RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409025.5

USP39-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP39, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-202ENST00000409025 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.77■■□□□ 1.88
USP39-202ENST00000409025 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.77■■□□□ 1.88
USP39-202ENST00000409025 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.77■■□□□ 1.88
USP39-202ENST00000409025 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
USP39-202ENST00000409025 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
USP39-202ENST00000409025 KDM5CP41229 1560 aa26.75■■□□□ 1.87
USP39-202ENST00000409025 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.74■■□□□ 1.87
USP39-202ENST00000409025 GLI2P10070 1586 aa26.73■■□□□ 1.87
USP39-202ENST00000409025 PLA2R1Q13018 1463 aa26.73■■□□□ 1.87
USP39-202ENST00000409025 ATP10AO60312 1499 aa26.72■■□□□ 1.87
USP39-202ENST00000409025 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.72■■□□□ 1.87
USP39-202ENST00000409025 KANK1Q14678 1352 aa26.71■■□□□ 1.87
USP39-202ENST00000409025 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.7■■□□□ 1.87
USP39-202ENST00000409025 KIF3BO15066 747 aa26.69■■□□□ 1.86
USP39-202ENST00000409025 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.69■■□□□ 1.86
USP39-202ENST00000409025 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
USP39-202ENST00000409025 E9PCH4 1651 aa26.67■■□□□ 1.86
USP39-202ENST00000409025 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.66■■□□□ 1.86
USP39-202ENST00000409025 TET3O43151 1660 aa26.66■■□□□ 1.86
USP39-202ENST00000409025 A2MP01023 1474 aa26.66■■□□□ 1.86
USP39-202ENST00000409025 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
USP39-202ENST00000409025 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
USP39-202ENST00000409025 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.64■■□□□ 1.86
USP39-202ENST00000409025 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.62■■□□□ 1.85
USP39-202ENST00000409025 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.62■■□□□ 1.85
USP39-202ENST00000409025 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.62■■□□□ 1.85
USP39-202ENST00000409025 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.61■■□□□ 1.85
USP39-202ENST00000409025 DIP2BQ9P265 1576 aa26.61■■□□□ 1.85
USP39-202ENST00000409025 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.59■■□□□ 1.85
USP39-202ENST00000409025 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
USP39-202ENST00000409025 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.58■■□□□ 1.85
USP39-202ENST00000409025 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.58■■□□□ 1.85
USP39-202ENST00000409025 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
USP39-202ENST00000409025 TRPM2O94759 1503 aa26.57■■□□□ 1.84
USP39-202ENST00000409025 RAPGEF3O95398 923 aa26.57■■□□□ 1.84
USP39-202ENST00000409025 ABCA6Q8N139 1617 aa26.57■■□□□ 1.84
USP39-202ENST00000409025 RICTORQ6R327 1708 aa26.56■■□□□ 1.84
USP39-202ENST00000409025 PTPRTO14522 1441 aa26.56■■□□□ 1.84
USP39-202ENST00000409025 RGL3Q3MIN7 710 aa26.56■■□□□ 1.84
USP39-202ENST00000409025 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.56■■□□□ 1.84
USP39-202ENST00000409025 USP47Q96K76 1375 aa26.54■■□□□ 1.84
USP39-202ENST00000409025 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.54■■□□□ 1.84
USP39-202ENST00000409025 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.53■■□□□ 1.84
USP39-202ENST00000409025 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.52■■□□□ 1.84
USP39-202ENST00000409025 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.84
USP39-202ENST00000409025 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.51■■□□□ 1.83
USP39-202ENST00000409025 ANP32CO43423 234 aa26.51■■□□□ 1.83
USP39-202ENST00000409025 CCDC7Q96M83 1385 aa26.51■■□□□ 1.83
USP39-202ENST00000409025 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.51■■□□□ 1.83
