RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 EPAS1Q99814 870 aa10.32□□□□□ -0.76
CCL20-201ENST00000358813 ZNF687Q8N1G0 1237 aa10.31□□□□□ -0.76
CCL20-201ENST00000358813 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CCL20-201ENST00000358813 FBXW7Q969H0 707 aa10.3□□□□□ -0.76
CCL20-201ENST00000358813 SMYD5Q6GMV2 418 aa10.29□□□□□ -0.76
CCL20-201ENST00000358813 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
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CCL20-201ENST00000358813 BCL2L12Q9HB09 334 aa10.26□□□□□ -0.77
CCL20-201ENST00000358813 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CCL20-201ENST00000358813 KCNH8Q96L42 1107 aa10.25□□□□□ -0.77
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CCL20-201ENST00000358813 KCNK17Q96T54 332 aa10.24□□□□□ -0.77
CCL20-201ENST00000358813 ARHGAP33O14559 1287 aa10.23□□□□□ -0.77
CCL20-201ENST00000358813 AXIN2Q9Y2T1 843 aa10.23□□□□□ -0.77
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CCL20-201ENST00000358813 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa10.22□□□□□ -0.77
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CCL20-201ENST00000358813 PCDH10Q9P2E7 1040 aa10.19□□□□□ -0.78
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CCL20-201ENST00000358813 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.17□□□□□ -0.78
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CCL20-201ENST00000358813 GPIHBP1Q8IV16 184 aa10.11□□□□□ -0.79
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CCL20-201ENST00000358813 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CCL20-201ENST00000358813 RABGEF1Q9UJ41 708 aa10.03□□□□□ -0.8
CCL20-201ENST00000358813 TSKSQ9UJT2 592 aa10.03□□□□□ -0.8
CCL20-201ENST00000358813 UNC13AQ9UPW8 1703 aa10.03□□□□□ -0.8
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CCL20-201ENST00000358813 CECR2Q9BXF3 1484 aa10.01□□□□□ -0.81
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CCL20-201ENST00000358813 NBPF3Q9H094 633 aa10□□□□□ -0.81
CCL20-201ENST00000358813 FAM198AQ9UFP1 575 aa10□□□□□ -0.81
CCL20-201ENST00000358813 MYO15BQ96JP2 1530 aa9.99□□□□□ -0.81
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CCL20-201ENST00000358813 TATDN2Q93075 761 aa9.96□□□□□ -0.82
CCL20-201ENST00000358813 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CCL20-201ENST00000358813 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.95□□□□□ -0.82
CCL20-201ENST00000358813 SMAPO00193 183 aa9.95□□□□□ -0.82
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CCL20-201ENST00000358813 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.93□□□□□ -0.82
CCL20-201ENST00000358813 MAP2K5Q13163 448 aa9.92□□□□□ -0.82
CCL20-201ENST00000358813 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
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CCL20-201ENST00000358813 OATP04181 439 aa9.91□□□□□ -0.82
CCL20-201ENST00000358813 AK7Q96M32 723 aa9.91□□□□□ -0.82
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