RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412596.5

UBAP2L-205, Transcript of ubiquitin associated protein 2 like, human

TSL 5

Gene UBAP2L, Length 980 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBAP2L-205	ENST00000412596	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	40.91	■■■■■ 4.14
UBAP2L-205	ENST00000412596	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		40.91	■■■■■ 4.14
UBAP2L-205	ENST00000412596	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		40.9	■■■■■ 4.14
UBAP2L-205	ENST00000412596	TSPY4	P0CV99	314 aa		40.86	■■■■■ 4.13
UBAP2L-205	ENST00000412596	TSPY10	P0CW01	314 aa		40.86	■■■■■ 4.13
UBAP2L-205	ENST00000412596	PZP	P20742	1482 aa		40.84	■■■■■ 4.13
UBAP2L-205	ENST00000412596	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	40.83	■■■■■ 4.13
UBAP2L-205	ENST00000412596	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	40.83	■■■■■ 4.13
UBAP2L-205	ENST00000412596	TNR	Q92752	1358 aa		40.83	■■■■■ 4.13
UBAP2L-205	ENST00000412596	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		40.82	■■■■■ 4.13
UBAP2L-205	ENST00000412596	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	40.8	■■■■■ 4.12
UBAP2L-205	ENST00000412596	MAP3K1	Q13233	1512 aa		40.79	■■■■■ 4.12
UBAP2L-205	ENST00000412596	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	40.76	■■■■■ 4.12
UBAP2L-205	ENST00000412596	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		40.75	■■■■■ 4.11
UBAP2L-205	ENST00000412596	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		40.71	■■■■■ 4.11
UBAP2L-205	ENST00000412596	MIA2	Q96PC5	1412 aa		40.7	■■■■■ 4.11
UBAP2L-205	ENST00000412596	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	40.7	■■■■■ 4.11
UBAP2L-205	ENST00000412596	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	40.67	■■■■■ 4.1
UBAP2L-205	ENST00000412596	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		40.66	■■■■■ 4.1
UBAP2L-205	ENST00000412596	NLRP1	Q9C000	1473 aa		40.64	■■■■■ 4.1
UBAP2L-205	ENST00000412596	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	40.64	■■■■■ 4.1
UBAP2L-205	ENST00000412596	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		40.63	■■■■■ 4.09
UBAP2L-205	ENST00000412596	ABCC3	O15438	1527 aa		40.62	■■■■■ 4.09
UBAP2L-205	ENST00000412596	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	40.62	■■■■■ 4.09
UBAP2L-205	ENST00000412596	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		40.59	■■■■■ 4.09
UBAP2L-205	ENST00000412596	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	40.58	■■■■■ 4.09	1e-6	■■■□□ 19.2
UBAP2L-205	ENST00000412596	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		40.57	■■■■■ 4.09
UBAP2L-205	ENST00000412596	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	40.56	■■■■■ 4.08
UBAP2L-205	ENST00000412596	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		40.54	■■■■■ 4.08
UBAP2L-205	ENST00000412596	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		40.53	■■■■■ 4.08
UBAP2L-205	ENST00000412596	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		40.52	■■■■■ 4.08
UBAP2L-205	ENST00000412596	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		40.52	■■■■■ 4.08
UBAP2L-205	ENST00000412596	CPS1	P31327	1500 aa		40.48	■■■■■ 4.07
UBAP2L-205	ENST00000412596	ERVK-7	P63135	1459 aa		40.48	■■■■■ 4.07
UBAP2L-205	ENST00000412596	APLP2	Q06481	763 aa		40.47	■■■■■ 4.07
UBAP2L-205	ENST00000412596	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		40.46	■■■■■ 4.07
UBAP2L-205	ENST00000412596	DEPDC5	O75140	1603 aa		40.46	■■■■■ 4.07
UBAP2L-205	ENST00000412596	CEP152	O94986	1710 aa		40.45	■■■■■ 4.07
UBAP2L-205	ENST00000412596	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		40.45	■■■■■ 4.07
UBAP2L-205	ENST00000412596	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	40.44	■■■■■ 4.06
UBAP2L-205	ENST00000412596	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		40.44	■■■■■ 4.06
UBAP2L-205	ENST00000412596	KIF15	Q9NS87	1388 aa		40.44	■■■■■ 4.06
UBAP2L-205	ENST00000412596	MED14	O60244	1454 aa		40.44	■■■■■ 4.06
UBAP2L-205	ENST00000412596	ABCC5	O15440	1437 aa		40.42	■■■■■ 4.06
UBAP2L-205	ENST00000412596	ILDR2	Q71H61	639 aa		40.42	■■■■■ 4.06
UBAP2L-205	ENST00000412596	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		40.4	■■■■■ 4.06
UBAP2L-205	ENST00000412596	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		40.39	■■■■■ 4.06
UBAP2L-205	ENST00000412596	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	40.37	■■■■■ 4.05
