RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335497.11

RNF220-201, Transcript of ring finger protein 220, humanhuman

TSL 5

Gene RNF220, Length 1,203 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220-201ENST00000335497 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.07■■■■■ 4.17
RNF220-201ENST00000335497 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.07■■■■■ 4.16
RNF220-201ENST00000335497 PKD2Q13563 968 aa41.06■■■■■ 4.16
RNF220-201ENST00000335497 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.06■■■■■ 4.16
RNF220-201ENST00000335497 MIA2Q96PC5 1412 aa41.04■■■■■ 4.16
RNF220-201ENST00000335497 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.02■■■■■ 4.16
RNF220-201ENST00000335497 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.02■■■■■ 4.16
RNF220-201ENST00000335497 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
RNF220-201ENST00000335497 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.01■■■■■ 4.16
RNF220-201ENST00000335497 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.01■■■■■ 4.16
RNF220-201ENST00000335497 PZPP20742 1482 aa41■■■■■ 4.15
RNF220-201ENST00000335497 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.97■■■■■ 4.15
RNF220-201ENST00000335497 TNRQ92752 1358 aa40.96■■■■■ 4.15
RNF220-201ENST00000335497 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.95■■■■■ 4.15
RNF220-201ENST00000335497 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
RNF220-201ENST00000335497 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
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RNF220-201ENST00000335497 APLP2Q06481 763 aa40.86■■■■■ 4.13
RNF220-201ENST00000335497 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
RNF220-201ENST00000335497 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
RNF220-201ENST00000335497 NLRP1Q9C000 1473 aa40.8■■■■■ 4.12
RNF220-201ENST00000335497 ABCC3O15438 1527 aa40.79■■■■■ 4.12
RNF220-201ENST00000335497 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.77■■■■■ 4.12
RNF220-201ENST00000335497 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
RNF220-201ENST00000335497 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
RNF220-201ENST00000335497 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.74■■■■■ 4.11
RNF220-201ENST00000335497 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.73■■■■■ 4.11
RNF220-201ENST00000335497 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.73■■■■■ 4.11
RNF220-201ENST00000335497 ABCC5O15440 1437 aa40.72■■■■■ 4.11
RNF220-201ENST00000335497 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.7■■■■■ 4.11
RNF220-201ENST00000335497 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.7■■■■■ 4.11
RNF220-201ENST00000335497 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.69■■■■■ 4.11
RNF220-201ENST00000335497 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.69■■■■■ 4.1
RNF220-201ENST00000335497 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.69■■■■■ 4.1
RNF220-201ENST00000335497 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.69■■■■■ 4.1
RNF220-201ENST00000335497 KIF15Q9NS87 1388 aa40.68■■■■■ 4.1
RNF220-201ENST00000335497 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.65■■■■■ 4.1
RNF220-201ENST00000335497 ERBINQ96RT1 1412 aa40.64■■■■■ 4.1
RNF220-201ENST00000335497 ERVK-7P63135 1459 aa40.64■■■■■ 4.1
RNF220-201ENST00000335497 DAPK1P53355 1430 aa40.62■■■■■ 4.09
RNF220-201ENST00000335497 CEP152O94986 1710 aa40.62■■■■■ 4.09
RNF220-201ENST00000335497 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.61■■■■■ 4.09
RNF220-201ENST00000335497 DEPDC5O75140 1603 aa40.6■■■■■ 4.09
RNF220-201ENST00000335497 UBAP1LF5GYI3 381 aa40.59■■■■■ 4.09
RNF220-201ENST00000335497 MED14O60244 1454 aa40.58■■■■■ 4.09
RNF220-201ENST00000335497 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
RNF220-201ENST00000335497 CPS1P31327 1500 aa40.55■■■■■ 4.08
RNF220-201ENST00000335497 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
RNF220-201ENST00000335497 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.53■■■■■ 4.08
RNF220-201ENST00000335497 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.49■■■■■ 4.07
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RNF220-201ENST00000335497 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.48■■■■■ 4.07
RNF220-201ENST00000335497 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.47■■■■■ 4.07
RNF220-201ENST00000335497 IQGAP1P46940 1657 aa40.45■■■■■ 4.07
RNF220-201ENST00000335497 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.44■■■■■ 4.065e-9■■□□□ 13.5
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RNF220-201ENST00000335497 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.43■■■■■ 4.06
RNF220-201ENST00000335497 ADGRL2O95490 1459 aa40.35■■■■■ 4.05
RNF220-201ENST00000335497 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.35■■■■■ 4.05
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RNF220-201ENST00000335497 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
RNF220-201ENST00000335497 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.32■■■■■ 4.05
RNF220-201ENST00000335497 SLIT1O75093 1534 aa40.32■■■■■ 4.05
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RNF220-201ENST00000335497 PIK3C2BO00750 1634 aa40.25■■■■■ 4.03
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RNF220-201ENST00000335497 ILDR2Q71H61 639 aa40.25■■■■■ 4.03
RNF220-201ENST00000335497 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.23■■■■■ 4.03
RNF220-201ENST00000335497 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
RNF220-201ENST00000335497 PIP4K2BP78356 416 aa40.22■■■■■ 4.03
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RNF220-201ENST00000335497 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
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RNF220-201ENST00000335497 LRRC7Q96NW7 1537 aa40.19■■■■■ 4.02
RNF220-201ENST00000335497 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.19■■■■■ 4.02
RNF220-201ENST00000335497 SYNMO15061 1565 aa40.18■■■■■ 4.02
RNF220-201ENST00000335497 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.18■■■■■ 4.02
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RNF220-201ENST00000335497 NOS1P29475 1434 aa40.16■■■■■ 4.02
RNF220-201ENST00000335497 HSPA1LP34931 641 aa40.15■■■■■ 4.02
RNF220-201ENST00000335497 ALKQ9UM73 1620 aa40.12■■■■■ 4.01
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RNF220-201ENST00000335497 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.09■■■■■ 4.01
RNF220-201ENST00000335497 SOCS7O14512 581 aa40.04■■■■■ 4
RNF220-201ENST00000335497 ADGRB3O60242 1522 aa40.04■■■■■ 4
RNF220-201ENST00000335497 TET3O43151 1660 aa40.01■■■■■ 4
RNF220-201ENST00000335497 ROCK1Q13464 1354 aa40■■■■□ 3.99
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RNF220-201ENST00000335497 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.92■■■■□ 3.98
RNF220-201ENST00000335497 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
RNF220-201ENST00000335497 KCNA6P17658 529 aa39.89■■■■□ 3.98
RNF220-201ENST00000335497 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
RNF220-201ENST00000335497 SLC26A8Q96RN1 970 aa39.87■■■■□ 3.97
RNF220-201ENST00000335497 ZFYVE9O95405 1425 aa39.83■■■■□ 3.97
RNF220-201ENST00000335497 HDGFP51858 240 aaKnown RBP39.82■■■■□ 3.97
RNF220-201ENST00000335497 IQGAP3Q86VI3 1631 aa39.82■■■■□ 3.96
RNF220-201ENST00000335497 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa39.81■■■■□ 3.96
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