RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26■■□□□ 1.75
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.99■■□□□ 1.75
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.98■■□□□ 1.75
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FANCAO15360 1455 aa25.96■■□□□ 1.75
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.95■■□□□ 1.75
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP10AO60312 1499 aa25.95■■□□□ 1.74
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASXL2Q76L83 1435 aa25.94■■□□□ 1.74
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AFAP1Q8N556 730 aa25.93■■□□□ 1.74
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.93■■□□□ 1.74
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.91■■□□□ 1.74
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OSCARQ8IYS5 282 aa25.91■■□□□ 1.74
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.9■■□□□ 1.74
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP7AQ04656 1500 aa25.89■■□□□ 1.74
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A2MP01023 1474 aa25.89■■□□□ 1.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DEPDC5O75140 1603 aa25.88■■□□□ 1.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADGRL1O94910 1474 aa25.87■■□□□ 1.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 E9PCH4 1651 aa25.86■■□□□ 1.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RGL3Q3MIN7 710 aa25.84■■□□□ 1.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.83■■□□□ 1.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC184Q52MB2 194 aa25.82■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.81■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LAMC1P11047 1609 aa25.79■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.79■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.79■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.78■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TET3O43151 1660 aa25.78■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRPM2O94759 1503 aa25.77■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.77■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.76■■□□□ 1.72
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRS2Q9HD23 443 aa25.75■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CEP152O94986 1710 aa25.73■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.73■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.73■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTPRTO14522 1441 aa25.72■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.71■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KANK1Q14678 1352 aa25.71■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.71■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.71■■□□□ 1.71
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.7■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLTCL1P53675 1640 aa25.69■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIF3BO15066 747 aa25.68■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD109Q6YHK3 1445 aa25.66■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.66■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MADDQ8WXG6 1647 aa25.65■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FKBP8Q14318 412 aa25.65■■□□□ 1.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.62■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEFLP07196 543 aa25.61■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.59■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.58■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TESK2Q96S53 571 aa25.58■■□□□ 1.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.57■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.56■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STAC3Q96MF2 364 aa25.56■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.55■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.55■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IQGAP1P46940 1657 aa25.55■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.54■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.53■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BCANQ96GW7 911 aa25.52■■□□□ 1.68
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.51■■□□□ 1.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEO1Q92859 1461 aa25.51■■□□□ 1.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIF1BO60333 1816 aa25.5■■□□□ 1.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCA6Q8N139 1617 aa25.49■■□□□ 1.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RALBP1Q15311 655 aa25.49■■□□□ 1.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.48■■□□□ 1.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMF1P82094 1093 aa25.47■■□□□ 1.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYOM2P54296 1465 aa25.45■■□□□ 1.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IFT172Q9UG01 1749 aa25.45■■□□□ 1.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMC1Q8TDI8 760 aa25.44■■□□□ 1.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.44■■□□□ 1.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MROH2AA6NES4 1674 aa25.44■■□□□ 1.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.43■■□□□ 1.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPATQ14207 1427 aa25.39■■□□□ 1.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.39■■□□□ 1.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADGRB3O60242 1522 aa25.38■■□□□ 1.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RICTORQ6R327 1708 aa25.38■■□□□ 1.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAPGEF3O95398 923 aa25.38■■□□□ 1.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.37■■□□□ 1.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCC3O15438 1527 aa25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms