RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380776.4

KCNQ1-204, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-204ENST00000380776 HECW2Q9P2P5 1572 aa9.8□□□□□ -0.84
KCNQ1-204ENST00000380776 A2MP01023 1474 aa9.78□□□□□ -0.84
KCNQ1-204ENST00000380776 DEPDC5O75140 1603 aa9.78□□□□□ -0.84
KCNQ1-204ENST00000380776 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa9.78□□□□□ -0.84
KCNQ1-204ENST00000380776 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.85
KCNQ1-204ENST00000380776 ATP10AO60312 1499 aa9.77□□□□□ -0.85
KCNQ1-204ENST00000380776 KIF3BO15066 747 aa9.76□□□□□ -0.85
KCNQ1-204ENST00000380776 FOXD1Q16676 465 aa9.76□□□□□ -0.85
KCNQ1-204ENST00000380776 CCDC144AA2RUR9 1427 aa9.75□□□□□ -0.85
KCNQ1-204ENST00000380776 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
KCNQ1-204ENST00000380776 STAC3Q96MF2 364 aa9.75□□□□□ -0.85
KCNQ1-204ENST00000380776 BCORL1Q5H9F3 1711 aa9.75□□□□□ -0.85
KCNQ1-204ENST00000380776 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
KCNQ1-204ENST00000380776 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa9.75□□□□□ -0.85
KCNQ1-204ENST00000380776 TET3O43151 1660 aa9.74□□□□□ -0.85
KCNQ1-204ENST00000380776 RICTORQ6R327 1708 aa9.74□□□□□ -0.85
KCNQ1-204ENST00000380776 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.74□□□□□ -0.85
KCNQ1-204ENST00000380776 VWDEQ8N2E2 1590 aa9.74□□□□□ -0.85
KCNQ1-204ENST00000380776 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
KCNQ1-204ENST00000380776 LMTK2Q8IWU2 1503 aa9.73□□□□□ -0.85
KCNQ1-204ENST00000380776 RAPGEF3O95398 923 aa9.72□□□□□ -0.85
KCNQ1-204ENST00000380776 PPP6R1Q9UPN7 881 aa9.72□□□□□ -0.85
KCNQ1-204ENST00000380776 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa9.71□□□□□ -0.86
KCNQ1-204ENST00000380776 ABCA6Q8N139 1617 aa9.71□□□□□ -0.86
KCNQ1-204ENST00000380776 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
KCNQ1-204ENST00000380776 KIF13AQ9H1H9 1805 aa9.7□□□□□ -0.86
KCNQ1-204ENST00000380776 PTPRTO14522 1441 aa9.7□□□□□ -0.86
KCNQ1-204ENST00000380776 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa9.7□□□□□ -0.86
KCNQ1-204ENST00000380776 TRPM2O94759 1503 aa9.7□□□□□ -0.86
KCNQ1-204ENST00000380776 REREQ9P2R6 1566 aa9.7□□□□□ -0.86
KCNQ1-204ENST00000380776 TSPOAP1O95153 1857 aa9.7□□□□□ -0.86
KCNQ1-204ENST00000380776 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.69□□□□□ -0.86
KCNQ1-204ENST00000380776 NEURL4Q96JN8 1562 aa9.69□□□□□ -0.86
KCNQ1-204ENST00000380776 MROH1Q8NDA8 1641 aa9.68□□□□□ -0.86
KCNQ1-204ENST00000380776 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa9.68□□□□□ -0.86
KCNQ1-204ENST00000380776 EFCAB6Q5THR3 1501 aa9.68□□□□□ -0.86
KCNQ1-204ENST00000380776 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa9.68□□□□□ -0.86
KCNQ1-204ENST00000380776 E9PCH4 1651 aa9.67□□□□□ -0.86
KCNQ1-204ENST00000380776 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
KCNQ1-204ENST00000380776 AGLP35573 1532 aa9.67□□□□□ -0.86
KCNQ1-204ENST00000380776 PLA2R1Q13018 1463 aa9.67□□□□□ -0.86
KCNQ1-204ENST00000380776 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa9.66□□□□□ -0.86
KCNQ1-204ENST00000380776 GGT6Q6P531 493 aa9.66□□□□□ -0.86
KCNQ1-204ENST00000380776 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa9.65□□□□□ -0.86
KCNQ1-204ENST00000380776 CNTLNQ9NXG0 1405 aa9.65□□□□□ -0.86
KCNQ1-204ENST00000380776 RALGAPBQ86X10 1494 aa9.65□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 YEATS2Q9ULM3 1422 aa9.65□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 DCAF11Q8TEB1 546 aa9.64□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 ABCC3O15438 1527 aa9.64□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa9.63□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 CEP152O94986 1710 aa9.63□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 NBPF8Q3BBV2 869 aa9.63□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa9.63□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa9.61□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 RGL3Q3MIN7 710 aa9.61□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa9.61□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 NPATQ14207 1427 aa9.61□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 PRAG1Q86YV5 1406 aa9.61□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 KIF1BO60333 1816 aa9.61□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa9.6□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 NOS1P29475 1434 aa9.6□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 CARD11Q9BXL7 1154 aa9.6□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 SLC52A1Q9NWF4 448 aa9.6□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9.6□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 GPRASP1Q5JY77 1395 aa9.6□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 CLTCL1P53675 1640 aa9.6□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 SLC24A1O60721 1099 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 LAMC1P11047 1609 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 USP47Q96K76 1375 aa9.59□□□□□ -0.87
KCNQ1-204ENST00000380776 TRHP20396 242 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
KCNQ1-204ENST00000380776 MYOM2P54296 1465 aa9.58□□□□□ -0.88
KCNQ1-204ENST00000380776 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
KCNQ1-204ENST00000380776 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa9.56□□□□□ -0.88
KCNQ1-204ENST00000380776 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa9.56□□□□□ -0.88
KCNQ1-204ENST00000380776 ADGRB3O60242 1522 aa9.56□□□□□ -0.88
KCNQ1-204ENST00000380776 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
KCNQ1-204ENST00000380776 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
KCNQ1-204ENST00000380776 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
KCNQ1-204ENST00000380776 CCDC7Q96M83 1385 aa9.54□□□□□ -0.88
KCNQ1-204ENST00000380776 PIK3C2BO00750 1634 aa9.54□□□□□ -0.88
KCNQ1-204ENST00000380776 MADDQ8WXG6 1647 aa9.54□□□□□ -0.88
KCNQ1-204ENST00000380776 ANP32CO43423 234 aa9.54□□□□□ -0.88
KCNQ1-204ENST00000380776 PREX1Q8TCU6 1659 aa9.53□□□□□ -0.88
KCNQ1-204ENST00000380776 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
KCNQ1-204ENST00000380776 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
KCNQ1-204ENST00000380776 MIER1Q8N108 512 aa9.53□□□□□ -0.88
KCNQ1-204ENST00000380776 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
KCNQ1-204ENST00000380776 ERVK-7P63135 1459 aa9.53□□□□□ -0.88
KCNQ1-204ENST00000380776 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
KCNQ1-204ENST00000380776 NRXN1Q9ULB1 1477 aa9.52□□□□□ -0.89
KCNQ1-204ENST00000380776 WASHC2AQ641Q2 1341 aa9.52□□□□□ -0.89
KCNQ1-204ENST00000380776 IFT172Q9UG01 1749 aa9.51□□□□□ -0.89
KCNQ1-204ENST00000380776 SYNMO15061 1565 aa9.51□□□□□ -0.89
KCNQ1-204ENST00000380776 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa9.51□□□□□ -0.89
KCNQ1-204ENST00000380776 ZFYVE9O95405 1425 aa9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms