RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 EPAS1Q99814 870 aa10.32□□□□□ -0.76
CCL20-201ENST00000358813 ZNF687Q8N1G0 1237 aa10.31□□□□□ -0.76
CCL20-201ENST00000358813 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CCL20-201ENST00000358813 FBXW7Q969H0 707 aa10.3□□□□□ -0.76
CCL20-201ENST00000358813 SMYD5Q6GMV2 418 aa10.29□□□□□ -0.76
CCL20-201ENST00000358813 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CCL20-201ENST00000358813 NACADO15069 1562 aa10.28□□□□□ -0.76
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CCL20-201ENST00000358813 CDAN1Q8IWY9 1227 aa10.27□□□□□ -0.77
CCL20-201ENST00000358813 ADAM33Q9BZ11 813 aa10.27□□□□□ -0.77
CCL20-201ENST00000358813 MAP3K7O43318 606 aa10.26□□□□□ -0.77
CCL20-201ENST00000358813 BCL2L12Q9HB09 334 aa10.26□□□□□ -0.77
CCL20-201ENST00000358813 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CCL20-201ENST00000358813 KCNH8Q96L42 1107 aa10.25□□□□□ -0.77
CCL20-201ENST00000358813 PTPREP23469 700 aa10.24□□□□□ -0.77
CCL20-201ENST00000358813 PBX2P40425 430 aa10.24□□□□□ -0.77
CCL20-201ENST00000358813 KCNK17Q96T54 332 aa10.24□□□□□ -0.77
CCL20-201ENST00000358813 ARHGAP33O14559 1287 aa10.23□□□□□ -0.77
CCL20-201ENST00000358813 AXIN2Q9Y2T1 843 aa10.23□□□□□ -0.77
CCL20-201ENST00000358813 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CCL20-201ENST00000358813 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
CCL20-201ENST00000358813 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa10.22□□□□□ -0.77
CCL20-201ENST00000358813 POTEEQ6S8J3 1075 aa10.22□□□□□ -0.77
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CCL20-201ENST00000358813 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CCL20-201ENST00000358813 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CCL20-201ENST00000358813 PCDH10Q9P2E7 1040 aa10.19□□□□□ -0.78
CCL20-201ENST00000358813 NUTM2FA1L443 756 aa10.18□□□□□ -0.78
CCL20-201ENST00000358813 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa10.17□□□□□ -0.78
CCL20-201ENST00000358813 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.17□□□□□ -0.78
CCL20-201ENST00000358813 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa10.16□□□□□ -0.78
CCL20-201ENST00000358813 COL9A1P20849 921 aa10.16□□□□□ -0.78
CCL20-201ENST00000358813 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP10.16□□□□□ -0.78
CCL20-201ENST00000358813 NEUROD2Q15784 382 aa10.16□□□□□ -0.78
CCL20-201ENST00000358813 DMRTA1Q5VZB9 504 aa10.16□□□□□ -0.78
CCL20-201ENST00000358813 CDHR5Q9HBB8 845 aa10.16□□□□□ -0.78
CCL20-201ENST00000358813 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa10.15□□□□□ -0.78
CCL20-201ENST00000358813 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
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CCL20-201ENST00000358813 GPIHBP1Q8IV16 184 aa10.11□□□□□ -0.79
CCL20-201ENST00000358813 ZBED2Q9BTP6 218 aa10.11□□□□□ -0.79
CCL20-201ENST00000358813 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
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CCL20-201ENST00000358813 PROX2Q3B8N5 592 aa10.09□□□□□ -0.79
CCL20-201ENST00000358813 ADGRD1Q6QNK2 874 aa10.09□□□□□ -0.79
CCL20-201ENST00000358813 SLC4A5Q9BY07 1137 aa10.09□□□□□ -0.79
CCL20-201ENST00000358813 SLC24A3Q9HC58 644 aa10.08□□□□□ -0.8
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CCL20-201ENST00000358813 CDCA7LQ96GN5 454 aa10.07□□□□□ -0.8
CCL20-201ENST00000358813 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa10.06□□□□□ -0.8
CCL20-201ENST00000358813 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CCL20-201ENST00000358813 PLSCR2Q9NRY7 297 aa10.06□□□□□ -0.8
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CCL20-201ENST00000358813 HIC1Q14526 733 aa10.04□□□□□ -0.8
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CCL20-201ENST00000358813 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CCL20-201ENST00000358813 RABGEF1Q9UJ41 708 aa10.03□□□□□ -0.8
CCL20-201ENST00000358813 TSKSQ9UJT2 592 aa10.03□□□□□ -0.8
CCL20-201ENST00000358813 UNC13AQ9UPW8 1703 aa10.03□□□□□ -0.8
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CCL20-201ENST00000358813 HRO43593 1189 aa10.01□□□□□ -0.81
CCL20-201ENST00000358813 CECR2Q9BXF3 1484 aa10.01□□□□□ -0.81
CCL20-201ENST00000358813 ZMYND10O75800 440 aa10□□□□□ -0.81
CCL20-201ENST00000358813 NBPF3Q9H094 633 aa10□□□□□ -0.81
CCL20-201ENST00000358813 FAM198AQ9UFP1 575 aa10□□□□□ -0.81
CCL20-201ENST00000358813 MYO15BQ96JP2 1530 aa9.99□□□□□ -0.81
CCL20-201ENST00000358813 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.99□□□□□ -0.81
CCL20-201ENST00000358813 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CCL20-201ENST00000358813 TTC13Q8NBP0 860 aa9.99□□□□□ -0.81
CCL20-201ENST00000358813 NBPF26B4DH59 902 aa9.98□□□□□ -0.81
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CCL20-201ENST00000358813 FECHP22830 423 aa9.98□□□□□ -0.81
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CCL20-201ENST00000358813 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa9.97□□□□□ -0.81
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CCL20-201ENST00000358813 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.96□□□□□ -0.82
CCL20-201ENST00000358813 TATDN2Q93075 761 aa9.96□□□□□ -0.82
CCL20-201ENST00000358813 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CCL20-201ENST00000358813 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.95□□□□□ -0.82
CCL20-201ENST00000358813 SMAPO00193 183 aa9.95□□□□□ -0.82
CCL20-201ENST00000358813 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa9.95□□□□□ -0.82
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CCL20-201ENST00000358813 BARGINQ6ZT62 677 aa9.94□□□□□ -0.82
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CCL20-201ENST00000358813 LAPTM4BQ86VI4 370 aa9.93□□□□□ -0.82
CCL20-201ENST00000358813 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CCL20-201ENST00000358813 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.93□□□□□ -0.82
CCL20-201ENST00000358813 MAP2K5Q13163 448 aa9.92□□□□□ -0.82
CCL20-201ENST00000358813 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CCL20-201ENST00000358813 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CCL20-201ENST00000358813 OATP04181 439 aa9.91□□□□□ -0.82
CCL20-201ENST00000358813 AK7Q96M32 723 aa9.91□□□□□ -0.82
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