RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.13■■□□□ 1.77
SPNS1-204ENST00000352260 CD109Q6YHK3 1445 aa26.13■■□□□ 1.77
SPNS1-204ENST00000352260 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.13■■□□□ 1.77
SPNS1-204ENST00000352260 TSPOAP1O95153 1857 aa26.12■■□□□ 1.77
SPNS1-204ENST00000352260 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.12■■□□□ 1.77
SPNS1-204ENST00000352260 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
SPNS1-204ENST00000352260 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.1■■□□□ 1.77
SPNS1-204ENST00000352260 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
SPNS1-204ENST00000352260 ATP7AQ04656 1500 aa26.09■■□□□ 1.77
SPNS1-204ENST00000352260 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
SPNS1-204ENST00000352260 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
SPNS1-204ENST00000352260 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.05■■□□□ 1.76
SPNS1-204ENST00000352260 BCL11AQ9H165 835 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS1-204ENST00000352260 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
SPNS1-204ENST00000352260 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.75
SPNS1-204ENST00000352260 PLA2R1Q13018 1463 aa25.99■■□□□ 1.75
SPNS1-204ENST00000352260 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.98■■□□□ 1.75
SPNS1-204ENST00000352260 DEPDC5O75140 1603 aa25.97■■□□□ 1.75
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.96■■□□□ 1.75
SPNS1-204ENST00000352260 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.96■■□□□ 1.75
SPNS1-204ENST00000352260 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.95■■□□□ 1.75
SPNS1-204ENST00000352260 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.94■■□□□ 1.74
SPNS1-204ENST00000352260 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.94■■□□□ 1.74
SPNS1-204ENST00000352260 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SPNS1-204ENST00000352260 ATP10AO60312 1499 aa25.93■■□□□ 1.74
SPNS1-204ENST00000352260 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SPNS1-204ENST00000352260 KDM5CP41229 1560 aa25.92■■□□□ 1.74
SPNS1-204ENST00000352260 NEO1Q92859 1461 aa25.91■■□□□ 1.74
SPNS1-204ENST00000352260 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.9■■□□□ 1.74
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
SPNS1-204ENST00000352260 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.88■■□□□ 1.73
SPNS1-204ENST00000352260 E9PCH4 1651 aa25.87■■□□□ 1.73
SPNS1-204ENST00000352260 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.87■■□□□ 1.73
SPNS1-204ENST00000352260 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.87■■□□□ 1.73
SPNS1-204ENST00000352260 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.86■■□□□ 1.73
SPNS1-204ENST00000352260 KIF3BO15066 747 aa25.86■■□□□ 1.73
SPNS1-204ENST00000352260 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.85■■□□□ 1.73
SPNS1-204ENST00000352260 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
SPNS1-204ENST00000352260 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.84■■□□□ 1.73
SPNS1-204ENST00000352260 KANK1Q14678 1352 aa25.84■■□□□ 1.73
SPNS1-204ENST00000352260 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.84■■□□□ 1.73
SPNS1-204ENST00000352260 TET3O43151 1660 aa25.84■■□□□ 1.73
SPNS1-204ENST00000352260 A2MP01023 1474 aa25.83■■□□□ 1.73
SPNS1-204ENST00000352260 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.82■■□□□ 1.72
SPNS1-204ENST00000352260 RAPGEF3O95398 923 aa25.81■■□□□ 1.72
SPNS1-204ENST00000352260 USP47Q96K76 1375 aa25.79■■□□□ 1.72
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC7Q96M83 1385 aa25.79■■□□□ 1.72
SPNS1-204ENST00000352260 TRPM2O94759 1503 aa25.79■■□□□ 1.72
SPNS1-204ENST00000352260 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
SPNS1-204ENST00000352260 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.78■■□□□ 1.72
SPNS1-204ENST00000352260 PTPRTO14522 1441 aa25.78■■□□□ 1.72
SPNS1-204ENST00000352260 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.77■■□□□ 1.72
SPNS1-204ENST00000352260 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.77■■□□□ 1.72
SPNS1-204ENST00000352260 ABCA6Q8N139 1617 aa25.77■■□□□ 1.72
SPNS1-204ENST00000352260 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
SPNS1-204ENST00000352260 RGL3Q3MIN7 710 aa25.76■■□□□ 1.72
SPNS1-204ENST00000352260 ANP32CO43423 234 aa25.75■■□□□ 1.71
SPNS1-204ENST00000352260 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
SPNS1-204ENST00000352260 RICTORQ6R327 1708 aa25.73■■□□□ 1.71
SPNS1-204ENST00000352260 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.72■■□□□ 1.71
SPNS1-204ENST00000352260 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.72■■□□□ 1.71
SPNS1-204ENST00000352260 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.72■■□□□ 1.71
SPNS1-204ENST00000352260 NEFLP07196 543 aa25.71■■□□□ 1.71
SPNS1-204ENST00000352260 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.71■■□□□ 1.71
SPNS1-204ENST00000352260 CLTCL1P53675 1640 aa25.7■■□□□ 1.71
SPNS1-204ENST00000352260 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.7■■□□□ 1.7
SPNS1-204ENST00000352260 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.7■■□□□ 1.7
SPNS1-204ENST00000352260 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.7■■□□□ 1.7
SPNS1-204ENST00000352260 FKBP8Q14318 412 aa25.69■■□□□ 1.7
SPNS1-204ENST00000352260 CEP152O94986 1710 aa25.69■■□□□ 1.7
SPNS1-204ENST00000352260 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
SPNS1-204ENST00000352260 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.68■■□□□ 1.7
SPNS1-204ENST00000352260 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
SPNS1-204ENST00000352260 CCER2I3L3R5 266 aa25.67■■□□□ 1.7
SPNS1-204ENST00000352260 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.62■■□□□ 1.69
SPNS1-204ENST00000352260 LAMC1P11047 1609 aa25.6■■□□□ 1.69
SPNS1-204ENST00000352260 GGT6Q6P531 493 aa25.59■■□□□ 1.69
SPNS1-204ENST00000352260 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.59■■□□□ 1.69
SPNS1-204ENST00000352260 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.59■■□□□ 1.69
SPNS1-204ENST00000352260 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.59■■□□□ 1.69
SPNS1-204ENST00000352260 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
SPNS1-204ENST00000352260 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.58■■□□□ 1.69
SPNS1-204ENST00000352260 ABCC3O15438 1527 aa25.57■■□□□ 1.68
SPNS1-204ENST00000352260 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.57■■□□□ 1.68
SPNS1-204ENST00000352260 MADDQ8WXG6 1647 aa25.57■■□□□ 1.68
SPNS1-204ENST00000352260 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.57■■□□□ 1.68
SPNS1-204ENST00000352260 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.54■■□□□ 1.68
SPNS1-204ENST00000352260 NPATQ14207 1427 aa25.54■■□□□ 1.68
SPNS1-204ENST00000352260 BCANQ96GW7 911 aa25.53■■□□□ 1.68
SPNS1-204ENST00000352260 STAC3Q96MF2 364 aa25.53■■□□□ 1.68
SPNS1-204ENST00000352260 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.51■■□□□ 1.67
SPNS1-204ENST00000352260 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.51■■□□□ 1.67
SPNS1-204ENST00000352260 KIF1BO60333 1816 aa25.5■■□□□ 1.67
SPNS1-204ENST00000352260 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.49■■□□□ 1.67
SPNS1-204ENST00000352260 MROH2AA6NES4 1674 aa25.47■■□□□ 1.67
SPNS1-204ENST00000352260 ADGRB3O60242 1522 aa25.45■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 MYOM2P54296 1465 aa25.44■■□□□ 1.66
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