USP39-202ENST00000409025 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.5■■□□□ 1.83
USP39-202ENST00000409025 CEP152O94986 1710 aa26.49■■□□□ 1.83
USP39-202ENST00000409025 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.49■■□□□ 1.83
USP39-202ENST00000409025 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.48■■□□□ 1.83
USP39-202ENST00000409025 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
USP39-202ENST00000409025 CLTCL1P53675 1640 aa26.47■■□□□ 1.83
USP39-202ENST00000409025 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
USP39-202ENST00000409025 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
USP39-202ENST00000409025 TSPOAP1O95153 1857 aa26.46■■□□□ 1.83
USP39-202ENST00000409025 GGT6Q6P531 493 aa26.43■■□□□ 1.82
USP39-202ENST00000409025 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.42■■□□□ 1.82
USP39-202ENST00000409025 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.42■■□□□ 1.82
USP39-202ENST00000409025 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.41■■□□□ 1.82
USP39-202ENST00000409025 CCER2I3L3R5 266 aa26.39■■□□□ 1.82
USP39-202ENST00000409025 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.39■■□□□ 1.82
USP39-202ENST00000409025 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.39■■□□□ 1.82
USP39-202ENST00000409025 STAC3Q96MF2 364 aa26.39■■□□□ 1.81
USP39-202ENST00000409025 LAMC1P11047 1609 aa26.38■■□□□ 1.81
USP39-202ENST00000409025 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.38■■□□□ 1.81
USP39-202ENST00000409025 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
USP39-202ENST00000409025 ABCC3O15438 1527 aa26.36■■□□□ 1.81
USP39-202ENST00000409025 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.36■■□□□ 1.81
USP39-202ENST00000409025 KIF1BO60333 1816 aa26.34■■□□□ 1.81
USP39-202ENST00000409025 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.34■■□□□ 1.81
USP39-202ENST00000409025 NPATQ14207 1427 aa26.33■■□□□ 1.81
USP39-202ENST00000409025 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.33■■□□□ 1.81
USP39-202ENST00000409025 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.33■■□□□ 1.81
USP39-202ENST00000409025 MADDQ8WXG6 1647 aa26.32■■□□□ 1.8
USP39-202ENST00000409025 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.32■■□□□ 1.8
USP39-202ENST00000409025 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.32■■□□□ 1.8
USP39-202ENST00000409025 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
USP39-202ENST00000409025 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
USP39-202ENST00000409025 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.24■■□□□ 1.79
USP39-202ENST00000409025 REREQ9P2R6 1566 aa26.23■■□□□ 1.79
USP39-202ENST00000409025 MROH2AA6NES4 1674 aa26.23■■□□□ 1.79
USP39-202ENST00000409025 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.22■■□□□ 1.79
USP39-202ENST00000409025 MYOM2P54296 1465 aa26.22■■□□□ 1.79
USP39-202ENST00000409025 ADGRB3O60242 1522 aa26.21■■□□□ 1.79
USP39-202ENST00000409025 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
USP39-202ENST00000409025 IFT172Q9UG01 1749 aa26.21■■□□□ 1.79
USP39-202ENST00000409025 NOS1P29475 1434 aa26.21■■□□□ 1.79
USP39-202ENST00000409025 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.2■■□□□ 1.78
USP39-202ENST00000409025 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.19■■□□□ 1.78
USP39-202ENST00000409025 AGLP35573 1532 aa26.17■■□□□ 1.78
USP39-202ENST00000409025 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
USP39-202ENST00000409025 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
USP39-202ENST00000409025 IQGAP1P46940 1657 aa26.15■■□□□ 1.78
USP39-202ENST00000409025 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
USP39-202ENST00000409025 PIK3C2BO00750 1634 aa26.13■■□□□ 1.77
USP39-202ENST00000409025 SYNMO15061 1565 aa26.13■■□□□ 1.77
USP39-202ENST00000409025 TESK2Q96S53 571 aa26.12■■□□□ 1.77
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