RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377962.7

CNMD-201, Transcript of chondromodulin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNMD, Length 1,410 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMD-201ENST00000377962 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
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CNMD-201ENST00000377962 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.15■□□□□ 0.66
CNMD-201ENST00000377962 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.66
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CNMD-201ENST00000377962 ADGRL2O95490 1459 aa19.13■□□□□ 0.65
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CNMD-201ENST00000377962 MROH2AA6NES4 1674 aa19.06■□□□□ 0.64
CNMD-201ENST00000377962 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19.05■□□□□ 0.64
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CNMD-201ENST00000377962 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
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CNMD-201ENST00000377962 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.93■□□□□ 0.62
CNMD-201ENST00000377962 UNC13BO14795 1591 aa18.93■□□□□ 0.62
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CNMD-201ENST00000377962 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa18.9■□□□□ 0.62
CNMD-201ENST00000377962 MYO3AQ8NEV4 1616 aa18.9■□□□□ 0.62
CNMD-201ENST00000377962 HFM1A2PYH4 1435 aa18.89■□□□□ 0.61
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CNMD-201ENST00000377962 LMTK2Q8IWU2 1503 aa18.87■□□□□ 0.61
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CNMD-201ENST00000377962 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
CNMD-201ENST00000377962 NUP155O75694 1391 aa18.86■□□□□ 0.61
CNMD-201ENST00000377962 ERVK-7P63135 1459 aa18.86■□□□□ 0.61
CNMD-201ENST00000377962 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa18.85■□□□□ 0.61
CNMD-201ENST00000377962 IQGAP3Q86VI3 1631 aa18.85■□□□□ 0.61
CNMD-201ENST00000377962 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa18.85■□□□□ 0.61
CNMD-201ENST00000377962 EFCAB6Q5THR3 1501 aa18.84■□□□□ 0.61
CNMD-201ENST00000377962 TET3O43151 1660 aa18.84■□□□□ 0.61
CNMD-201ENST00000377962 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.61
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CNMD-201ENST00000377962 E9PCH4 1651 aa18.82■□□□□ 0.6
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CNMD-201ENST00000377962 A2ML1A8K2U0 1454 aa18.79■□□□□ 0.6
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CNMD-201ENST00000377962 SYNMO15061 1565 aa18.78■□□□□ 0.6
CNMD-201ENST00000377962 NOS1P29475 1434 aa18.76■□□□□ 0.59
CNMD-201ENST00000377962 SETD5Q9C0A6 1442 aa18.76■□□□□ 0.59
CNMD-201ENST00000377962 NLRP1Q9C000 1473 aa18.76■□□□□ 0.59
CNMD-201ENST00000377962 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CNMD-201ENST00000377962 UGGT1Q9NYU2 1555 aa18.74■□□□□ 0.59
CNMD-201ENST00000377962 PIK3C2BO00750 1634 aa18.74■□□□□ 0.59
CNMD-201ENST00000377962 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa18.73■□□□□ 0.59
CNMD-201ENST00000377962 IDI1Q13907 227 aa18.73■□□□□ 0.59
CNMD-201ENST00000377962 UBR1Q8IWV7 1749 aa18.72■□□□□ 0.59
CNMD-201ENST00000377962 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa18.72■□□□□ 0.59
CNMD-201ENST00000377962 PCGF6Q9BYE7 350 aa18.7■□□□□ 0.58
CNMD-201ENST00000377962 PKD2Q13563 968 aa18.69■□□□□ 0.58
CNMD-201ENST00000377962 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
CNMD-201ENST00000377962 MYO5BQ9ULV0 1848 aa18.68■□□□□ 0.58
CNMD-201ENST00000377962 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa18.68■□□□□ 0.58
CNMD-201ENST00000377962 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
CNMD-201ENST00000377962 PLA2R1Q13018 1463 aa18.67■□□□□ 0.58
CNMD-201ENST00000377962 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.66■□□□□ 0.58
CNMD-201ENST00000377962 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
CNMD-201ENST00000377962 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.65■□□□□ 0.58
CNMD-201ENST00000377962 SLC52A1Q9NWF4 448 aa18.65■□□□□ 0.58
CNMD-201ENST00000377962 PTPRTO14522 1441 aa18.64■□□□□ 0.57
CNMD-201ENST00000377962 ADGRB3O60242 1522 aa18.63■□□□□ 0.57
CNMD-201ENST00000377962 NEURL4Q96JN8 1562 aa18.63■□□□□ 0.57
CNMD-201ENST00000377962 CHGAP10645 457 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
CNMD-201ENST00000377962 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa18.62■□□□□ 0.57
CNMD-201ENST00000377962 CLTCL1P53675 1640 aa18.61■□□□□ 0.57
CNMD-201ENST00000377962 ANKLE2Q86XL3 938 aa18.61■□□□□ 0.57
CNMD-201ENST00000377962 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
CNMD-201ENST00000377962 LTKP29376 864 aa18.6■□□□□ 0.57
CNMD-201ENST00000377962 ARHGAP23Q9P227 1491 aa18.59■□□□□ 0.57
CNMD-201ENST00000377962 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.59■□□□□ 0.57
CNMD-201ENST00000377962 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.59■□□□□ 0.57
CNMD-201ENST00000377962 SLIT1O75093 1534 aa18.59■□□□□ 0.57
CNMD-201ENST00000377962 TXNDC2Q86VQ3 553 aa18.58■□□□□ 0.57
CNMD-201ENST00000377962 TRPM2O94759 1503 aa18.58■□□□□ 0.57
CNMD-201ENST00000377962 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
CNMD-201ENST00000377962 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
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