RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406525.6

LARP4B-202, Transcript of La ribonucleoprotein domain family member 4B, humanhuman

TSL 5

Gene LARP4B, Length 681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4B-202ENST00000406525 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.74■■■■■ 4.27
LARP4B-202ENST00000406525 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.74■■■■■ 4.27
LARP4B-202ENST00000406525 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.74■■■■■ 4.27
LARP4B-202ENST00000406525 FBXO41Q8TF61 875 aa41.74■■■■■ 4.27
LARP4B-202ENST00000406525 PTPRKQ15262 1439 aa41.74■■■■■ 4.27
LARP4B-202ENST00000406525 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
LARP4B-202ENST00000406525 KIF15Q9NS87 1388 aa41.72■■■■■ 4.27
LARP4B-202ENST00000406525 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
LARP4B-202ENST00000406525 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.66■■■■■ 4.26
LARP4B-202ENST00000406525 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.66■■■■■ 4.26
LARP4B-202ENST00000406525 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
LARP4B-202ENST00000406525 ERBINQ96RT1 1412 aa41.65■■■■■ 4.26
LARP4B-202ENST00000406525 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.62■■■■■ 4.25
LARP4B-202ENST00000406525 PZPP20742 1482 aa41.61■■■■■ 4.25
LARP4B-202ENST00000406525 NCOA1Q15788 1441 aa41.59■■■■■ 4.25
LARP4B-202ENST00000406525 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.57■■■■■ 4.25
LARP4B-202ENST00000406525 ADGRL2O95490 1459 aa41.55■■■■■ 4.24
LARP4B-202ENST00000406525 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
LARP4B-202ENST00000406525 ABCC3O15438 1527 aa41.53■■■■■ 4.24
LARP4B-202ENST00000406525 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.51■■■■■ 4.24
LARP4B-202ENST00000406525 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.51■■■■■ 4.23
LARP4B-202ENST00000406525 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
LARP4B-202ENST00000406525 TNRQ92752 1358 aa41.5■■■■■ 4.23
LARP4B-202ENST00000406525 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
LARP4B-202ENST00000406525 STRCQ7RTU9 1775 aa41.48■■■■■ 4.23
LARP4B-202ENST00000406525 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.46■■■■■ 4.23
LARP4B-202ENST00000406525 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.46■■■■■ 4.23
LARP4B-202ENST00000406525 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.46■■■■■ 4.232e-7■■■□□ 14.9
LARP4B-202ENST00000406525 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.44■■■■■ 4.22
LARP4B-202ENST00000406525 PTPRTO14522 1441 aa41.44■■■■■ 4.22
LARP4B-202ENST00000406525 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.41■■■■■ 4.22
LARP4B-202ENST00000406525 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
LARP4B-202ENST00000406525 KANK1Q14678 1352 aa41.4■■■■■ 4.22
LARP4B-202ENST00000406525 PLA2R1Q13018 1463 aa41.4■■■■■ 4.22
LARP4B-202ENST00000406525 DEPDC5O75140 1603 aa41.39■■■■■ 4.22
LARP4B-202ENST00000406525 NLRP1Q9C000 1473 aa41.37■■■■■ 4.21
LARP4B-202ENST00000406525 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.36■■■■■ 4.21
LARP4B-202ENST00000406525 PKD2Q13563 968 aa41.36■■■■■ 4.21
LARP4B-202ENST00000406525 ROCK1Q13464 1354 aa41.35■■■■■ 4.21
LARP4B-202ENST00000406525 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.34■■■■■ 4.21
LARP4B-202ENST00000406525 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.33■■■■■ 4.21
LARP4B-202ENST00000406525 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.33■■■■■ 4.21
LARP4B-202ENST00000406525 CEP152O94986 1710 aa41.3■■■■■ 4.2
LARP4B-202ENST00000406525 ERVK-7P63135 1459 aa41.29■■■■■ 4.2
LARP4B-202ENST00000406525 CERKQ8TCT0 537 aa41.29■■■■■ 4.2
LARP4B-202ENST00000406525 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.27■■■■■ 4.2
LARP4B-202ENST00000406525 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.26■■■■■ 4.2
LARP4B-202ENST00000406525 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
LARP4B-202ENST00000406525 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.25■■■■■ 4.19
