RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412307.3

C10orf55-202, Transcript of chromosome 10 open reading frame 55, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene C10orf55, Length 2,360 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55-202ENST00000412307 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
C10orf55-202ENST00000412307 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
C10orf55-202ENST00000412307 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.7■■■□□ 2.34
C10orf55-202ENST00000412307 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.69■■■□□ 2.34
C10orf55-202ENST00000412307 PLA2R1Q13018 1463 aa29.68■■■□□ 2.34
C10orf55-202ENST00000412307 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.67■■■□□ 2.34
C10orf55-202ENST00000412307 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.67■■■□□ 2.34
C10orf55-202ENST00000412307 RGL3Q3MIN7 710 aa29.66■■■□□ 2.34
C10orf55-202ENST00000412307 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.65■■■□□ 2.34
C10orf55-202ENST00000412307 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.65■■■□□ 2.34
C10orf55-202ENST00000412307 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
C10orf55-202ENST00000412307 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.63■■■□□ 2.33
C10orf55-202ENST00000412307 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.63■■■□□ 2.33
C10orf55-202ENST00000412307 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.63■■■□□ 2.33
C10orf55-202ENST00000412307 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.61■■■□□ 2.33
C10orf55-202ENST00000412307 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.59■■■□□ 2.33
C10orf55-202ENST00000412307 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.56■■■□□ 2.32
C10orf55-202ENST00000412307 NEO1Q92859 1461 aa29.55■■■□□ 2.32
C10orf55-202ENST00000412307 KDM5CP41229 1560 aa29.53■■■□□ 2.32
C10orf55-202ENST00000412307 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
C10orf55-202ENST00000412307 A2MP01023 1474 aa29.51■■■□□ 2.32
C10orf55-202ENST00000412307 GGT6Q6P531 493 aa29.5■■■□□ 2.31
C10orf55-202ENST00000412307 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.5■■■□□ 2.31
C10orf55-202ENST00000412307 DEPDC5O75140 1603 aa29.5■■■□□ 2.31
C10orf55-202ENST00000412307 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.5■■■□□ 2.31
C10orf55-202ENST00000412307 E9PCH4 1651 aa29.5■■■□□ 2.31
C10orf55-202ENST00000412307 KANK1Q14678 1352 aa29.49■■■□□ 2.31
C10orf55-202ENST00000412307 DIP2BQ9P265 1576 aa29.48■■■□□ 2.31
C10orf55-202ENST00000412307 TSPOAP1O95153 1857 aa29.48■■■□□ 2.31
C10orf55-202ENST00000412307 GLI2P10070 1586 aa29.48■■■□□ 2.31
C10orf55-202ENST00000412307 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.47■■■□□ 2.31
C10orf55-202ENST00000412307 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.46■■■□□ 2.31
C10orf55-202ENST00000412307 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.44■■■□□ 2.3
C10orf55-202ENST00000412307 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.43■■■□□ 2.3
C10orf55-202ENST00000412307 ABCA6Q8N139 1617 aa29.43■■■□□ 2.3
C10orf55-202ENST00000412307 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.43■■■□□ 2.3
C10orf55-202ENST00000412307 ATP10AO60312 1499 aa29.43■■■□□ 2.3
C10orf55-202ENST00000412307 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
C10orf55-202ENST00000412307 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.41■■■□□ 2.3
C10orf55-202ENST00000412307 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.4■■■□□ 2.3
C10orf55-202ENST00000412307 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.4■■■□□ 2.3
C10orf55-202ENST00000412307 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
C10orf55-202ENST00000412307 USP47Q96K76 1375 aa29.38■■■□□ 2.29
C10orf55-202ENST00000412307 RICTORQ6R327 1708 aa29.38■■■□□ 2.29
C10orf55-202ENST00000412307 TET3O43151 1660 aa29.37■■■□□ 2.29
C10orf55-202ENST00000412307 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.36■■■□□ 2.29
C10orf55-202ENST00000412307 PTPRTO14522 1441 aa29.34■■■□□ 2.29
C10orf55-202ENST00000412307 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.33■■■□□ 2.29
C10orf55-202ENST00000412307 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.32■■■□□ 2.28
C10orf55-202ENST00000412307 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
C10orf55-202ENST00000412307 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.32■■■□□ 2.28
C10orf55-202ENST00000412307 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.32■■■□□ 2.28
C10orf55-202ENST00000412307 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.31■■■□□ 2.28
C10orf55-202ENST00000412307 CCDC7Q96M83 1385 aa29.31■■■□□ 2.28
C10orf55-202ENST00000412307 TRPM2O94759 1503 aa29.31■■■□□ 2.28
C10orf55-202ENST00000412307 CEP152O94986 1710 aa29.31■■■□□ 2.28
C10orf55-202ENST00000412307 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
C10orf55-202ENST00000412307 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.3■■■□□ 2.28
C10orf55-202ENST00000412307 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.3■■■□□ 2.28
C10orf55-202ENST00000412307 CLTCL1P53675 1640 aa29.29■■■□□ 2.28
C10orf55-202ENST00000412307 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.29■■■□□ 2.28
C10orf55-202ENST00000412307 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
C10orf55-202ENST00000412307 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
C10orf55-202ENST00000412307 ANP32CO43423 234 aa29.27■■■□□ 2.28
C10orf55-202ENST00000412307 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.27■■■□□ 2.28
C10orf55-202ENST00000412307 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.26■■■□□ 2.27
C10orf55-202ENST00000412307 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.23■■■□□ 2.27
C10orf55-202ENST00000412307 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
C10orf55-202ENST00000412307 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.22■■■□□ 2.27
C10orf55-202ENST00000412307 NPATQ14207 1427 aa29.21■■■□□ 2.27
C10orf55-202ENST00000412307 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.2■■■□□ 2.27
C10orf55-202ENST00000412307 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.2■■■□□ 2.27
C10orf55-202ENST00000412307 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
C10orf55-202ENST00000412307 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
C10orf55-202ENST00000412307 ABCC3O15438 1527 aa29.17■■■□□ 2.26
C10orf55-202ENST00000412307 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.13■■■□□ 2.25
C10orf55-202ENST00000412307 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.12■■■□□ 2.25
C10orf55-202ENST00000412307 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
C10orf55-202ENST00000412307 MLECQ14165 292 aa29.09■■■□□ 2.25
C10orf55-202ENST00000412307 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.08■■■□□ 2.25
C10orf55-202ENST00000412307 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.08■■■□□ 2.25
C10orf55-202ENST00000412307 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.06■■■□□ 2.24
C10orf55-202ENST00000412307 MADDQ8WXG6 1647 aa29.05■■■□□ 2.24
C10orf55-202ENST00000412307 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
C10orf55-202ENST00000412307 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.05■■■□□ 2.24
C10orf55-202ENST00000412307 MROH2AA6NES4 1674 aa29.03■■■□□ 2.24
C10orf55-202ENST00000412307 KIF1BO60333 1816 aa29.03■■■□□ 2.24
C10orf55-202ENST00000412307 CCER2I3L3R5 266 aa29.03■■■□□ 2.24
C10orf55-202ENST00000412307 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.03■■■□□ 2.24
C10orf55-202ENST00000412307 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
C10orf55-202ENST00000412307 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
C10orf55-202ENST00000412307 TESK2Q96S53 571 aa28.99■■■□□ 2.23
C10orf55-202ENST00000412307 NOS1P29475 1434 aa28.98■■■□□ 2.23
C10orf55-202ENST00000412307 IDI1Q13907 227 aa28.98■■■□□ 2.23
C10orf55-202ENST00000412307 CCDC184Q52MB2 194 aa28.97■■■□□ 2.23
C10orf55-202ENST00000412307 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
C10orf55-202ENST00000412307 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
C10orf55-202ENST00000412307 STAC3Q96MF2 364 aa28.96■■■□□ 2.23
C10orf55-202ENST00000412307 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
C10orf55-202ENST00000412307 SYNMO15061 1565 aa28.95■■■□□ 2.22
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