RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418601.1

GTPBP1-202, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 810 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-202ENST00000418601 TNRQ92752 1358 aa31.78■■■□□ 2.68
GTPBP1-202ENST00000418601 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
GTPBP1-202ENST00000418601 SYNMO15061 1565 aa31.73■■■□□ 2.67
GTPBP1-202ENST00000418601 DEPDC5O75140 1603 aa31.72■■■□□ 2.67
GTPBP1-202ENST00000418601 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.72■■■□□ 2.67
GTPBP1-202ENST00000418601 IQGAP1P46940 1657 aa31.71■■■□□ 2.67
GTPBP1-202ENST00000418601 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
GTPBP1-202ENST00000418601 PZPP20742 1482 aa31.71■■■□□ 2.67
GTPBP1-202ENST00000418601 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.71■■■□□ 2.67
GTPBP1-202ENST00000418601 ANKLE2Q86XL3 938 aa31.69■■■□□ 2.66
GTPBP1-202ENST00000418601 MED14O60244 1454 aa31.69■■■□□ 2.66
GTPBP1-202ENST00000418601 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.69■■■□□ 2.66
GTPBP1-202ENST00000418601 STRCP1A6NGW2 1772 aa31.68■■■□□ 2.66
GTPBP1-202ENST00000418601 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
GTPBP1-202ENST00000418601 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.67■■■□□ 2.66
GTPBP1-202ENST00000418601 LRRC7Q96NW7 1537 aa31.66■■■□□ 2.66
GTPBP1-202ENST00000418601 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
GTPBP1-202ENST00000418601 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
GTPBP1-202ENST00000418601 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.64■■■□□ 2.66
GTPBP1-202ENST00000418601 NLRP1Q9C000 1473 aa31.63■■■□□ 2.65
GTPBP1-202ENST00000418601 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.62■■■□□ 2.65
GTPBP1-202ENST00000418601 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
GTPBP1-202ENST00000418601 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
GTPBP1-202ENST00000418601 MIA2Q96PC5 1412 aa31.55■■■□□ 2.64
GTPBP1-202ENST00000418601 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.54■■■□□ 2.64
GTPBP1-202ENST00000418601 MBD5Q9P267 1494 aa31.52■■■□□ 2.64
GTPBP1-202ENST00000418601 TIAM1Q13009 1591 aa31.51■■■□□ 2.64
GTPBP1-202ENST00000418601 KIF3BO15066 747 aa31.51■■■□□ 2.63
GTPBP1-202ENST00000418601 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
GTPBP1-202ENST00000418601 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
GTPBP1-202ENST00000418601 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31.48■■■□□ 2.63
GTPBP1-202ENST00000418601 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
GTPBP1-202ENST00000418601 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.43■■■□□ 2.62
GTPBP1-202ENST00000418601 POTEAQ6S8J7 498 aa31.43■■■□□ 2.62
GTPBP1-202ENST00000418601 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
GTPBP1-202ENST00000418601 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.4■■■□□ 2.62
GTPBP1-202ENST00000418601 UBR1Q8IWV7 1749 aa31.35■■■□□ 2.61
GTPBP1-202ENST00000418601 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.34■■■□□ 2.61
GTPBP1-202ENST00000418601 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
GTPBP1-202ENST00000418601 ERVK-7P63135 1459 aa31.32■■■□□ 2.6
GTPBP1-202ENST00000418601 ABCC3O15438 1527 aa31.31■■■□□ 2.6
GTPBP1-202ENST00000418601 FAM135BQ49AJ0 1406 aa31.3■■■□□ 2.6
GTPBP1-202ENST00000418601 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.29■■■□□ 2.6
GTPBP1-202ENST00000418601 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa31.28■■■□□ 2.6
GTPBP1-202ENST00000418601 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.24■■■□□ 2.59
GTPBP1-202ENST00000418601 CEP162Q5TB80 1403 aa31.23■■■□□ 2.59
GTPBP1-202ENST00000418601 NCOA2Q15596 1464 aa31.22■■■□□ 2.59
GTPBP1-202ENST00000418601 ARHGAP23Q9P227 1491 aa31.21■■■□□ 2.59
GTPBP1-202ENST00000418601 SLIT1O75093 1534 aa31.21■■■□□ 2.59
GTPBP1-202ENST00000418601 CEP152O94986 1710 aa31.21■■■□□ 2.59
GTPBP1-202ENST00000418601 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.17■■■□□ 2.58
GTPBP1-202ENST00000418601 MROH1Q8NDA8 1641 aa31.16■■■□□ 2.58
GTPBP1-202ENST00000418601 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
GTPBP1-202ENST00000418601 MAP3K1Q13233 1512 aa31.15■■■□□ 2.58
GTPBP1-202ENST00000418601 LTKP29376 864 aa31.15■■■□□ 2.58
GTPBP1-202ENST00000418601 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.14■■■□□ 2.58
GTPBP1-202ENST00000418601 TMEM94Q12767 1356 aa31.14■■■□□ 2.58
GTPBP1-202ENST00000418601 TXNDC2Q86VQ3 553 aa31.13■■■□□ 2.57
GTPBP1-202ENST00000418601 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.12■■■□□ 2.57
GTPBP1-202ENST00000418601 PHLPP1O60346 1717 aa31.11■■■□□ 2.57
GTPBP1-202ENST00000418601 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
GTPBP1-202ENST00000418601 PIK3C2BO00750 1634 aa31.06■■■□□ 2.56
GTPBP1-202ENST00000418601 MAST1Q9Y2H9 1570 aa31.06■■■□□ 2.56
GTPBP1-202ENST00000418601 EID1Q9Y6B2 187 aa31.06■■■□□ 2.56
GTPBP1-202ENST00000418601 TSPY4P0CV99 314 aa31.05■■■□□ 2.56
GTPBP1-202ENST00000418601 TSPY10P0CW01 314 aa31.05■■■□□ 2.56
GTPBP1-202ENST00000418601 JCADQ9P266 1359 aa31.03■■■□□ 2.56
GTPBP1-202ENST00000418601 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP31.02■■■□□ 2.56
GTPBP1-202ENST00000418601 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
GTPBP1-202ENST00000418601 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
GTPBP1-202ENST00000418601 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.99■■■□□ 2.55
GTPBP1-202ENST00000418601 NWD1Q149M9 1564 aa30.98■■■□□ 2.55
GTPBP1-202ENST00000418601 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
GTPBP1-202ENST00000418601 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
GTPBP1-202ENST00000418601 LRP6O75581 1613 aa30.96■■■□□ 2.55
GTPBP1-202ENST00000418601 KCNA6P17658 529 aa30.96■■■□□ 2.55
GTPBP1-202ENST00000418601 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
GTPBP1-202ENST00000418601 MSH6P52701 1360 aa30.94■■■□□ 2.54
GTPBP1-202ENST00000418601 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.94■■■□□ 2.54
GTPBP1-202ENST00000418601 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.94■■■□□ 2.54
GTPBP1-202ENST00000418601 TRIM52Q96A61 297 aa30.94■■■□□ 2.54
GTPBP1-202ENST00000418601 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
GTPBP1-202ENST00000418601 TET3O43151 1660 aa30.92■■■□□ 2.54
GTPBP1-202ENST00000418601 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.89■■■□□ 2.54
GTPBP1-202ENST00000418601 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.89■■■□□ 2.54
GTPBP1-202ENST00000418601 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.89■■■□□ 2.54
GTPBP1-202ENST00000418601 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
GTPBP1-202ENST00000418601 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
GTPBP1-202ENST00000418601 SLAIN2Q9P270 581 aa30.86■■■□□ 2.53
GTPBP1-202ENST00000418601 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa30.84■■■□□ 2.53
GTPBP1-202ENST00000418601 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.83■■■□□ 2.53
GTPBP1-202ENST00000418601 SHPRHQ149N8 1683 aa30.82■■■□□ 2.52
GTPBP1-202ENST00000418601 ADGRB3O60242 1522 aa30.79■■■□□ 2.52
GTPBP1-202ENST00000418601 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.52
GTPBP1-202ENST00000418601 ERBINQ96RT1 1412 aa30.76■■■□□ 2.51
GTPBP1-202ENST00000418601 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
GTPBP1-202ENST00000418601 RXRBP28702 533 aa30.74■■■□□ 2.51
GTPBP1-202ENST00000418601 KIF15Q9NS87 1388 aa30.73■■■□□ 2.51
GTPBP1-202ENST00000418601 BCANQ96GW7 911 aa30.72■■■□□ 2.51
GTPBP1-202ENST00000418601 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
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