RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 TSPY10P0CW01 314 aa32.9■■■□□ 2.86
UBXN4-204ENST00000426921 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
UBXN4-204ENST00000426921 KIF3BO15066 747 aa32.89■■■□□ 2.86
UBXN4-204ENST00000426921 PLA2R1Q13018 1463 aa32.86■■■□□ 2.85
UBXN4-204ENST00000426921 PZPP20742 1482 aa32.83■■■□□ 2.85
UBXN4-204ENST00000426921 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP32.82■■■□□ 2.84
UBXN4-204ENST00000426921 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
UBXN4-204ENST00000426921 A2ML1A8K2U0 1454 aa32.79■■■□□ 2.84
UBXN4-204ENST00000426921 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
UBXN4-204ENST00000426921 LTBP4Q8N2S1 1624 aa32.77■■■□□ 2.84
UBXN4-204ENST00000426921 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa32.76■■■□□ 2.83
UBXN4-204ENST00000426921 SHANK2Q9UPX8 1470 aa32.75■■■□□ 2.83
UBXN4-204ENST00000426921 APLP2Q06481 763 aa32.75■■■□□ 2.83
UBXN4-204ENST00000426921 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP32.73■■■□□ 2.83
UBXN4-204ENST00000426921 PTPN23Q9H3S7 1636 aa32.73■■■□□ 2.83
UBXN4-204ENST00000426921 TNRQ92752 1358 aa32.73■■■□□ 2.83
UBXN4-204ENST00000426921 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP32.73■■■□□ 2.83
UBXN4-204ENST00000426921 CROCC2H7BZ55 1655 aa32.72■■■□□ 2.83
UBXN4-204ENST00000426921 PKD2Q13563 968 aa32.72■■■□□ 2.83
UBXN4-204ENST00000426921 ABCC3O15438 1527 aa32.71■■■□□ 2.83
UBXN4-204ENST00000426921 DUOX2Q9NRD8 1548 aa32.71■■■□□ 2.83
UBXN4-204ENST00000426921 MROH1Q8NDA8 1641 aa32.7■■■□□ 2.83
UBXN4-204ENST00000426921 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP32.7■■■□□ 2.83
UBXN4-204ENST00000426921 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa32.7■■■□□ 2.82
UBXN4-204ENST00000426921 ABCC5O15440 1437 aa32.68■■■□□ 2.82
UBXN4-204ENST00000426921 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.68■■■□□ 2.82
UBXN4-204ENST00000426921 IQSEC2Q5JU85 1478 aa32.67■■■□□ 2.82
UBXN4-204ENST00000426921 NLRP1Q9C000 1473 aa32.65■■■□□ 2.82
UBXN4-204ENST00000426921 DAPK1P53355 1430 aa32.63■■■□□ 2.81
UBXN4-204ENST00000426921 KIF15Q9NS87 1388 aa32.62■■■□□ 2.81
UBXN4-204ENST00000426921 ERBINQ96RT1 1412 aa32.61■■■□□ 2.81
UBXN4-204ENST00000426921 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa32.61■■■□□ 2.81
UBXN4-204ENST00000426921 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP32.59■■■□□ 2.81
UBXN4-204ENST00000426921 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.81
UBXN4-204ENST00000426921 NEURL4Q96JN8 1562 aa32.57■■■□□ 2.8
UBXN4-204ENST00000426921 ERVK-7P63135 1459 aa32.55■■■□□ 2.8
UBXN4-204ENST00000426921 CEP152O94986 1710 aa32.55■■■□□ 2.8
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
UBXN4-204ENST00000426921 UGGT1Q9NYU2 1555 aa32.54■■■□□ 2.8
UBXN4-204ENST00000426921 DEPDC5O75140 1603 aa32.53■■■□□ 2.8
UBXN4-204ENST00000426921 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa32.5■■■□□ 2.79
UBXN4-204ENST00000426921 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
UBXN4-204ENST00000426921 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa32.49■■■□□ 2.79
UBXN4-204ENST00000426921 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP32.48■■■□□ 2.79
UBXN4-204ENST00000426921 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa32.46■■■□□ 2.79
UBXN4-204ENST00000426921 MED14O60244 1454 aa32.45■■■□□ 2.79
UBXN4-204ENST00000426921 ADGRL2O95490 1459 aa32.45■■■□□ 2.79
UBXN4-204ENST00000426921 ANKLE2Q86XL3 938 aa32.43■■■□□ 2.78
