RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401088.8

SZRD1-201, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-201ENST00000401088 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 TBC1D2Q9BYX2 928 aa15.59■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 MIA2Q96PC5 1412 aa15.59■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SZRD1-201ENST00000401088 FYCO1Q9BQS8 1478 aa15.58■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 GOLGA6L22H0YM25 854 aa15.57■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 COG6Q9Y2V7 657 aa15.57■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 GBP4Q96PP9 640 aa15.56■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 ADAMTS8Q9UP79 889 aa15.56■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.56■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 CUX1P39880 1505 aa15.56■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.56■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 ZBTB7CA1YPR0 619 aa15.56■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 RGL3Q3MIN7 710 aa15.55■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 MAP7D2Q96T17 732 aa15.54■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 CCDC146Q8IYE0 955 aa15.54■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa15.54■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 FSD2A1L4K1 749 aa15.53■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 BCAR3O75815 825 aa15.53■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 PRDM10Q9NQV6 1147 aa15.53■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 FOXD4L1Q9NU39 408 aa15.53■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 IGHDP01880 384 aa15.52■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 KNSTRNQ9Y448 316 aa15.52■□□□□ 0.08
SZRD1-201ENST00000401088 PANK3Q9H999 370 aa15.51■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 NASPP49321 788 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 CGNL1Q0VF96 1302 aa15.5■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 NEUROD2Q15784 382 aa15.5■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 CLUAP1Q96AJ1 413 aa15.5■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 PANK1Q8TE04 598 aa15.5■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.5■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 ZSCAN30Q86W11 494 aa15.5■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 C22orf23Q9BZE7 217 aa15.5■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 ERBB4Q15303 1308 aa15.49■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.49■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.49■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.49■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.49■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 DUSP27Q5VZP5 1158 aa15.49■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa15.49■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 PTMAP06454 111 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 CCDC173Q0VFZ6 552 aa15.48■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 ANTXR1Q9H6X2 564 aa15.47■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 TBC1D32Q96NH3 1257 aa15.47■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 UQCRHLA0A096LP55 91 aa15.47■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 UQCRHP07919 91 aa15.47■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SZRD1-201ENST00000401088 APAF1O14727 1248 aa15.45■□□□□ 0.06
SZRD1-201ENST00000401088 AAMPQ13685 434 aa15.45■□□□□ 0.06
SZRD1-201ENST00000401088 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SZRD1-201ENST00000401088 SLC24A1O60721 1099 aa15.45■□□□□ 0.06
SZRD1-201ENST00000401088 USP19O94966 1318 aa15.45■□□□□ 0.06
SZRD1-201ENST00000401088 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SZRD1-201ENST00000401088 PDE4CQ08493 712 aa15.44■□□□□ 0.06
SZRD1-201ENST00000401088 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa15.44■□□□□ 0.06
SZRD1-201ENST00000401088 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.43■□□□□ 0.06
SZRD1-201ENST00000401088 PTMSP20962 102 aa15.43■□□□□ 0.06
SZRD1-201ENST00000401088 TMF1P82094 1093 aa15.43■□□□□ 0.06
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
SZRD1-201ENST00000401088 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SZRD1-201ENST00000401088 BCL2L13Q9BXK5 485 aa15.42■□□□□ 0.06
SZRD1-201ENST00000401088 OFD1O75665 1012 aa15.42■□□□□ 0.06
SZRD1-201ENST00000401088 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SZRD1-201ENST00000401088 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
SZRD1-201ENST00000401088 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
SZRD1-201ENST00000401088 TEX14Q8IWB6 1497 aa15.4■□□□□ 0.06
SZRD1-201ENST00000401088 E9PSI1 815 aa15.4■□□□□ 0.06
SZRD1-201ENST00000401088 SLFN5Q08AF3 891 aa15.4■□□□□ 0.06
SZRD1-201ENST00000401088 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
SZRD1-201ENST00000401088 FGD1P98174 961 aa15.39■□□□□ 0.05
SZRD1-201ENST00000401088 GAS2L3Q86XJ1 694 aa15.39■□□□□ 0.05
SZRD1-201ENST00000401088 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
SZRD1-201ENST00000401088 PDE3AQ14432 1141 aa15.38■□□□□ 0.05
SZRD1-201ENST00000401088 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SZRD1-201ENST00000401088 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SZRD1-201ENST00000401088 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SZRD1-201ENST00000401088 NUP155O75694 1391 aa15.37■□□□□ 0.05
SZRD1-201ENST00000401088 PARD3Q8TEW0 1356 aa15.37■□□□□ 0.05
SZRD1-201ENST00000401088 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa15.37■□□□□ 0.05
SZRD1-201ENST00000401088 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SZRD1-201ENST00000401088 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SZRD1-201ENST00000401088 PRDM4Q9UKN5 801 aa15.35■□□□□ 0.05
SZRD1-201ENST00000401088 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa15.35■□□□□ 0.05
SZRD1-201ENST00000401088 PPP2R1AP30153 589 aa15.34■□□□□ 0.05
SZRD1-201ENST00000401088 RIPK4P57078 832 aa15.34■□□□□ 0.05
SZRD1-201ENST00000401088 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.34■□□□□ 0.05
SZRD1-201ENST00000401088 TOPBP1Q92547 1522 aa15.34■□□□□ 0.05
SZRD1-201ENST00000401088 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
SZRD1-201ENST00000401088 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.33■□□□□ 0.04
SZRD1-201ENST00000401088 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.33■□□□□ 0.04
SZRD1-201ENST00000401088 NBPF1Q3BBV0 1214 aa15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms