RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369131.8

SFXN4-202, Transcript of sideroflexin 4, humanhuman

TSL 5

Gene SFXN4, Length 1,133 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4-202ENST00000369131 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.9■■■■□ 3.5
SFXN4-202ENST00000369131 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.9■■■■□ 3.5
SFXN4-202ENST00000369131 NCOA1Q15788 1441 aa36.9■■■■□ 3.5
SFXN4-202ENST00000369131 PTPRTO14522 1441 aa36.89■■■■□ 3.5
SFXN4-202ENST00000369131 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.89■■■■□ 3.5
SFXN4-202ENST00000369131 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.85■■■■□ 3.49
SFXN4-202ENST00000369131 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.85■■■■□ 3.49
SFXN4-202ENST00000369131 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
SFXN4-202ENST00000369131 TNRQ92752 1358 aa36.83■■■■□ 3.49
SFXN4-202ENST00000369131 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.83■■■■□ 3.49
SFXN4-202ENST00000369131 PZPP20742 1482 aa36.82■■■■□ 3.49
SFXN4-202ENST00000369131 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.82■■■■□ 3.49
SFXN4-202ENST00000369131 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.82■■■■□ 3.49
SFXN4-202ENST00000369131 KIF15Q9NS87 1388 aa36.82■■■■□ 3.49
SFXN4-202ENST00000369131 DAPK1P53355 1430 aa36.82■■■■□ 3.48
SFXN4-202ENST00000369131 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.81■■■■□ 3.48
SFXN4-202ENST00000369131 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
SFXN4-202ENST00000369131 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.78■■■■□ 3.48
SFXN4-202ENST00000369131 PKD2Q13563 968 aa36.77■■■■□ 3.48
SFXN4-202ENST00000369131 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.76■■■■□ 3.48
SFXN4-202ENST00000369131 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
SFXN4-202ENST00000369131 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
SFXN4-202ENST00000369131 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
SFXN4-202ENST00000369131 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
SFXN4-202ENST00000369131 PLA2R1Q13018 1463 aa36.74■■■■□ 3.47
SFXN4-202ENST00000369131 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
SFXN4-202ENST00000369131 ABCC3O15438 1527 aa36.72■■■■□ 3.47
SFXN4-202ENST00000369131 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.71■■■■□ 3.47
SFXN4-202ENST00000369131 ERBINQ96RT1 1412 aa36.7■■■■□ 3.47
SFXN4-202ENST00000369131 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.69■■■■□ 3.46
SFXN4-202ENST00000369131 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.67■■■■□ 3.462e-6■■■■□ 20.4
SFXN4-202ENST00000369131 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.65■■■■□ 3.46
SFXN4-202ENST00000369131 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
SFXN4-202ENST00000369131 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
SFXN4-202ENST00000369131 NLRP1Q9C000 1473 aa36.62■■■■□ 3.45
SFXN4-202ENST00000369131 KANK1Q14678 1352 aa36.57■■■■□ 3.45
SFXN4-202ENST00000369131 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.56■■■■□ 3.44
SFXN4-202ENST00000369131 ERVK-7P63135 1459 aa36.56■■■■□ 3.44
SFXN4-202ENST00000369131 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.55■■■■□ 3.44
SFXN4-202ENST00000369131 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.55■■■■□ 3.44
SFXN4-202ENST00000369131 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.54■■■■□ 3.44
SFXN4-202ENST00000369131 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
SFXN4-202ENST00000369131 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
SFXN4-202ENST00000369131 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
SFXN4-202ENST00000369131 ADGRL2O95490 1459 aa36.52■■■■□ 3.44
SFXN4-202ENST00000369131 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.52■■■■□ 3.44
SFXN4-202ENST00000369131 CEP152O94986 1710 aa36.51■■■■□ 3.44
SFXN4-202ENST00000369131 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.51■■■■□ 3.43
SFXN4-202ENST00000369131 DEPDC5O75140 1603 aa36.44■■■■□ 3.42
SFXN4-202ENST00000369131 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.42■■■■□ 3.42
SFXN4-202ENST00000369131 IQSEC2Q5JU85 1478 aa36.39■■■■□ 3.42
SFXN4-202ENST00000369131 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
SFXN4-202ENST00000369131 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.38■■■■□ 3.41
SFXN4-202ENST00000369131 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.38■■■■□ 3.41
SFXN4-202ENST00000369131 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
SFXN4-202ENST00000369131 ITGAEP38570 1179 aa36.35■■■■□ 3.41
SFXN4-202ENST00000369131 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.35■■■■□ 3.41
SFXN4-202ENST00000369131 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
SFXN4-202ENST00000369131 MED14O60244 1454 aa36.32■■■■□ 3.41
SFXN4-202ENST00000369131 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.31■■■■□ 3.4
SFXN4-202ENST00000369131 ROCK1Q13464 1354 aa36.3■■■■□ 3.4
SFXN4-202ENST00000369131 IDI1Q13907 227 aa36.28■■■■□ 3.4
SFXN4-202ENST00000369131 TXNDC2Q86VQ3 553 aa36.26■■■■□ 3.4
SFXN4-202ENST00000369131 UBAP1LF5GYI3 381 aa36.25■■■■□ 3.39
SFXN4-202ENST00000369131 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.23■■■■□ 3.39
SFXN4-202ENST00000369131 LTKP29376 864 aa36.23■■■■□ 3.39
SFXN4-202ENST00000369131 EID1Q9Y6B2 187 aa36.23■■■■□ 3.39
SFXN4-202ENST00000369131 DISP3Q9P2K9 1392 aa36.23■■■■□ 3.39
SFXN4-202ENST00000369131 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.23■■■■□ 3.39
SFXN4-202ENST00000369131 NOS1P29475 1434 aa36.21■■■■□ 3.39
SFXN4-202ENST00000369131 ILDR2Q71H61 639 aa36.2■■■■□ 3.39
SFXN4-202ENST00000369131 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.2■■■■□ 3.39
SFXN4-202ENST00000369131 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
SFXN4-202ENST00000369131 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.19■■■■□ 3.38
SFXN4-202ENST00000369131 CPS1P31327 1500 aa36.18■■■■□ 3.38
SFXN4-202ENST00000369131 SLIT1O75093 1534 aa36.18■■■■□ 3.38
SFXN4-202ENST00000369131 SOCS7O14512 581 aa36.17■■■■□ 3.38
SFXN4-202ENST00000369131 TMEM2Q9UHN6 1383 aa36.16■■■■□ 3.38
SFXN4-202ENST00000369131 IQGAP1P46940 1657 aa36.16■■■■□ 3.38
SFXN4-202ENST00000369131 PIK3C2BO00750 1634 aa36.16■■■■□ 3.38
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SFXN4-202ENST00000369131 NUP155O75694 1391 aa36.09■■■■□ 3.37
SFXN4-202ENST00000369131 UNC13BO14795 1591 aa36.09■■■■□ 3.37
SFXN4-202ENST00000369131 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
SFXN4-202ENST00000369131 TET3O43151 1660 aa36.07■■■■□ 3.36
SFXN4-202ENST00000369131 TOM1O60784 492 aa36.05■■■■□ 3.36
SFXN4-202ENST00000369131 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
SFXN4-202ENST00000369131 ADGRB3O60242 1522 aa36■■■■□ 3.35
SFXN4-202ENST00000369131 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
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SFXN4-202ENST00000369131 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
SFXN4-202ENST00000369131 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.97■■■■□ 3.35
SFXN4-202ENST00000369131 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.95■■■■□ 3.35
SFXN4-202ENST00000369131 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.95■■■■□ 3.35
SFXN4-202ENST00000369131 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
SFXN4-202ENST00000369131 BCANQ96GW7 911 aa35.95■■■■□ 3.35
SFXN4-202ENST00000369131 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.94■■■■□ 3.34
SFXN4-202ENST00000369131 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.9■■■■□ 3.34
SFXN4-202ENST00000369131 E9PCH4 1651 aa35.9■■■■□ 3.34
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