RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 JPH4Q96JJ6 628 aa9.02□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 IQGAP2Q13576 1575 aa9.02□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 E9PSI1 815 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF428Q96B54 188 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 KIF3AQ9Y496 699 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa9.01□□□□□ -0.97
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ALMS1-201ENST00000423048 PPP6R1Q9UPN7 881 aa9.01□□□□□ -0.97
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ALMS1-201ENST00000423048 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa8.99□□□□□ -0.97
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ALMS1-201ENST00000423048 KIF14Q15058 1648 aa8.96□□□□□ -0.98
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ALMS1-201ENST00000423048 NSD2O96028 1365 aa8.94□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.94□□□□□ -0.98
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ALMS1-201ENST00000423048 SIN3AQ96ST3 1273 aa8.93□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.93□□□□□ -0.98
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ALMS1-201ENST00000423048 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
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ALMS1-201ENST00000423048 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 KCNH8Q96L42 1107 aa8.91□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa8.91□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 NESP48681 1621 aa8.91□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 C9orf84Q5VXU9 1444 aa8.91□□□□□ -0.98
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ALMS1-201ENST00000423048 ARID3CA6NKF2 412 aa8.9□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 DDX19BQ9UMR2 479 aa8.9□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa8.9□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.9□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 ABCC11Q96J66 1382 aa8.9□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 FAM161AQ3B820 660 aa8.9□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.9□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.89□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 STK31Q9BXU1 1019 aa8.89□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 MCM2P49736 904 aa8.89□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 ARHGAP5Q13017 1502 aa8.88□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 ST18O60284 1047 aa8.88□□□□□ -0.99
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ALMS1-201ENST00000423048 SLC52A1Q9NWF4 448 aa8.88□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 RGL3Q3MIN7 710 aa8.87□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 ATAD2Q6PL18 1390 aa8.87□□□□□ -0.99
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ALMS1-201ENST00000423048 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
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ALMS1-201ENST00000423048 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa8.86□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa8.86□□□□□ -0.99
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ALMS1-201ENST00000423048 REC8O95072 547 aa8.85□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 KIAA2012Q0VF49 1180 aa8.85□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 RUNDC1Q96C34 613 aa8.85□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa8.85□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 GRIN2AQ12879 1464 aa8.85□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 POGZQ7Z3K3 1410 aa8.85□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.85□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
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