UBAP2L-205	ENST00000412596	IQGAP1	P46940	1657 aa		40.36	■■■■■ 4.05
UBAP2L-205	ENST00000412596	DAPK1	P53355	1430 aa		40.34	■■■■■ 4.05
UBAP2L-205	ENST00000412596	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		40.34	■■■■■ 4.05
UBAP2L-205	ENST00000412596	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		40.33	■■■■■ 4.05
UBAP2L-205	ENST00000412596	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	40.3	■■■■■ 4.04
UBAP2L-205	ENST00000412596	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		40.29	■■■■■ 4.04
UBAP2L-205	ENST00000412596	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		40.28	■■■■■ 4.04
UBAP2L-205	ENST00000412596	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	40.28	■■■■■ 4.04
UBAP2L-205	ENST00000412596	TOM1	O60784	492 aa		40.27	■■■■■ 4.04
UBAP2L-205	ENST00000412596	PIP4K2B	P78356	416 aa		40.25	■■■■■ 4.03
UBAP2L-205	ENST00000412596	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	40.22	■■■■■ 4.03	5e-9	■■■■□ 20.9
UBAP2L-205	ENST00000412596	SOCS7	O14512	581 aa		40.2	■■■■■ 4.03
UBAP2L-205	ENST00000412596	KANK1	Q14678	1352 aa		40.2	■■■■■ 4.03
UBAP2L-205	ENST00000412596	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		40.2	■■■■■ 4.03
UBAP2L-205	ENST00000412596	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	40.19	■■■■■ 4.03
UBAP2L-205	ENST00000412596	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		40.17	■■■■■ 4.02
UBAP2L-205	ENST00000412596	HSPA1L	P34931	641 aa		40.16	■■■■■ 4.02
UBAP2L-205	ENST00000412596	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		40.15	■■■■■ 4.02
UBAP2L-205	ENST00000412596	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		40.15	■■■■■ 4.02
UBAP2L-205	ENST00000412596	SLIT1	O75093	1534 aa		40.15	■■■■■ 4.02
UBAP2L-205	ENST00000412596	SYNM	O15061	1565 aa		40.13	■■■■■ 4.01
UBAP2L-205	ENST00000412596	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		40.11	■■■■■ 4.01
UBAP2L-205	ENST00000412596	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		40.11	■■■■■ 4.01
UBAP2L-205	ENST00000412596	PIK3C2B	O00750	1634 aa		40.09	■■■■■ 4.01
UBAP2L-205	ENST00000412596	ALK	Q9UM73	1620 aa		40.09	■■■■■ 4.01
UBAP2L-205	ENST00000412596	LTK	P29376	864 aa		40.09	■■■■■ 4.01
UBAP2L-205	ENST00000412596	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		40.09	■■■■■ 4.01
UBAP2L-205	ENST00000412596	EID1	Q9Y6B2	187 aa		40.05	■■■■■ 4
UBAP2L-205	ENST00000412596	ADGRL2	O95490	1459 aa		40.04	■■■■■ 4
UBAP2L-205	ENST00000412596	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		40.02	■■■■■ 4
UBAP2L-205	ENST00000412596	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		40.01	■■■■■ 4
UBAP2L-205	ENST00000412596	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	39.99	■■■■□ 3.99
UBAP2L-205	ENST00000412596	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		39.99	■■■■□ 3.99
UBAP2L-205	ENST00000412596	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	39.98	■■■■□ 3.99
UBAP2L-205	ENST00000412596	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	39.97	■■■■□ 3.99
UBAP2L-205	ENST00000412596	IDI1	Q13907	227 aa		39.95	■■■■□ 3.99
UBAP2L-205	ENST00000412596	NOS1	P29475	1434 aa		39.93	■■■■□ 3.98
UBAP2L-205	ENST00000412596	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		39.9	■■■■□ 3.98
UBAP2L-205	ENST00000412596	ADGRB3	O60242	1522 aa		39.87	■■■■□ 3.97
UBAP2L-205	ENST00000412596	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	39.82	■■■■□ 3.97
UBAP2L-205	ENST00000412596	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	39.82	■■■■□ 3.97
UBAP2L-205	ENST00000412596	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	39.82	■■■■□ 3.97
UBAP2L-205	ENST00000412596	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		39.81	■■■■□ 3.96
UBAP2L-205	ENST00000412596	TET3	O43151	1660 aa		39.77	■■■■□ 3.96
UBAP2L-205	ENST00000412596	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		39.74	■■■■□ 3.95
UBAP2L-205	ENST00000412596	KCNA6	P17658	529 aa		39.72	■■■■□ 3.95
UBAP2L-205	ENST00000412596	UNC13B	O14795	1591 aa		39.72	■■■■□ 3.95
UBAP2L-205	ENST00000412596	TMEM94	Q12767	1356 aa		39.72	■■■■□ 3.95
UBAP2L-205	ENST00000412596	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	39.7	■■■■□ 3.95
UBAP2L-205	ENST00000412596	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		39.69	■■■■□ 3.94
UBAP2L-205	ENST00000412596	NWD1	Q149M9	1564 aa		39.65	■■■■□ 3.94
UBAP2L-205	ENST00000412596	BCAN	Q96GW7	911 aa		39.65	■■■■□ 3.94

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