RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CCR6-201ENST00000341935 BCORL1Q5H9F3 1711 aa8.8□□□□□ -1
CCR6-201ENST00000341935 ABCA6Q8N139 1617 aa8.8□□□□□ -1
CCR6-201ENST00000341935 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.79□□□□□ -1
CCR6-201ENST00000341935 IQGAP3Q86VI3 1631 aa8.79□□□□□ -1
CCR6-201ENST00000341935 MAGI2Q86UL8 1455 aa8.79□□□□□ -1
CCR6-201ENST00000341935 DEPDC5O75140 1603 aa8.79□□□□□ -1
CCR6-201ENST00000341935 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa8.79□□□□□ -1
CCR6-201ENST00000341935 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
CCR6-201ENST00000341935 NUP155O75694 1391 aa8.79□□□□□ -1
CCR6-201ENST00000341935 RAPGEF3O95398 923 aa8.78□□□□□ -1
CCR6-201ENST00000341935 PODXL2Q9NZ53 605 aa8.78□□□□□ -1
CCR6-201ENST00000341935 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CCR6-201ENST00000341935 FAM135AQ9P2D6 1515 aa8.78□□□□□ -1
CCR6-201ENST00000341935 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CCR6-201ENST00000341935 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa8.78□□□□□ -1
CCR6-201ENST00000341935 SIN3AQ96ST3 1273 aa8.77□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 A2MP01023 1474 aa8.77□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 NEUROD1Q13562 356 aa8.76□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 FOXD1Q16676 465 aa8.76□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 MROH1Q8NDA8 1641 aa8.75□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa8.75□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 PKD2Q13563 968 aa8.75□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 VWDEQ8N2E2 1590 aa8.74□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 YEATS2Q9ULM3 1422 aa8.74□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 KIF3BO15066 747 aa8.73□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 TET3O43151 1660 aa8.73□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.72□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 E9PCH4 1651 aa8.72□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 KANK1Q14678 1352 aa8.72□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 CEP152O94986 1710 aa8.71□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 TRHP20396 242 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 REREQ9P2R6 1566 aa8.71□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 KLHL34Q8N239 644 aa8.71□□□□□ -1.01
CCR6-201ENST00000341935 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa8.71□□□□□ -1.02
CCR6-201ENST00000341935 ATP10AO60312 1499 aa8.71□□□□□ -1.02
CCR6-201ENST00000341935 TONSLQ96HA7 1378 aa8.71□□□□□ -1.02
CCR6-201ENST00000341935 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CCR6-201ENST00000341935 LMTK2Q8IWU2 1503 aa8.7□□□□□ -1.02
CCR6-201ENST00000341935 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa8.69□□□□□ -1.02
CCR6-201ENST00000341935 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa8.69□□□□□ -1.02
CCR6-201ENST00000341935 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CCR6-201ENST00000341935 EFCAB6Q5THR3 1501 aa8.68□□□□□ -1.02
CCR6-201ENST00000341935 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CCR6-201ENST00000341935 AGLP35573 1532 aa8.68□□□□□ -1.02
CCR6-201ENST00000341935 PLA2R1Q13018 1463 aa8.67□□□□□ -1.02
CCR6-201ENST00000341935 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa8.67□□□□□ -1.02
CCR6-201ENST00000341935 ABCC3O15438 1527 aa8.67□□□□□ -1.02
CCR6-201ENST00000341935 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CCR6-201ENST00000341935 GGT6Q6P531 493 aa8.66□□□□□ -1.02
CCR6-201ENST00000341935 TRPM2O94759 1503 aa8.66□□□□□ -1.02
CCR6-201ENST00000341935 CCDC144AA2RUR9 1427 aa8.66□□□□□ -1.02
CCR6-201ENST00000341935 PTPRTO14522 1441 aa8.65□□□□□ -1.02
CCR6-201ENST00000341935 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-201ENST00000341935 CLTCL1P53675 1640 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-201ENST00000341935 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-201ENST00000341935 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CCR6-201ENST00000341935 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CCR6-201ENST00000341935 NPATQ14207 1427 aa8.62□□□□□ -1.03
CCR6-201ENST00000341935 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa8.61□□□□□ -1.03
CCR6-201ENST00000341935 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CCR6-201ENST00000341935 KIF1BO60333 1816 aa8.61□□□□□ -1.03
CCR6-201ENST00000341935 PPP6R1Q9UPN7 881 aa8.61□□□□□ -1.03
CCR6-201ENST00000341935 UGGT1Q9NYU2 1555 aa8.6□□□□□ -1.03
CCR6-201ENST00000341935 PREX1Q8TCU6 1659 aa8.6□□□□□ -1.03
CCR6-201ENST00000341935 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.6□□□□□ -1.03
CCR6-201ENST00000341935 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CCR6-201ENST00000341935 CNTLNQ9NXG0 1405 aa8.6□□□□□ -1.03
CCR6-201ENST00000341935 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa8.59□□□□□ -1.03
CCR6-201ENST00000341935 SYNMO15061 1565 aa8.59□□□□□ -1.03
CCR6-201ENST00000341935 MROH2AA6NES4 1674 aa8.59□□□□□ -1.03
CCR6-201ENST00000341935 NOS1P29475 1434 aa8.59□□□□□ -1.03
CCR6-201ENST00000341935 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa8.59□□□□□ -1.03
CCR6-201ENST00000341935 PIK3C2BO00750 1634 aa8.59□□□□□ -1.03
CCR6-201ENST00000341935 NBPF8Q3BBV2 869 aa8.58□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 MLECQ14165 292 aa8.58□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 RGL3Q3MIN7 710 aa8.57□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 DCAF11Q8TEB1 546 aa8.57□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 IFT172Q9UG01 1749 aa8.57□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 ADGRB3O60242 1522 aa8.57□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa8.56□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa8.56□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 ERVK-7P63135 1459 aa8.56□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 ARXQ96QS3 562 aa8.55□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 RALGAPBQ86X10 1494 aa8.55□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 PRAG1Q86YV5 1406 aa8.55□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa8.55□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa8.55□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 MADDQ8WXG6 1647 aa8.55□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 PPLO60437 1756 aa8.54□□□□□ -1.04
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