RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 DUOX2Q9NRD8 1548 aa31.9■■■□□ 2.7
UBE2E3-201ENST00000392415 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
UBE2E3-201ENST00000392415 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.89■■■□□ 2.7
UBE2E3-201ENST00000392415 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
UBE2E3-201ENST00000392415 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31.87■■■□□ 2.69
UBE2E3-201ENST00000392415 KIF15Q9NS87 1388 aa31.86■■■□□ 2.69
UBE2E3-201ENST00000392415 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.83■■■□□ 2.69
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
UBE2E3-201ENST00000392415 STRCQ7RTU9 1775 aa31.81■■■□□ 2.68
UBE2E3-201ENST00000392415 ERBINQ96RT1 1412 aa31.8■■■□□ 2.68
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.79■■■□□ 2.68
UBE2E3-201ENST00000392415 PZPP20742 1482 aa31.79■■■□□ 2.68
UBE2E3-201ENST00000392415 MROH1Q8NDA8 1641 aa31.79■■■□□ 2.68
UBE2E3-201ENST00000392415 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.78■■■□□ 2.68
UBE2E3-201ENST00000392415 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.78■■■□□ 2.68
UBE2E3-201ENST00000392415 NCOA1Q15788 1441 aa31.77■■■□□ 2.68
UBE2E3-201ENST00000392415 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCC3O15438 1527 aa31.75■■■□□ 2.67
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
UBE2E3-201ENST00000392415 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
UBE2E3-201ENST00000392415 ADGRL2O95490 1459 aa31.74■■■□□ 2.67
UBE2E3-201ENST00000392415 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
UBE2E3-201ENST00000392415 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
UBE2E3-201ENST00000392415 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.73■■■□□ 2.67
UBE2E3-201ENST00000392415 TNRQ92752 1358 aa31.69■■■□□ 2.66
UBE2E3-201ENST00000392415 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
UBE2E3-201ENST00000392415 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.69■■■□□ 2.66
UBE2E3-201ENST00000392415 DEPDC5O75140 1603 aa31.67■■■□□ 2.66
UBE2E3-201ENST00000392415 CEP152O94986 1710 aa31.67■■■□□ 2.66
UBE2E3-201ENST00000392415 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.67■■■□□ 2.66
UBE2E3-201ENST00000392415 PTPRTO14522 1441 aa31.63■■■□□ 2.65
UBE2E3-201ENST00000392415 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
UBE2E3-201ENST00000392415 PLA2R1Q13018 1463 aa31.62■■■□□ 2.65
UBE2E3-201ENST00000392415 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.61■■■□□ 2.659e-7■■■□□ 16.5
UBE2E3-201ENST00000392415 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.6■■■□□ 2.65
UBE2E3-201ENST00000392415 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.6■■■□□ 2.65
UBE2E3-201ENST00000392415 NLRP1Q9C000 1473 aa31.58■■■□□ 2.65
UBE2E3-201ENST00000392415 KANK1Q14678 1352 aa31.58■■■□□ 2.65
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa31.57■■■□□ 2.64
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa31.57■■■□□ 2.64
UBE2E3-201ENST00000392415 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
UBE2E3-201ENST00000392415 ERVK-7P63135 1459 aa31.57■■■□□ 2.64
UBE2E3-201ENST00000392415 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.55■■■□□ 2.64
UBE2E3-201ENST00000392415 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.55■■■□□ 2.64
UBE2E3-201ENST00000392415 PKD2Q13563 968 aa31.54■■■□□ 2.64
UBE2E3-201ENST00000392415 ROCK1Q13464 1354 aa31.54■■■□□ 2.64
UBE2E3-201ENST00000392415 LMTK2Q8IWU2 1503 aa31.52■■■□□ 2.64
UBE2E3-201ENST00000392415 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.49■■■□□ 2.63