LARP4B-202ENST00000406525 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
LARP4B-202ENST00000406525 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.19■■■■■ 4.18
LARP4B-202ENST00000406525 ITGAEP38570 1179 aa41.14■■■■■ 4.18
LARP4B-202ENST00000406525 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.12■■■■■ 4.17
LARP4B-202ENST00000406525 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.08■■■■■ 4.17
LARP4B-202ENST00000406525 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
LARP4B-202ENST00000406525 UNC13BO14795 1591 aa41.03■■■■■ 4.16
LARP4B-202ENST00000406525 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
LARP4B-202ENST00000406525 NOS1P29475 1434 aa41■■■■■ 4.15
LARP4B-202ENST00000406525 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.99■■■■■ 4.15
LARP4B-202ENST00000406525 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.98■■■■■ 4.15
LARP4B-202ENST00000406525 MED14O60244 1454 aa40.98■■■■■ 4.15
LARP4B-202ENST00000406525 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.96■■■■■ 4.15
LARP4B-202ENST00000406525 TET3O43151 1660 aa40.94■■■■■ 4.15
LARP4B-202ENST00000406525 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.94■■■■■ 4.14
LARP4B-202ENST00000406525 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.94■■■■■ 4.14
LARP4B-202ENST00000406525 IDI1Q13907 227 aa40.92■■■■■ 4.14
LARP4B-202ENST00000406525 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.92■■■■■ 4.14
LARP4B-202ENST00000406525 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
LARP4B-202ENST00000406525 NUP155O75694 1391 aa40.9■■■■■ 4.14
LARP4B-202ENST00000406525 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.9■■■■■ 4.14
LARP4B-202ENST00000406525 SLIT1O75093 1534 aa40.88■■■■■ 4.14
LARP4B-202ENST00000406525 SYNMO15061 1565 aa40.88■■■■■ 4.13
LARP4B-202ENST00000406525 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.88■■■■■ 4.13
LARP4B-202ENST00000406525 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.88■■■■■ 4.13
LARP4B-202ENST00000406525 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.87■■■■■ 4.13
LARP4B-202ENST00000406525 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
LARP4B-202ENST00000406525 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.86■■■■■ 4.13
LARP4B-202ENST00000406525 PIK3C2BO00750 1634 aa40.85■■■■■ 4.13
LARP4B-202ENST00000406525 EID1Q9Y6B2 187 aa40.83■■■■■ 4.13
LARP4B-202ENST00000406525 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
LARP4B-202ENST00000406525 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.82■■■■■ 4.12
LARP4B-202ENST00000406525 NAIPQ13075 1403 aa40.82■■■■■ 4.12
LARP4B-202ENST00000406525 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.8■■■■■ 4.12
LARP4B-202ENST00000406525 LTKP29376 864 aa40.77■■■■■ 4.12
LARP4B-202ENST00000406525 HFM1A2PYH4 1435 aa40.76■■■■■ 4.12
LARP4B-202ENST00000406525 IQGAP1P46940 1657 aa40.76■■■■■ 4.12
LARP4B-202ENST00000406525 ADGRB3O60242 1522 aa40.73■■■■■ 4.11
LARP4B-202ENST00000406525 E9PCH4 1651 aa40.72■■■■■ 4.11
LARP4B-202ENST00000406525 CPS1P31327 1500 aa40.71■■■■■ 4.11
LARP4B-202ENST00000406525 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
LARP4B-202ENST00000406525 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.56■■■■■ 4.08
LARP4B-202ENST00000406525 ZFYVE9O95405 1425 aa40.53■■■■■ 4.08
LARP4B-202ENST00000406525 TRIM52Q96A61 297 aa40.52■■■■■ 4.08
LARP4B-202ENST00000406525 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.51■■■■■ 4.08
LARP4B-202ENST00000406525 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.5■■■■■ 4.07
LARP4B-202ENST00000406525 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.5■■■■■ 4.07
LARP4B-202ENST00000406525 UBAP1LF5GYI3 381 aa40.48■■■■■ 4.07
LARP4B-202ENST00000406525 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.47■■■■■ 4.07
LARP4B-202ENST00000406525 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
LARP4B-202ENST00000406525 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa40.45■■■■■ 4.07
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