RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.4■■□□□ 1.98
UPP1-201ENST00000331803 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.37■■□□□ 1.97
UPP1-201ENST00000331803 RAPGEF3O95398 923 aa27.33■■□□□ 1.97
UPP1-201ENST00000331803 DEPDC5O75140 1603 aa27.32■■□□□ 1.96
UPP1-201ENST00000331803 KIF3BO15066 747 aa27.32■■□□□ 1.96
UPP1-201ENST00000331803 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
UPP1-201ENST00000331803 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.32■■□□□ 1.96
UPP1-201ENST00000331803 A2MP01023 1474 aa27.29■■□□□ 1.96
UPP1-201ENST00000331803 PLA2R1Q13018 1463 aa27.27■■□□□ 1.96
UPP1-201ENST00000331803 KANK1Q14678 1352 aa27.26■■□□□ 1.95
UPP1-201ENST00000331803 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.26■■□□□ 1.95
UPP1-201ENST00000331803 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.25■■□□□ 1.95
UPP1-201ENST00000331803 RICTORQ6R327 1708 aa27.25■■□□□ 1.95
UPP1-201ENST00000331803 ATP10AO60312 1499 aa27.24■■□□□ 1.95
UPP1-201ENST00000331803 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.23■■□□□ 1.95
UPP1-201ENST00000331803 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
UPP1-201ENST00000331803 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
UPP1-201ENST00000331803 TSPOAP1O95153 1857 aa27.22■■□□□ 1.95
UPP1-201ENST00000331803 ABCA6Q8N139 1617 aa27.21■■□□□ 1.95
UPP1-201ENST00000331803 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.21■■□□□ 1.95
UPP1-201ENST00000331803 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.21■■□□□ 1.95
UPP1-201ENST00000331803 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
UPP1-201ENST00000331803 E9PCH4 1651 aa27.18■■□□□ 1.94
UPP1-201ENST00000331803 TET3O43151 1660 aa27.18■■□□□ 1.94
UPP1-201ENST00000331803 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
UPP1-201ENST00000331803 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.15■■□□□ 1.94
UPP1-201ENST00000331803 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.15■■□□□ 1.94
UPP1-201ENST00000331803 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.14■■□□□ 1.93
UPP1-201ENST00000331803 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.12■■□□□ 1.93
UPP1-201ENST00000331803 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.12■■□□□ 1.93
UPP1-201ENST00000331803 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.12■■□□□ 1.93
UPP1-201ENST00000331803 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
UPP1-201ENST00000331803 MIER1Q8N108 512 aa27.12■■□□□ 1.93
UPP1-201ENST00000331803 PTPRTO14522 1441 aa27.11■■□□□ 1.93
UPP1-201ENST00000331803 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
UPP1-201ENST00000331803 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.11■■□□□ 1.93
UPP1-201ENST00000331803 GGT6Q6P531 493 aa27.1■■□□□ 1.93
UPP1-201ENST00000331803 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.1■■□□□ 1.93
UPP1-201ENST00000331803 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.1■■□□□ 1.93
UPP1-201ENST00000331803 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.09■■□□□ 1.93
UPP1-201ENST00000331803 TRPM2O94759 1503 aa27.08■■□□□ 1.93
UPP1-201ENST00000331803 RGL3Q3MIN7 710 aa27.08■■□□□ 1.93
UPP1-201ENST00000331803 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.07■■□□□ 1.92
UPP1-201ENST00000331803 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.06■■□□□ 1.92
UPP1-201ENST00000331803 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
UPP1-201ENST00000331803 CEP152O94986 1710 aa27.03■■□□□ 1.92
UPP1-201ENST00000331803 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.01■■□□□ 1.91
UPP1-201ENST00000331803 RALGAPBQ86X10 1494 aa27■■□□□ 1.91
UPP1-201ENST00000331803 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27■■□□□ 1.91
UPP1-201ENST00000331803 CLTCL1P53675 1640 aa26.98■■□□□ 1.91
