.58
TRIOBP-209	ENST00000428075	DAPK1	P53355	1430 aa		43.64	■■■■■ 4.58
TRIOBP-209	ENST00000428075	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		43.62	■■■■■ 4.57
TRIOBP-209	ENST00000428075	KIF15	Q9NS87	1388 aa		43.61	■■■■■ 4.57
TRIOBP-209	ENST00000428075	PKD2	Q13563	968 aa		43.6	■■■■■ 4.57
TRIOBP-209	ENST00000428075	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		43.58	■■■■■ 4.57
TRIOBP-209	ENST00000428075	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	43.54	■■■■■ 4.56
TRIOBP-209	ENST00000428075	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		43.5	■■■■■ 4.55
TRIOBP-209	ENST00000428075	CEP152	O94986	1710 aa		43.48	■■■■■ 4.55
TRIOBP-209	ENST00000428075	NLRP1	Q9C000	1473 aa		43.47	■■■■■ 4.55
TRIOBP-209	ENST00000428075	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		43.47	■■■■■ 4.55
TRIOBP-209	ENST00000428075	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		43.46	■■■■■ 4.55
TRIOBP-209	ENST00000428075	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	43.46	■■■■■ 4.55
TRIOBP-209	ENST00000428075	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	43.44	■■■■■ 4.54
TRIOBP-209	ENST00000428075	ERVK-7	P63135	1459 aa		43.44	■■■■■ 4.54
TRIOBP-209	ENST00000428075	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		43.4	■■■■■ 4.54
TRIOBP-209	ENST00000428075	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		43.4	■■■■■ 4.54
TRIOBP-209	ENST00000428075	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	43.4	■■■■■ 4.54
TRIOBP-209	ENST00000428075	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		43.38	■■■■■ 4.54
TRIOBP-209	ENST00000428075	DEPDC5	O75140	1603 aa		43.37	■■■■■ 4.53
TRIOBP-209	ENST00000428075	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	43.35	■■■■■ 4.53
TRIOBP-209	ENST00000428075	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	43.35	■■■■■ 4.53
TRIOBP-209	ENST00000428075	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	43.34	■■■■■ 4.53
TRIOBP-209	ENST00000428075	ADGRL2	O95490	1459 aa		43.33	■■■■■ 4.53
TRIOBP-209	ENST00000428075	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		43.33	■■■■■ 4.53
TRIOBP-209	ENST00000428075	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	43.33	■■■■■ 4.53	2e-6	■■■□□ 17.7
TRIOBP-209	ENST00000428075	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		43.32	■■■■■ 4.53
TRIOBP-209	ENST00000428075	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	43.32	■■■■■ 4.53
TRIOBP-209	ENST00000428075	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		43.29	■■■■■ 4.52
TRIOBP-209	ENST00000428075	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		43.25	■■■■■ 4.51
TRIOBP-209	ENST00000428075	MED14	O60244	1454 aa		43.21	■■■■■ 4.51
TRIOBP-209	ENST00000428075	KANK1	Q14678	1352 aa		43.2	■■■■■ 4.51
TRIOBP-209	ENST00000428075	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		43.2	■■■■■ 4.51
TRIOBP-209	ENST00000428075	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		43.17	■■■■■ 4.5
TRIOBP-209	ENST00000428075	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	43.17	■■■■■ 4.5
TRIOBP-209	ENST00000428075	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		43.12	■■■■■ 4.49
TRIOBP-209	ENST00000428075	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	43.1	■■■■■ 4.49
TRIOBP-209	ENST00000428075	IQGAP1	P46940	1657 aa		43.06	■■■■■ 4.48
TRIOBP-209	ENST00000428075	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		43.06	■■■■■ 4.48
TRIOBP-209	ENST00000428075	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		43.04	■■■■■ 4.48
TRIOBP-209	ENST00000428075	PIK3C2B	O00750	1634 aa		43.03	■■■■■ 4.48
TRIOBP-209	ENST00000428075	SLIT1	O75093	1534 aa		43.02	■■■■■ 4.48
TRIOBP-209	ENST00000428075	LTK	P29376	864 aa		43.02	■■■■■ 4.48
TRIOBP-209	ENST00000428075	CPS1	P31327	1500 aa		43.02	■■■■■ 4.48
TRIOBP-209	ENST00000428075	SYNM	O15061	1565 aa		43.01	■■■■■ 4.48
TRIOBP-209	ENST00000428075	NOS1	P29475	1434 aa		43.01	■■■■■ 4.48
TRIOBP-209	ENST00000428075	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		43	■■■■■ 4.47
TRIOBP-209	ENST00000428075	IDI1	Q13907	227 aa		42.99	■■■■■ 4.47
TRIOBP-209	ENST00000428075	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	42.99	■■■■■ 4.47
TRIOBP-209	ENST00000428075	ROCK1	Q13464	1354 aa		42.97	■■■■■ 4.47
TRIOBP-209	ENST00000428075	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		42.94	■■■■■ 4.46
TRIOBP-209	ENST00000428075	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		42.9	■■■■■ 4.46
TRIOBP-209	ENST00000428075	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		42.9	■■■■■ 4.46
TRIOBP-209	ENST00000428075	UNC13B	O14795	1591 aa		42.89	■■■■■ 4.46
TRIOBP-209	ENST00000428075	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	42.87	■■■■■ 4.45
TRIOBP-209	ENST00000428075	ITGAE	P38570	1179 aa		42.86	■■■■■ 4.45
TRIOBP-209	ENST00000428075	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	42.86	■■■■■ 4.45
TRIOBP-209	ENST00000428075	TET3	O43151	1660 aa		42.86	■■■■■ 4.45
TRIOBP-209	ENST00000428075	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		42.84	■■■■■ 4.45
TRIOBP-209	ENST00000428075	EID1	Q9Y6B2	187 aa		42.82	■■■■■ 4.45
TRIOBP-209	ENST00000428075	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		42.8	■■■■■ 4.44
TRIOBP-209	ENST00000428075	ADGRB3	O60242	1522 aa		42.78	■■■■■ 4.44
TRIOBP-209	ENST00000428075	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		42.78	■■■■■ 4.44
TRIOBP-209	ENST00000428075	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		42.76	■■■■■ 4.44
TRIOBP-209	ENST00000428075	ALK	Q9UM73	1620 aa		42.75	■■■■■ 4.43
TRIOBP-209	ENST00000428075	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		42.71	■■■■■ 4.43
TRIOBP-209	ENST00000428075	TOM1	O60784	492 aa		42.71	■■■■■ 4.43
TRIOBP-209	ENST00000428075	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	42.71	■■■■■ 4.43
TRIOBP-209	ENST00000428075		E9PCH4	1651 aa		42.7	■■■■■ 4.43
TRIOBP-209	ENST00000428075	PIP4K2B	P78356	416 aa		42.68	■■■■■ 4.42
TRIOBP-209	ENST00000428075	NUP155	O75694	1391 aa		42.66	■■■■■ 4.42
TRIOBP-209	ENST00000428075	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		42.64	■■■■■ 4.42
TRIOBP-209	ENST00000428075	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		42.62	■■■■■ 4.41
TRIOBP-209	ENST00000428075	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	42.62	■■■■■ 4.41
TRIOBP-209	ENST00000428075	ZFYVE9	O95405	1425 aa		42.62	■■■■■ 4.41
TRIOBP-209	ENST00000428075	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		42.61	■■■■■ 4.41
TRIOBP-209	ENST00000428075	HSPA1L	P34931	641 aa		42.59	■■■■■ 4.41
TRIOBP-209	ENST00000428075	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		42.59	■■■■■ 4.41

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