UBE2E3-201ENST00000392415 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
UBE2E3-201ENST00000392415 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
UBE2E3-201ENST00000392415 CERKQ8TCT0 537 aa31.48■■■□□ 2.63
UBE2E3-201ENST00000392415 FBXO41Q8TF61 875 aa31.48■■■□□ 2.63
UBE2E3-201ENST00000392415 ITGAEP38570 1179 aa31.47■■■□□ 2.63
UBE2E3-201ENST00000392415 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
UBE2E3-201ENST00000392415 EFCAB6Q5THR3 1501 aa31.4■■■□□ 2.62
UBE2E3-201ENST00000392415 UNC13BO14795 1591 aa31.39■■■□□ 2.62
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKLE2Q86XL3 938 aa31.39■■■□□ 2.62
UBE2E3-201ENST00000392415 LTBP4Q8N2S1 1624 aa31.38■■■□□ 2.61
UBE2E3-201ENST00000392415 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.37■■■□□ 2.61
UBE2E3-201ENST00000392415 UBR1Q8IWV7 1749 aa31.37■■■□□ 2.61
UBE2E3-201ENST00000392415 NOS1P29475 1434 aa31.33■■■□□ 2.61
UBE2E3-201ENST00000392415 TET3O43151 1660 aa31.33■■■□□ 2.61
UBE2E3-201ENST00000392415 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
UBE2E3-201ENST00000392415 MED14O60244 1454 aa31.31■■■□□ 2.6
UBE2E3-201ENST00000392415 SYNMO15061 1565 aa31.3■■■□□ 2.6
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
UBE2E3-201ENST00000392415 PIK3C2BO00750 1634 aa31.29■■■□□ 2.6
UBE2E3-201ENST00000392415 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.28■■■□□ 2.6
UBE2E3-201ENST00000392415 IDI1Q13907 227 aa31.27■■■□□ 2.6
UBE2E3-201ENST00000392415 IQGAP3Q86VI3 1631 aa31.27■■■□□ 2.6
UBE2E3-201ENST00000392415 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
UBE2E3-201ENST00000392415 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGAP23Q9P227 1491 aa31.24■■■□□ 2.59
UBE2E3-201ENST00000392415 SLIT1O75093 1534 aa31.24■■■□□ 2.59
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC52A1Q9NWF4 448 aa31.24■■■□□ 2.59
UBE2E3-201ENST00000392415 NUP155O75694 1391 aa31.23■■■□□ 2.59
UBE2E3-201ENST00000392415 IQGAP1P46940 1657 aa31.21■■■□□ 2.59
UBE2E3-201ENST00000392415 IQSEC2Q5JU85 1478 aa31.21■■■□□ 2.59
UBE2E3-201ENST00000392415 STAG3Q9UJ98 1225 aa31.21■■■□□ 2.59
UBE2E3-201ENST00000392415 E9PCH4 1651 aa31.2■■■□□ 2.59
UBE2E3-201ENST00000392415 NAIPQ13075 1403 aa31.19■■■□□ 2.58
UBE2E3-201ENST00000392415 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
UBE2E3-201ENST00000392415 LTKP29376 864 aa31.18■■■□□ 2.58
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM2Q9UHN6 1383 aa31.18■■■□□ 2.58
UBE2E3-201ENST00000392415 TXNDC2Q86VQ3 553 aa31.17■■■□□ 2.58
UBE2E3-201ENST00000392415 ADGRB3O60242 1522 aa31.14■■■□□ 2.58
UBE2E3-201ENST00000392415 EID1Q9Y6B2 187 aa31.14■■■□□ 2.58
UBE2E3-201ENST00000392415 HFM1A2PYH4 1435 aa31.12■■■□□ 2.57
UBE2E3-201ENST00000392415 CPS1P31327 1500 aa31.09■■■□□ 2.57
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa31.05■■■□□ 2.56
UBE2E3-201ENST00000392415 MYO5BQ9ULV0 1848 aa31.05■■■□□ 2.56
UBE2E3-201ENST00000392415 STRCP1A6NGW2 1772 aa31■■■□□ 2.55
UBE2E3-201ENST00000392415 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa30.98■■■□□ 2.55
UBE2E3-201ENST00000392415 ZFYVE9O95405 1425 aa30.98■■■□□ 2.55
UBE2E3-201ENST00000392415 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
UBE2E3-201ENST00000392415 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.54
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIM52Q96A61 297 aa30.95■■■□□ 2.54
UBE2E3-201ENST00000392415 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.94■■■□□ 2.54
UBE2E3-201ENST00000392415 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.94■■■□□ 2.54
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.9■■■□□ 2.54
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