UPP1-201ENST00000331803 ABCC3O15438 1527 aa26.97■■□□□ 1.91
UPP1-201ENST00000331803 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.96■■□□□ 1.91
UPP1-201ENST00000331803 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
UPP1-201ENST00000331803 NPATQ14207 1427 aa26.94■■□□□ 1.9
UPP1-201ENST00000331803 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.92■■□□□ 1.9
UPP1-201ENST00000331803 USP47Q96K76 1375 aa26.92■■□□□ 1.9
UPP1-201ENST00000331803 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.92■■□□□ 1.9
UPP1-201ENST00000331803 REREQ9P2R6 1566 aa26.89■■□□□ 1.9
UPP1-201ENST00000331803 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.89■■□□□ 1.89
UPP1-201ENST00000331803 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
UPP1-201ENST00000331803 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.88■■□□□ 1.89
UPP1-201ENST00000331803 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.88■■□□□ 1.89
UPP1-201ENST00000331803 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.87■■□□□ 1.89
UPP1-201ENST00000331803 STAC3Q96MF2 364 aa26.87■■□□□ 1.89
UPP1-201ENST00000331803 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
UPP1-201ENST00000331803 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
UPP1-201ENST00000331803 AGLP35573 1532 aa26.85■■□□□ 1.89
UPP1-201ENST00000331803 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.85■■□□□ 1.89
UPP1-201ENST00000331803 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.84■■□□□ 1.89
UPP1-201ENST00000331803 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
UPP1-201ENST00000331803 KIF1BO60333 1816 aa26.82■■□□□ 1.88
UPP1-201ENST00000331803 CCDC7Q96M83 1385 aa26.82■■□□□ 1.88
UPP1-201ENST00000331803 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.82■■□□□ 1.88
UPP1-201ENST00000331803 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.81■■□□□ 1.88
UPP1-201ENST00000331803 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.8■■□□□ 1.88
UPP1-201ENST00000331803 NOS1P29475 1434 aa26.8■■□□□ 1.88
UPP1-201ENST00000331803 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.78■■□□□ 1.88
UPP1-201ENST00000331803 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.77■■□□□ 1.88
UPP1-201ENST00000331803 MADDQ8WXG6 1647 aa26.77■■□□□ 1.88
UPP1-201ENST00000331803 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.77■■□□□ 1.88
UPP1-201ENST00000331803 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
UPP1-201ENST00000331803 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.75■■□□□ 1.87
UPP1-201ENST00000331803 LAMC1P11047 1609 aa26.75■■□□□ 1.87
UPP1-201ENST00000331803 ADGRB3O60242 1522 aa26.74■■□□□ 1.87
UPP1-201ENST00000331803 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
UPP1-201ENST00000331803 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
UPP1-201ENST00000331803 MROH2AA6NES4 1674 aa26.73■■□□□ 1.87
UPP1-201ENST00000331803 ANP32CO43423 234 aa26.72■■□□□ 1.87
UPP1-201ENST00000331803 SYNMO15061 1565 aa26.72■■□□□ 1.87
UPP1-201ENST00000331803 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
UPP1-201ENST00000331803 MYOM2P54296 1465 aa26.7■■□□□ 1.87
UPP1-201ENST00000331803 PIK3C2BO00750 1634 aa26.7■■□□□ 1.86
UPP1-201ENST00000331803 MLECQ14165 292 aa26.68■■□□□ 1.86
UPP1-201ENST00000331803 IFT172Q9UG01 1749 aa26.68■■□□□ 1.86
UPP1-201ENST00000331803 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.67■■□□□ 1.86
UPP1-201ENST00000331803 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.67■■□□□ 1.86
UPP1-201ENST00000331803 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.66■■□□□ 1.86
UPP1-201ENST00000331803 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.66■■□□□ 1.86
UPP1-201ENST00000331803 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
UPP1-201ENST00000331803 IDI1Q13907 227 aa26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms