RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360476.7

NMB-201, Transcript of neuromedin B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NMB, Length 1,007 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMB-201ENST00000360476 PLA2R1Q13018 1463 aa43.07■■■■■ 4.49
NMB-201ENST00000360476 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP43.06■■■■■ 4.48
NMB-201ENST00000360476 FAM135AQ9P2D6 1515 aa43.06■■■■■ 4.48
NMB-201ENST00000360476 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP43.04■■■■■ 4.48
NMB-201ENST00000360476 A2ML1A8K2U0 1454 aa43.03■■■■■ 4.48
NMB-201ENST00000360476 MYOM3Q5VTT5 1437 aa43.03■■■■■ 4.48
NMB-201ENST00000360476 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
NMB-201ENST00000360476 PZPP20742 1482 aa43.01■■■■■ 4.48
NMB-201ENST00000360476 TSPY4P0CV99 314 aa42.99■■■■■ 4.47
NMB-201ENST00000360476 TSPY10P0CW01 314 aa42.99■■■■■ 4.47
NMB-201ENST00000360476 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP42.99■■■■■ 4.47
NMB-201ENST00000360476 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP42.97■■■■■ 4.47
NMB-201ENST00000360476 TNRQ92752 1358 aa42.96■■■■■ 4.47
NMB-201ENST00000360476 MIA2Q96PC5 1412 aa42.95■■■■■ 4.47
NMB-201ENST00000360476 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
NMB-201ENST00000360476 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.93■■■■■ 4.46
NMB-201ENST00000360476 CROCC2H7BZ55 1655 aa42.92■■■■■ 4.46
NMB-201ENST00000360476 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.91■■■■■ 4.46
NMB-201ENST00000360476 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP42.91■■■■■ 4.46
NMB-201ENST00000360476 PKD2Q13563 968 aa42.9■■■■■ 4.46
NMB-201ENST00000360476 CEP152O94986 1710 aa42.9■■■■■ 4.46
NMB-201ENST00000360476 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
NMB-201ENST00000360476 ABCC3O15438 1527 aa42.88■■■■■ 4.46
NMB-201ENST00000360476 IQSEC2Q5JU85 1478 aa42.87■■■■■ 4.45
NMB-201ENST00000360476 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
NMB-201ENST00000360476 NEURL4Q96JN8 1562 aa42.86■■■■■ 4.45
NMB-201ENST00000360476 PTPN23Q9H3S7 1636 aa42.86■■■■■ 4.45
NMB-201ENST00000360476 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.77■■■■■ 4.44
NMB-201ENST00000360476 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa42.74■■■■■ 4.43
NMB-201ENST00000360476 NLRP1Q9C000 1473 aa42.74■■■■■ 4.43
NMB-201ENST00000360476 ABCC5O15440 1437 aa42.73■■■■■ 4.43
NMB-201ENST00000360476 SHANK2Q9UPX8 1470 aa42.73■■■■■ 4.43
NMB-201ENST00000360476 UGGT1Q9NYU2 1555 aa42.72■■■■■ 4.43
NMB-201ENST00000360476 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.7■■■■■ 4.43
NMB-201ENST00000360476 ERVK-7P63135 1459 aa42.69■■■■■ 4.42
NMB-201ENST00000360476 KIF15Q9NS87 1388 aa42.67■■■■■ 4.42
NMB-201ENST00000360476 APLP2Q06481 763 aa42.67■■■■■ 4.42
NMB-201ENST00000360476 FGD6Q6ZV73 1430 aa42.67■■■■■ 4.42
NMB-201ENST00000360476 DAPK1P53355 1430 aa42.65■■■■■ 4.42
NMB-201ENST00000360476 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP42.65■■■■■ 4.42
NMB-201ENST00000360476 DEPDC5O75140 1603 aa42.63■■■■■ 4.41
NMB-201ENST00000360476 UBR1Q8IWV7 1749 aa42.58■■■■■ 4.41
NMB-201ENST00000360476 ERBINQ96RT1 1412 aa42.58■■■■■ 4.41
NMB-201ENST00000360476 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa42.58■■■■■ 4.41
NMB-201ENST00000360476 IQGAP1P46940 1657 aa42.57■■■■■ 4.41
NMB-201ENST00000360476 VWDEQ8N2E2 1590 aa42.57■■■■■ 4.41
NMB-201ENST00000360476 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
NMB-201ENST00000360476 UBAP1LF5GYI3 381 aa42.54■■■■■ 4.4
NMB-201ENST00000360476 ANKLE2Q86XL3 938 aa42.54■■■■■ 4.4
NMB-201ENST00000360476 MED14O60244 1454 aa42.53■■■■■ 4.4
NMB-201ENST00000360476 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP42.53■■■■■ 4.4
NMB-201ENST00000360476 CPS1P31327 1500 aa42.5■■■■■ 4.39
NMB-201ENST00000360476 STRCP1A6NGW2 1772 aa42.49■■■■■ 4.39
NMB-201ENST00000360476 DISP3Q9P2K9 1392 aa42.49■■■■■ 4.39
NMB-201ENST00000360476 CHIC2Q9UKJ5 165 aa42.45■■■■■ 4.39
NMB-201ENST00000360476 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa42.43■■■■■ 4.38
NMB-201ENST00000360476 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP42.42■■■■■ 4.38
NMB-201ENST00000360476 PIK3C2BO00750 1634 aa42.39■■■■■ 4.38
NMB-201ENST00000360476 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa42.39■■■■■ 4.38
NMB-201ENST00000360476 ADGRL2O95490 1459 aa42.33■■■■■ 4.37
NMB-201ENST00000360476 LMTK2Q8IWU2 1503 aa42.32■■■■■ 4.37
NMB-201ENST00000360476 ILDR2Q71H61 639 aa42.32■■■■■ 4.37
NMB-201ENST00000360476 ARHGAP23Q9P227 1491 aa42.31■■■■■ 4.36
NMB-201ENST00000360476 SLIT1O75093 1534 aa42.3■■■■■ 4.36
NMB-201ENST00000360476 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
NMB-201ENST00000360476 KANK1Q14678 1352 aa42.3■■■■■ 4.36
NMB-201ENST00000360476 ALKQ9UM73 1620 aa42.29■■■■■ 4.36
NMB-201ENST00000360476 SYNMO15061 1565 aa42.28■■■■■ 4.36
NMB-201ENST00000360476 EFCAB6Q5THR3 1501 aa42.26■■■■■ 4.36
NMB-201ENST00000360476 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP42.26■■■■■ 4.36
NMB-201ENST00000360476 LTKP29376 864 aa42.23■■■■■ 4.35
NMB-201ENST00000360476 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
NMB-201ENST00000360476 PIP4K2BP78356 416 aa42.22■■■■■ 4.35
NMB-201ENST00000360476 LRRC7Q96NW7 1537 aa42.2■■■■■ 4.35
NMB-201ENST00000360476 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
NMB-201ENST00000360476 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
NMB-201ENST00000360476 TXNDC2Q86VQ3 553 aa42.15■■■■■ 4.34
NMB-201ENST00000360476 TOM1O60784 492 aa42.14■■■■■ 4.34
NMB-201ENST00000360476 HSPA1LP34931 641 aa42.13■■■■■ 4.33
NMB-201ENST00000360476 MYO5BQ9ULV0 1848 aa42.13■■■■■ 4.33
NMB-201ENST00000360476 NOS1P29475 1434 aa42.12■■■■■ 4.33
NMB-201ENST00000360476 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa42.12■■■■■ 4.33
NMB-201ENST00000360476 TMEM2Q9UHN6 1383 aa42.11■■■■■ 4.33
NMB-201ENST00000360476 IDI1Q13907 227 aa42.09■■■■■ 4.33
NMB-201ENST00000360476 ADGRB3O60242 1522 aa42.09■■■■■ 4.33
NMB-201ENST00000360476 TET3O43151 1660 aa42.09■■■■■ 4.33
NMB-201ENST00000360476 UNC13BO14795 1591 aa42.05■■■■■ 4.32
NMB-201ENST00000360476 GCC2Q8IWJ2 1684 aa42.05■■■■■ 4.32
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NMB-201ENST00000360476 EID1Q9Y6B2 187 aa42.03■■■■■ 4.32
NMB-201ENST00000360476 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
NMB-201ENST00000360476 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
NMB-201ENST00000360476 E9PCH4 1651 aa41.94■■■■■ 4.3
NMB-201ENST00000360476 SOCS7O14512 581 aa41.91■■■■■ 4.3
NMB-201ENST00000360476 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
NMB-201ENST00000360476 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
NMB-201ENST00000360476 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.87■■■■■ 4.29
NMB-201ENST00000360476 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.87■■■■■ 4.29
NMB-201ENST00000360476 ROCK1Q13464 1354 aa41.86■■■■■ 4.29
NMB-201ENST00000360476 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.85■■■■■ 4.29
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