RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360325.11

CLDN7-201, Transcript of claudin 7, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN7, Length 1,542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7-201ENST00000360325 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.13■■□□□ 1.61
CLDN7-201ENST00000360325 NUP155O75694 1391 aa25.13■■□□□ 1.61
CLDN7-201ENST00000360325 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CLDN7-201ENST00000360325 DEPDC5O75140 1603 aa25.09■■□□□ 1.61
CLDN7-201ENST00000360325 KIF3BO15066 747 aa25.07■■□□□ 1.6
CLDN7-201ENST00000360325 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.06■■□□□ 1.6
CLDN7-201ENST00000360325 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.06■■□□□ 1.6
CLDN7-201ENST00000360325 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
CLDN7-201ENST00000360325 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.05■■□□□ 1.6
CLDN7-201ENST00000360325 ATP10AO60312 1499 aa25.04■■□□□ 1.6
CLDN7-201ENST00000360325 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CLDN7-201ENST00000360325 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.02■■□□□ 1.6
CLDN7-201ENST00000360325 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CLDN7-201ENST00000360325 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.01■■□□□ 1.59
CLDN7-201ENST00000360325 REREQ9P2R6 1566 aa25.01■■□□□ 1.59
CLDN7-201ENST00000360325 PKD2Q13563 968 aa25■■□□□ 1.59
CLDN7-201ENST00000360325 FOXD1Q16676 465 aa25■■□□□ 1.59
CLDN7-201ENST00000360325 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.99■■□□□ 1.59
CLDN7-201ENST00000360325 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.97■■□□□ 1.59
CLDN7-201ENST00000360325 KANK1Q14678 1352 aa24.97■■□□□ 1.59
CLDN7-201ENST00000360325 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.97■■□□□ 1.59
CLDN7-201ENST00000360325 AGLP35573 1532 aa24.93■■□□□ 1.58
CLDN7-201ENST00000360325 NEUROD1Q13562 356 aa24.91■■□□□ 1.58
CLDN7-201ENST00000360325 GGT6Q6P531 493 aa24.91■■□□□ 1.58
CLDN7-201ENST00000360325 TET3O43151 1660 aa24.9■■□□□ 1.58
CLDN7-201ENST00000360325 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.89■■□□□ 1.58
CLDN7-201ENST00000360325 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.89■■□□□ 1.57
CLDN7-201ENST00000360325 CEP152O94986 1710 aa24.87■■□□□ 1.57
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CLDN7-201ENST00000360325 ABCC3O15438 1527 aa24.84■■□□□ 1.57
CLDN7-201ENST00000360325 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.83■■□□□ 1.57
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CLDN7-201ENST00000360325 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.82■■□□□ 1.56
CLDN7-201ENST00000360325 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CLDN7-201ENST00000360325 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.8■■□□□ 1.56
CLDN7-201ENST00000360325 PLA2R1Q13018 1463 aa24.8■■□□□ 1.56
CLDN7-201ENST00000360325 TONSLQ96HA7 1378 aa24.79■■□□□ 1.56
CLDN7-201ENST00000360325 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.77■■□□□ 1.56
CLDN7-201ENST00000360325 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.76■■□□□ 1.55
CLDN7-201ENST00000360325 PTPRTO14522 1441 aa24.76■■□□□ 1.55
CLDN7-201ENST00000360325 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.75■■□□□ 1.55
CLDN7-201ENST00000360325 NPATQ14207 1427 aa24.73■■□□□ 1.55
CLDN7-201ENST00000360325 TRPM2O94759 1503 aa24.72■■□□□ 1.55
CLDN7-201ENST00000360325 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.72■■□□□ 1.55
CLDN7-201ENST00000360325 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.72■■□□□ 1.55
CLDN7-201ENST00000360325 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CLDN7-201ENST00000360325 MLECQ14165 292 aa24.71■■□□□ 1.55
CLDN7-201ENST00000360325 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CLDN7-201ENST00000360325 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CLDN7-201ENST00000360325 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.66■■□□□ 1.54
CLDN7-201ENST00000360325 CLTCL1P53675 1640 aa24.65■■□□□ 1.54
CLDN7-201ENST00000360325 NOS1P29475 1434 aa24.63■■□□□ 1.53
CLDN7-201ENST00000360325 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.63■■□□□ 1.53
CLDN7-201ENST00000360325 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
CLDN7-201ENST00000360325 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CLDN7-201ENST00000360325 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.58■■□□□ 1.53
CLDN7-201ENST00000360325 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.58■■□□□ 1.53
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CLDN7-201ENST00000360325 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.57■■□□□ 1.52
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CLDN7-201ENST00000360325 PIK3C2BO00750 1634 aa24.53■■□□□ 1.52
CLDN7-201ENST00000360325 KIF1BO60333 1816 aa24.53■■□□□ 1.52
CLDN7-201ENST00000360325 RGL3Q3MIN7 710 aa24.52■■□□□ 1.52
CLDN7-201ENST00000360325 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CLDN7-201ENST00000360325 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.51■■□□□ 1.51
CLDN7-201ENST00000360325 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.51■■□□□ 1.51
CLDN7-201ENST00000360325 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.48■■□□□ 1.51
CLDN7-201ENST00000360325 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.48■■□□□ 1.51
CLDN7-201ENST00000360325 ADGRB3O60242 1522 aa24.47■■□□□ 1.51
CLDN7-201ENST00000360325 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.47■■□□□ 1.51
CLDN7-201ENST00000360325 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.47■■□□□ 1.51
CLDN7-201ENST00000360325 IDI1Q13907 227 aa24.45■■□□□ 1.5
CLDN7-201ENST00000360325 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.45■■□□□ 1.5
CLDN7-201ENST00000360325 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.43■■□□□ 1.5
CLDN7-201ENST00000360325 C3P01024 1663 aa24.42■■□□□ 1.5
CLDN7-201ENST00000360325 MADDQ8WXG6 1647 aa24.42■■□□□ 1.5
CLDN7-201ENST00000360325 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CLDN7-201ENST00000360325 STAC3Q96MF2 364 aa24.4■■□□□ 1.5
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CLDN7-201ENST00000360325 IFT172Q9UG01 1749 aa24.38■■□□□ 1.49
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CLDN7-201ENST00000360325 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
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CLDN7-201ENST00000360325 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.35■■□□□ 1.49
CLDN7-201ENST00000360325 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.34■■□□□ 1.49
CLDN7-201ENST00000360325 MYOM2P54296 1465 aa24.34■■□□□ 1.49
CLDN7-201ENST00000360325 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
CLDN7-201ENST00000360325 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.33■■□□□ 1.49
CLDN7-201ENST00000360325 PPLO60437 1756 aa24.33■■□□□ 1.49
CLDN7-201ENST00000360325 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.31■■□□□ 1.48
CLDN7-201ENST00000360325 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.3■■□□□ 1.48
CLDN7-201ENST00000360325 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.28■■□□□ 1.48
CLDN7-201ENST00000360325 NLRP1Q9C000 1473 aa24.28■■□□□ 1.48
CLDN7-201ENST00000360325 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.28■■□□□ 1.48
CLDN7-201ENST00000360325 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.28■■□□□ 1.48
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