RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375850.3

C9orf47-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 47, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene C9orf47, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47-202ENST00000375850 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
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C9orf47-202ENST00000375850 MAP3K1Q13233 1512 aa36.79■■■■□ 3.48
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C9orf47-202ENST00000375850 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.69■■■■□ 3.46
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C9orf47-202ENST00000375850 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.63■■■■□ 3.45
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C9orf47-202ENST00000375850 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.56■■■■□ 3.44
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C9orf47-202ENST00000375850 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.51■■■■□ 3.44
C9orf47-202ENST00000375850 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.43
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C9orf47-202ENST00000375850 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.49■■■■□ 3.43
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C9orf47-202ENST00000375850 CPS1P31327 1500 aa36.49■■■■□ 3.43
C9orf47-202ENST00000375850 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.48■■■■□ 3.43
C9orf47-202ENST00000375850 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.46■■■■□ 3.43
C9orf47-202ENST00000375850 MED14O60244 1454 aa36.44■■■■□ 3.42
C9orf47-202ENST00000375850 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.44■■■■□ 3.42
C9orf47-202ENST00000375850 DEPDC5O75140 1603 aa36.42■■■■□ 3.42
C9orf47-202ENST00000375850 ERVK-7P63135 1459 aa36.41■■■■□ 3.42
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C9orf47-202ENST00000375850 KIF15Q9NS87 1388 aa36.39■■■■□ 3.42
C9orf47-202ENST00000375850 ERBINQ96RT1 1412 aa36.38■■■■□ 3.41
C9orf47-202ENST00000375850 ABCC5O15440 1437 aa36.35■■■■□ 3.41
C9orf47-202ENST00000375850 TOM1O60784 492 aa36.34■■■■□ 3.41
C9orf47-202ENST00000375850 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.34■■■■□ 3.41
C9orf47-202ENST00000375850 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.32■■■■□ 3.4
C9orf47-202ENST00000375850 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
C9orf47-202ENST00000375850 ILDR2Q71H61 639 aa36.31■■■■□ 3.4
C9orf47-202ENST00000375850 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.31■■■■□ 3.4
C9orf47-202ENST00000375850 DAPK1P53355 1430 aa36.28■■■■□ 3.4
C9orf47-202ENST00000375850 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.28■■■■□ 3.4
C9orf47-202ENST00000375850 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.28■■■■□ 3.4
C9orf47-202ENST00000375850 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.28■■■■□ 3.4
C9orf47-202ENST00000375850 IQGAP1P46940 1657 aa36.26■■■■□ 3.39
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C9orf47-202ENST00000375850 KANK1Q14678 1352 aa36.25■■■■□ 3.39
C9orf47-202ENST00000375850 CEP152O94986 1710 aa36.25■■■■□ 3.39
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C9orf47-202ENST00000375850 SLIT1O75093 1534 aa36.16■■■■□ 3.38
C9orf47-202ENST00000375850 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.16■■■■□ 3.38
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C9orf47-202ENST00000375850 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.13■■■■□ 3.37
C9orf47-202ENST00000375850 HSPA1LP34931 641 aa36.12■■■■□ 3.37
C9orf47-202ENST00000375850 EID1Q9Y6B2 187 aa36.12■■■■□ 3.37
C9orf47-202ENST00000375850 TXNDC2Q86VQ3 553 aa36.11■■■■□ 3.37
C9orf47-202ENST00000375850 SYNMO15061 1565 aa36.1■■■■□ 3.37
C9orf47-202ENST00000375850 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.08■■■■□ 3.37
C9orf47-202ENST00000375850 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.08■■■■□ 3.37
C9orf47-202ENST00000375850 LTKP29376 864 aa36.06■■■■□ 3.36
C9orf47-202ENST00000375850 ADGRL2O95490 1459 aa36.05■■■■□ 3.36
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C9orf47-202ENST00000375850 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.95■■■■□ 3.35
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C9orf47-202ENST00000375850 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
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