UBXN4-204ENST00000426921 VWDEQ8N2E2 1590 aa32.41■■■□□ 2.78
UBXN4-204ENST00000426921 LMTK2Q8IWU2 1503 aa32.4■■■□□ 2.78
UBXN4-204ENST00000426921 UBR1Q8IWV7 1749 aa32.37■■■□□ 2.77
UBXN4-204ENST00000426921 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
UBXN4-204ENST00000426921 CHIC2Q9UKJ5 165 aa32.37■■■□□ 2.77
UBXN4-204ENST00000426921 CPS1P31327 1500 aa32.36■■■□□ 2.77
UBXN4-204ENST00000426921 KANK1Q14678 1352 aa32.36■■■□□ 2.77
UBXN4-204ENST00000426921 IQGAP1P46940 1657 aa32.34■■■□□ 2.77
UBXN4-204ENST00000426921 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
UBXN4-204ENST00000426921 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP32.3■■■□□ 2.762e-7■■■□□ 16.1
UBXN4-204ENST00000426921 ARHGAP23Q9P227 1491 aa32.29■■■□□ 2.76
UBXN4-204ENST00000426921 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
UBXN4-204ENST00000426921 SLIT1O75093 1534 aa32.29■■■□□ 2.76
UBXN4-204ENST00000426921 EFCAB6Q5THR3 1501 aa32.27■■■□□ 2.76
UBXN4-204ENST00000426921 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa32.25■■■□□ 2.75
UBXN4-204ENST00000426921 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
UBXN4-204ENST00000426921 UBAP1LF5GYI3 381 aa32.24■■■□□ 2.75
UBXN4-204ENST00000426921 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
UBXN4-204ENST00000426921 PIK3C2BO00750 1634 aa32.23■■■□□ 2.75
UBXN4-204ENST00000426921 SYNMO15061 1565 aa32.2■■■□□ 2.75
UBXN4-204ENST00000426921 NOS1P29475 1434 aa32.2■■■□□ 2.75
UBXN4-204ENST00000426921 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
UBXN4-204ENST00000426921 ROCK1Q13464 1354 aa32.15■■■□□ 2.74
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM2Q9UHN6 1383 aa32.15■■■□□ 2.74
UBXN4-204ENST00000426921 STRCP1A6NGW2 1772 aa32.14■■■□□ 2.74
UBXN4-204ENST00000426921 LTKP29376 864 aa32.14■■■□□ 2.74
UBXN4-204ENST00000426921 UNC13BO14795 1591 aa32.13■■■□□ 2.73
UBXN4-204ENST00000426921 TET3O43151 1660 aa32.11■■■□□ 2.73
UBXN4-204ENST00000426921 IDI1Q13907 227 aa32.11■■■□□ 2.73
UBXN4-204ENST00000426921 TXNDC2Q86VQ3 553 aa32.11■■■□□ 2.73
UBXN4-204ENST00000426921 ADGRB3O60242 1522 aa32.1■■■□□ 2.73
UBXN4-204ENST00000426921 LRRC7Q96NW7 1537 aa32.09■■■□□ 2.73
UBXN4-204ENST00000426921 EID1Q9Y6B2 187 aa32.08■■■□□ 2.73
UBXN4-204ENST00000426921 TOM1O60784 492 aa32.07■■■□□ 2.72
UBXN4-204ENST00000426921 SLC52A1Q9NWF4 448 aa32.06■■■□□ 2.72
UBXN4-204ENST00000426921 ALKQ9UM73 1620 aa32.06■■■□□ 2.72
UBXN4-204ENST00000426921 DISP3Q9P2K9 1392 aa32.06■■■□□ 2.72
UBXN4-204ENST00000426921 GCC2Q8IWJ2 1684 aa32.05■■■□□ 2.72
UBXN4-204ENST00000426921 STAG3Q9UJ98 1225 aa32.05■■■□□ 2.72
UBXN4-204ENST00000426921 IQGAP3Q86VI3 1631 aa32■■■□□ 2.71
UBXN4-204ENST00000426921 PIP4K2BP78356 416 aa31.95■■■□□ 2.71
UBXN4-204ENST00000426921 E9PCH4 1651 aa31.95■■■□□ 2.7
UBXN4-204ENST00000426921 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
UBXN4-204ENST00000426921 ZFYVE9O95405 1425 aa31.92■■■□□ 2.7
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa31.92■■■□□ 2.7
UBXN4-204ENST00000426921 HSPA1LP34931 641 aa31.91■■■□□ 2.7
UBXN4-204ENST00000426921 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
UBXN4-204ENST00000426921 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
UBXN4-204ENST00000426921 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
UBXN4-204ENST00000426921 MYO5BQ9ULV0 1848 aa31.87■■■□□ 2.69
UBXN4-204ENST00000426921 ITGAEP38570 1179 aa31.86■■■□□ 2.69
UBXN4-204ENST00000426921 ILDR2Q71H61 639 aa31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms