RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336070.11

FRMD1-202, Transcript of FERM domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene FRMD1, Length 1,600 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD1-202ENST00000336070 ATP10AO60312 1499 aa26.77■■□□□ 1.88
FRMD1-202ENST00000336070 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.76■■□□□ 1.87
FRMD1-202ENST00000336070 ABCA6Q8N139 1617 aa26.75■■□□□ 1.87
FRMD1-202ENST00000336070 PZPP20742 1482 aa26.74■■□□□ 1.87
FRMD1-202ENST00000336070 UNC13BO14795 1591 aa26.74■■□□□ 1.87
FRMD1-202ENST00000336070 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.72■■□□□ 1.87
FRMD1-202ENST00000336070 KANK1Q14678 1352 aa26.72■■□□□ 1.87
FRMD1-202ENST00000336070 REREQ9P2R6 1566 aa26.7■■□□□ 1.87
FRMD1-202ENST00000336070 PKD2Q13563 968 aa26.68■■□□□ 1.86
FRMD1-202ENST00000336070 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.67■■□□□ 1.86
FRMD1-202ENST00000336070 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.67■■□□□ 1.86
FRMD1-202ENST00000336070 DEPDC5O75140 1603 aa26.67■■□□□ 1.86
FRMD1-202ENST00000336070 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.65■■□□□ 1.86
FRMD1-202ENST00000336070 AGLP35573 1532 aa26.65■■□□□ 1.86
FRMD1-202ENST00000336070 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.64■■□□□ 1.85
FRMD1-202ENST00000336070 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.64■■□□□ 1.85
FRMD1-202ENST00000336070 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
FRMD1-202ENST00000336070 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.63■■□□□ 1.85
FRMD1-202ENST00000336070 GGT6Q6P531 493 aa26.62■■□□□ 1.85
FRMD1-202ENST00000336070 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.62■■□□□ 1.85
FRMD1-202ENST00000336070 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
FRMD1-202ENST00000336070 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.61■■□□□ 1.85
FRMD1-202ENST00000336070 FOXD1Q16676 465 aa26.57■■□□□ 1.84
FRMD1-202ENST00000336070 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.57■■□□□ 1.84
FRMD1-202ENST00000336070 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.57■■□□□ 1.84
FRMD1-202ENST00000336070 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.56■■□□□ 1.84
FRMD1-202ENST00000336070 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.55■■□□□ 1.84
FRMD1-202ENST00000336070 NEUROD1Q13562 356 aa26.52■■□□□ 1.84
FRMD1-202ENST00000336070 TET3O43151 1660 aa26.49■■□□□ 1.83
FRMD1-202ENST00000336070 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
FRMD1-202ENST00000336070 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
FRMD1-202ENST00000336070 ABCC3O15438 1527 aa26.45■■□□□ 1.82
FRMD1-202ENST00000336070 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.44■■□□□ 1.82
FRMD1-202ENST00000336070 PTPRTO14522 1441 aa26.43■■□□□ 1.82
FRMD1-202ENST00000336070 TONSLQ96HA7 1378 aa26.42■■□□□ 1.82
FRMD1-202ENST00000336070 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.42■■□□□ 1.82
FRMD1-202ENST00000336070 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
FRMD1-202ENST00000336070 PLA2R1Q13018 1463 aa26.41■■□□□ 1.82
FRMD1-202ENST00000336070 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.4■■□□□ 1.82
FRMD1-202ENST00000336070 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
FRMD1-202ENST00000336070 E9PCH4 1651 aa26.39■■□□□ 1.81
FRMD1-202ENST00000336070 NPATQ14207 1427 aa26.38■■□□□ 1.81
FRMD1-202ENST00000336070 MLECQ14165 292 aa26.37■■□□□ 1.81
FRMD1-202ENST00000336070 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.36■■□□□ 1.81
FRMD1-202ENST00000336070 CEP152O94986 1710 aa26.33■■□□□ 1.81
FRMD1-202ENST00000336070 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.33■■□□□ 1.81
FRMD1-202ENST00000336070 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
FRMD1-202ENST00000336070 TRPM2O94759 1503 aa26.32■■□□□ 1.8
FRMD1-202ENST00000336070 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.31■■□□□ 1.8
FRMD1-202ENST00000336070 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.29■■□□□ 1.8
FRMD1-202ENST00000336070 NOS1P29475 1434 aa26.29■■□□□ 1.8
FRMD1-202ENST00000336070 ZMYM3Q14202 1370 aa26.26■■□□□ 1.8
FRMD1-202ENST00000336070 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.26■■□□□ 1.79
FRMD1-202ENST00000336070 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.26■■□□□ 1.79
FRMD1-202ENST00000336070 STAC3Q96MF2 364 aa26.24■■□□□ 1.79
FRMD1-202ENST00000336070 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
FRMD1-202ENST00000336070 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.2■■□□□ 1.78
FRMD1-202ENST00000336070 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.19■■□□□ 1.78
FRMD1-202ENST00000336070 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
FRMD1-202ENST00000336070 ERVK-7P63135 1459 aa26.17■■□□□ 1.78
FRMD1-202ENST00000336070 RGL3Q3MIN7 710 aa26.16■■□□□ 1.78
FRMD1-202ENST00000336070 CLTCL1P53675 1640 aa26.15■■□□□ 1.78
FRMD1-202ENST00000336070 MROH2AA6NES4 1674 aa26.15■■□□□ 1.78
FRMD1-202ENST00000336070 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.14■■□□□ 1.78
FRMD1-202ENST00000336070 IDI1Q13907 227 aa26.14■■□□□ 1.77
FRMD1-202ENST00000336070 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.13■■□□□ 1.77
FRMD1-202ENST00000336070 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.12■■□□□ 1.77
FRMD1-202ENST00000336070 SYNMO15061 1565 aa26.11■■□□□ 1.77
FRMD1-202ENST00000336070 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.1■■□□□ 1.77
FRMD1-202ENST00000336070 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.09■■□□□ 1.77
FRMD1-202ENST00000336070 PIK3C2BO00750 1634 aa26.09■■□□□ 1.77
FRMD1-202ENST00000336070 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.09■■□□□ 1.77
FRMD1-202ENST00000336070 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
FRMD1-202ENST00000336070 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
FRMD1-202ENST00000336070 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.06■■□□□ 1.76
FRMD1-202ENST00000336070 TNRQ92752 1358 aa26.05■■□□□ 1.76
FRMD1-202ENST00000336070 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.04■■□□□ 1.76
FRMD1-202ENST00000336070 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.04■■□□□ 1.76
FRMD1-202ENST00000336070 KIF1BO60333 1816 aa26.04■■□□□ 1.76
FRMD1-202ENST00000336070 ADGRB3O60242 1522 aa26.04■■□□□ 1.76
FRMD1-202ENST00000336070 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
FRMD1-202ENST00000336070 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.02■■□□□ 1.76
FRMD1-202ENST00000336070 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
FRMD1-202ENST00000336070 STAG3Q9UJ98 1225 aa26■■□□□ 1.75
FRMD1-202ENST00000336070 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.98■■□□□ 1.75
FRMD1-202ENST00000336070 NLRP1Q9C000 1473 aa25.98■■□□□ 1.75
FRMD1-202ENST00000336070 MADDQ8WXG6 1647 aa25.97■■□□□ 1.75
FRMD1-202ENST00000336070 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
FRMD1-202ENST00000336070 C3P01024 1663 aa25.96■■□□□ 1.75
FRMD1-202ENST00000336070 MYOM2P54296 1465 aa25.95■■□□□ 1.74
FRMD1-202ENST00000336070 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.94■■□□□ 1.74
FRMD1-202ENST00000336070 ZFYVE9O95405 1425 aa25.93■■□□□ 1.74
FRMD1-202ENST00000336070 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
FRMD1-202ENST00000336070 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.91■■□□□ 1.74
FRMD1-202ENST00000336070 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
FRMD1-202ENST00000336070 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.9■■□□□ 1.74
FRMD1-202ENST00000336070 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
FRMD1-202ENST00000336070 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.88■■□□□ 1.73
FRMD1-202ENST00000336070 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
FRMD1-202ENST00000336070 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.88■■□□□ 1.73
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