RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 PKD2Q13563 968 aa39.67■■■■□ 3.94
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PPP4R4-202ENST00000328839 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
PPP4R4-202ENST00000328839 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa39.64■■■■□ 3.94
PPP4R4-202ENST00000328839 IQSEC2Q5JU85 1478 aa39.62■■■■□ 3.93
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PPP4R4-202ENST00000328839 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP39.61■■■■□ 3.93
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PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP39.61■■■■□ 3.93
PPP4R4-202ENST00000328839 TNRQ92752 1358 aa39.6■■■■□ 3.93
PPP4R4-202ENST00000328839 MAP3K1Q13233 1512 aa39.6■■■■□ 3.93
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PPP4R4-202ENST00000328839 MYOM3Q5VTT5 1437 aa39.54■■■■□ 3.92
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PPP4R4-202ENST00000328839 MIA2Q96PC5 1412 aa39.49■■■■□ 3.91
PPP4R4-202ENST00000328839 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
PPP4R4-202ENST00000328839 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP39.45■■■■□ 3.91
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PPP4R4-202ENST00000328839 NEURL4Q96JN8 1562 aa39.42■■■■□ 3.9
PPP4R4-202ENST00000328839 ABCC3O15438 1527 aa39.41■■■■□ 3.9
PPP4R4-202ENST00000328839 NLRP1Q9C000 1473 aa39.41■■■■□ 3.9
PPP4R4-202ENST00000328839 APLP2Q06481 763 aa39.4■■■■□ 3.9
PPP4R4-202ENST00000328839 UGGT1Q9NYU2 1555 aa39.39■■■■□ 3.9
PPP4R4-202ENST00000328839 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP39.38■■■■□ 3.89
PPP4R4-202ENST00000328839 CEP152O94986 1710 aa39.38■■■■□ 3.89
PPP4R4-202ENST00000328839 UBAP1LF5GYI3 381 aa39.38■■■■□ 3.89
PPP4R4-202ENST00000328839 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.35■■■■□ 3.89
PPP4R4-202ENST00000328839 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP39.35■■■■□ 3.89
PPP4R4-202ENST00000328839 MROH1Q8NDA8 1641 aa39.35■■■■□ 3.89
PPP4R4-202ENST00000328839 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.35■■■■□ 3.89
PPP4R4-202ENST00000328839 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP39.34■■■■□ 3.89
PPP4R4-202ENST00000328839 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.33■■■■□ 3.89
PPP4R4-202ENST00000328839 ANKLE2Q86XL3 938 aa39.33■■■■□ 3.89
PPP4R4-202ENST00000328839 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa39.3■■■■□ 3.88
PPP4R4-202ENST00000328839 ERVK-7P63135 1459 aa39.27■■■■□ 3.88
PPP4R4-202ENST00000328839 KIF15Q9NS87 1388 aa39.26■■■■□ 3.88
PPP4R4-202ENST00000328839 DEPDC5O75140 1603 aa39.25■■■■□ 3.87
PPP4R4-202ENST00000328839 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.25■■■■□ 3.87
PPP4R4-202ENST00000328839 ABCC5O15440 1437 aa39.24■■■■□ 3.87
PPP4R4-202ENST00000328839 CPS1P31327 1500 aa39.24■■■■□ 3.87
PPP4R4-202ENST00000328839 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP39.23■■■■□ 3.87
PPP4R4-202ENST00000328839 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.22■■■■□ 3.87
PPP4R4-202ENST00000328839 IQGAP1P46940 1657 aa39.21■■■■□ 3.87
PPP4R4-202ENST00000328839 DAPK1P53355 1430 aa39.19■■■■□ 3.86
PPP4R4-202ENST00000328839 ERBINQ96RT1 1412 aa39.18■■■■□ 3.86
PPP4R4-202ENST00000328839 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP39.18■■■■□ 3.86
PPP4R4-202ENST00000328839 MED14O60244 1454 aa39.17■■■■□ 3.86
PPP4R4-202ENST00000328839 VWDEQ8N2E2 1590 aa39.17■■■■□ 3.86
PPP4R4-202ENST00000328839 FGD6Q6ZV73 1430 aa39.17■■■■□ 3.86
PPP4R4-202ENST00000328839 UBR1Q8IWV7 1749 aa39.15■■■■□ 3.86
PPP4R4-202ENST00000328839 ILDR2Q71H61 639 aa39.15■■■■□ 3.86
PPP4R4-202ENST00000328839 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
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PPP4R4-202ENST00000328839 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa39.04■■■■□ 3.84
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PPP4R4-202ENST00000328839 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP38.99■■■■□ 3.83
PPP4R4-202ENST00000328839 PIK3C2BO00750 1634 aa38.97■■■■□ 3.83
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PPP4R4-202ENST00000328839 SLIT1O75093 1534 aa38.94■■■■□ 3.82
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PPP4R4-202ENST00000328839 ARHGAP23Q9P227 1491 aa38.92■■■■□ 3.82
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP38.92■■■■□ 3.82
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PPP4R4-202ENST00000328839 SOCS7O14512 581 aa38.9■■■■□ 3.82
PPP4R4-202ENST00000328839 LTKP29376 864 aa38.9■■■■□ 3.82
PPP4R4-202ENST00000328839 STAG3Q9UJ98 1225 aa38.9■■■■□ 3.82
PPP4R4-202ENST00000328839 LMTK2Q8IWU2 1503 aa38.89■■■■□ 3.82
PPP4R4-202ENST00000328839 LRRC7Q96NW7 1537 aa38.89■■■■□ 3.82
PPP4R4-202ENST00000328839 EID1Q9Y6B2 187 aa38.88■■■■□ 3.81
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PPP4R4-202ENST00000328839 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.77
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC52A1Q9NWF4 448 aa38.63■■■■□ 3.77
PPP4R4-202ENST00000328839 MYO5BQ9ULV0 1848 aa38.62■■■■□ 3.77
PPP4R4-202ENST00000328839 GCC2Q8IWJ2 1684 aa38.61■■■■□ 3.77
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC26A8Q96RN1 970 aa38.6■■■■□ 3.77
PPP4R4-202ENST00000328839 UNC13BO14795 1591 aa38.58■■■■□ 3.77
PPP4R4-202ENST00000328839 BCANQ96GW7 911 aa38.58■■■■□ 3.77
PPP4R4-202ENST00000328839 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP38.53■■■■□ 3.76
PPP4R4-202ENST00000328839 KCNA6P17658 529 aa38.52■■■■□ 3.76
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM94Q12767 1356 aa38.52■■■■□ 3.76
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