RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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CASQ1-201ENST00000368078 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.04■■□□□ 1.12
CASQ1-201ENST00000368078 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.04■■□□□ 1.12
CASQ1-201ENST00000368078 RICTORQ6R327 1708 aa22.02■■□□□ 1.12
CASQ1-201ENST00000368078 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.02■■□□□ 1.12
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CASQ1-201ENST00000368078 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.91■■□□□ 1.1
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CASQ1-201ENST00000368078 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.88■■□□□ 1.09
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CASQ1-201ENST00000368078 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.81■■□□□ 1.08
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CASQ1-201ENST00000368078 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.8■■□□□ 1.08
CASQ1-201ENST00000368078 PTPRTO14522 1441 aa21.79■■□□□ 1.08
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CASQ1-201ENST00000368078 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.76■■□□□ 1.07
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CASQ1-201ENST00000368078 TRPM2O94759 1503 aa21.75■■□□□ 1.07
CASQ1-201ENST00000368078 CLTCL1P53675 1640 aa21.74■■□□□ 1.07
CASQ1-201ENST00000368078 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
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CASQ1-201ENST00000368078 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.71■■□□□ 1.07
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CASQ1-201ENST00000368078 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.64■■□□□ 1.05
CASQ1-201ENST00000368078 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.63■■□□□ 1.05
CASQ1-201ENST00000368078 KIF1BO60333 1816 aa21.63■■□□□ 1.05
CASQ1-201ENST00000368078 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.63■■□□□ 1.05
CASQ1-201ENST00000368078 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.62■■□□□ 1.05
CASQ1-201ENST00000368078 AGLP35573 1532 aa21.62■■□□□ 1.05
CASQ1-201ENST00000368078 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CASQ1-201ENST00000368078 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CASQ1-201ENST00000368078 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.59■■□□□ 1.05
CASQ1-201ENST00000368078 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.59■■□□□ 1.05
CASQ1-201ENST00000368078 USP47Q96K76 1375 aa21.59■■□□□ 1.05
CASQ1-201ENST00000368078 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CASQ1-201ENST00000368078 NOS1P29475 1434 aa21.58■■□□□ 1.05
CASQ1-201ENST00000368078 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
CASQ1-201ENST00000368078 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.57■■□□□ 1.04
CASQ1-201ENST00000368078 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.57■■□□□ 1.04
CASQ1-201ENST00000368078 MROH2AA6NES4 1674 aa21.57■■□□□ 1.04
CASQ1-201ENST00000368078 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CASQ1-201ENST00000368078 SYNMO15061 1565 aa21.55■■□□□ 1.04
CASQ1-201ENST00000368078 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
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CASQ1-201ENST00000368078 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.54■■□□□ 1.04
CASQ1-201ENST00000368078 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.52■■□□□ 1.04
CASQ1-201ENST00000368078 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.52■■□□□ 1.04
CASQ1-201ENST00000368078 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.51■■□□□ 1.03
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CASQ1-201ENST00000368078 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.45■■□□□ 1.02
CASQ1-201ENST00000368078 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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