RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.12■□□□□ 0.97
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.1■□□□□ 0.97
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PZPP20742 1482 aa21.09■□□□□ 0.97
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIF3BO15066 747 aa21.07■□□□□ 0.96
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.07■□□□□ 0.96
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNRQ92752 1358 aa21.06■□□□□ 0.96
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.04■□□□□ 0.96
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ILDR2Q71H61 639 aa21.04■□□□□ 0.96
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.02■□□□□ 0.96
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.01■□□□□ 0.95
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.01■□□□□ 0.95
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.01■□□□□ 0.95
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21■□□□□ 0.95
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NLRP1Q9C000 1473 aa20.98■□□□□ 0.95
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPY4P0CV99 314 aa20.98■□□□□ 0.95
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPY10P0CW01 314 aa20.98■□□□□ 0.95
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MIA2Q96PC5 1412 aa20.97■□□□□ 0.95
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPS1P31327 1500 aa20.97■□□□□ 0.95
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.96■□□□□ 0.95
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCC3O15438 1527 aa20.95■□□□□ 0.94
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOCS7O14512 581 aa20.94■□□□□ 0.94
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP3K1Q13233 1512 aa20.94■□□□□ 0.94
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.94■□□□□ 0.94
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.94■□□□□ 0.94
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEPDC5O75140 1603 aa20.93■□□□□ 0.94
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.92■□□□□ 0.94
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.92■□□□□ 0.94
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MED14O60244 1454 aa20.91■□□□□ 0.94
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.91■□□□□ 0.94
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.9■□□□□ 0.94
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IQGAP1P46940 1657 aa20.89■□□□□ 0.93
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEP152O94986 1710 aa20.89■□□□□ 0.93
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERVK-7P63135 1459 aa20.88■□□□□ 0.93
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.86■□□□□ 0.93
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.86■□□□□ 0.93
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.85■□□□□ 0.93
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TOM1O60784 492 aa20.83■□□□□ 0.93
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBR1Q8IWV7 1749 aa20.83■□□□□ 0.92
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIP4K2BP78356 416 aa20.81■□□□□ 0.92
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYNMO15061 1565 aa20.8■□□□□ 0.92
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.8■□□□□ 0.92
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSPA1LP34931 641 aa20.8■□□□□ 0.92
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALKQ9UM73 1620 aa20.79■□□□□ 0.92
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERBINQ96RT1 1412 aa20.79■□□□□ 0.92
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.79■□□□□ 0.92
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIF15Q9NS87 1388 aa20.78■□□□□ 0.92
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCC5O15440 1437 aa20.77■□□□□ 0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.76■□□□□ 0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC7Q96NW7 1537 aa20.76■□□□□ 0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLIT1O75093 1534 aa20.74■□□□□ 0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGAP23Q9P227 1491 aa20.73■□□□□ 0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DAPK1P53355 1430 aa20.73■□□□□ 0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIK3C2BO00750 1634 aa20.71■□□□□ 0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.7■□□□□ 0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.7■□□□□ 0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APLP2Q06481 763 aa20.68■□□□□ 0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.67■□□□□ 0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LTKP29376 864 aa20.67■□□□□ 0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KANK1Q14678 1352 aa20.66■□□□□ 0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.65■□□□□ 0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.64■□□□□ 0.89
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM2Q9UHN6 1383 aa20.63■□□□□ 0.89
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.63■□□□□ 0.89
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EID1Q9Y6B2 187 aa20.62■□□□□ 0.89
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.6■□□□□ 0.89
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADGRL2O95490 1459 aa20.59■□□□□ 0.89
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADGRB3O60242 1522 aa20.58■□□□□ 0.89
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.58■□□□□ 0.89
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOS1P29475 1434 aa20.57■□□□□ 0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IDI1Q13907 227 aa20.56■□□□□ 0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TET3O43151 1660 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NWD1Q149M9 1564 aa20.52■□□□□ 0.87
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM94Q12767 1356 aa20.51■□□□□ 0.87
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNA6P17658 529 aa20.49■□□□□ 0.87
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.48■□□□□ 0.87
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.48■□□□□ 0.87
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.48■□□□□ 0.87
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.47■□□□□ 0.87
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
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