RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326407.10

ITM2C-201, Transcript of integral membrane protein 2C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ITM2C, Length 1,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2C-201ENST00000326407 CCER2I3L3R5 266 aa23.44■■□□□ 1.34
ITM2C-201ENST00000326407 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.44■■□□□ 1.34
ITM2C-201ENST00000326407 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.43■■□□□ 1.34
ITM2C-201ENST00000326407 ANP32CO43423 234 aa23.42■■□□□ 1.34
ITM2C-201ENST00000326407 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.42■■□□□ 1.34
ITM2C-201ENST00000326407 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.41■■□□□ 1.34
ITM2C-201ENST00000326407 FOXD1Q16676 465 aa23.41■■□□□ 1.34
ITM2C-201ENST00000326407 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
ITM2C-201ENST00000326407 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
ITM2C-201ENST00000326407 PLXNC1O60486 1568 aa23.38■■□□□ 1.33
ITM2C-201ENST00000326407 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
ITM2C-201ENST00000326407 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.37■■□□□ 1.33
ITM2C-201ENST00000326407 ABCA6Q8N139 1617 aa23.36■■□□□ 1.33
ITM2C-201ENST00000326407 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.36■■□□□ 1.33
ITM2C-201ENST00000326407 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.36■■□□□ 1.33
ITM2C-201ENST00000326407 PZPP20742 1482 aa23.35■■□□□ 1.33
ITM2C-201ENST00000326407 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.34■■□□□ 1.33
ITM2C-201ENST00000326407 ATP10AO60312 1499 aa23.34■■□□□ 1.33
ITM2C-201ENST00000326407 KIF15Q9NS87 1388 aa23.34■■□□□ 1.33
ITM2C-201ENST00000326407 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.33■■□□□ 1.32
ITM2C-201ENST00000326407 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
ITM2C-201ENST00000326407 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
ITM2C-201ENST00000326407 A2MP01023 1474 aa23.3■■□□□ 1.32
ITM2C-201ENST00000326407 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.3■■□□□ 1.32
ITM2C-201ENST00000326407 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ITM2C-201ENST00000326407 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.3■■□□□ 1.32
ITM2C-201ENST00000326407 REREQ9P2R6 1566 aa23.29■■□□□ 1.32
ITM2C-201ENST00000326407 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
ITM2C-201ENST00000326407 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.25■■□□□ 1.31
ITM2C-201ENST00000326407 ERBINQ96RT1 1412 aa23.24■■□□□ 1.31
ITM2C-201ENST00000326407 AGLP35573 1532 aa23.22■■□□□ 1.31
ITM2C-201ENST00000326407 PKD2Q13563 968 aa23.2■■□□□ 1.3
ITM2C-201ENST00000326407 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.2■■□□□ 1.3
ITM2C-201ENST00000326407 NUP155O75694 1391 aa23.2■■□□□ 1.3
ITM2C-201ENST00000326407 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.2■■□□□ 1.3
ITM2C-201ENST00000326407 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.2■■□□□ 1.3
ITM2C-201ENST00000326407 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
ITM2C-201ENST00000326407 KIF3BO15066 747 aa23.17■■□□□ 1.3
ITM2C-201ENST00000326407 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.17■■□□□ 1.3
ITM2C-201ENST00000326407 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.15■■□□□ 1.3
ITM2C-201ENST00000326407 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
ITM2C-201ENST00000326407 CCDC7Q96M83 1385 aa23.14■■□□□ 1.3
ITM2C-201ENST00000326407 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.13■■□□□ 1.29
ITM2C-201ENST00000326407 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
ITM2C-201ENST00000326407 DEPDC5O75140 1603 aa23.09■■□□□ 1.29
ITM2C-201ENST00000326407 GGT6Q6P531 493 aa23.09■■□□□ 1.29
ITM2C-201ENST00000326407 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.07■■□□□ 1.28
ITM2C-201ENST00000326407 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.07■■□□□ 1.28
ITM2C-201ENST00000326407 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.07■■□□□ 1.28
ITM2C-201ENST00000326407 UNC13BO14795 1591 aa23.07■■□□□ 1.28
ITM2C-201ENST00000326407 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
ITM2C-201ENST00000326407 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
ITM2C-201ENST00000326407 MLECQ14165 292 aa23.06■■□□□ 1.28
ITM2C-201ENST00000326407 FKBP8Q14318 412 aa23.04■■□□□ 1.28
ITM2C-201ENST00000326407 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
ITM2C-201ENST00000326407 NEFLP07196 543 aa23.02■■□□□ 1.28
ITM2C-201ENST00000326407 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.02■■□□□ 1.27
ITM2C-201ENST00000326407 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
ITM2C-201ENST00000326407 KANK1Q14678 1352 aa23.01■■□□□ 1.27
ITM2C-201ENST00000326407 KIF7Q2M1P5 1343 aa23■■□□□ 1.27
ITM2C-201ENST00000326407 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.99■■□□□ 1.27
ITM2C-201ENST00000326407 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.99■■□□□ 1.27
ITM2C-201ENST00000326407 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.97■■□□□ 1.27
ITM2C-201ENST00000326407 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.97■■□□□ 1.27
ITM2C-201ENST00000326407 ABCC3O15438 1527 aa22.97■■□□□ 1.27
ITM2C-201ENST00000326407 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.97■■□□□ 1.27
ITM2C-201ENST00000326407 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
ITM2C-201ENST00000326407 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ITM2C-201ENST00000326407 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.96■■□□□ 1.27
ITM2C-201ENST00000326407 USP47Q96K76 1375 aa22.95■■□□□ 1.26
ITM2C-201ENST00000326407 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ITM2C-201ENST00000326407 BCANQ96GW7 911 aa22.94■■□□□ 1.26
ITM2C-201ENST00000326407 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ITM2C-201ENST00000326407 MADDQ8WXG6 1647 aa22.92■■□□□ 1.26
ITM2C-201ENST00000326407 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.91■■□□□ 1.26
ITM2C-201ENST00000326407 CEP152O94986 1710 aa22.91■■□□□ 1.26
ITM2C-201ENST00000326407 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ITM2C-201ENST00000326407 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.9■■□□□ 1.26
ITM2C-201ENST00000326407 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.9■■□□□ 1.26
ITM2C-201ENST00000326407 TET3O43151 1660 aa22.89■■□□□ 1.25
ITM2C-201ENST00000326407 ZMYM3Q14202 1370 aa22.88■■□□□ 1.25
ITM2C-201ENST00000326407 CCDC184Q52MB2 194 aa22.88■■□□□ 1.25
ITM2C-201ENST00000326407 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.88■■□□□ 1.25
ITM2C-201ENST00000326407 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.87■■□□□ 1.25
ITM2C-201ENST00000326407 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.87■■□□□ 1.25
ITM2C-201ENST00000326407 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.87■■□□□ 1.25
ITM2C-201ENST00000326407 MROH2AA6NES4 1674 aa22.87■■□□□ 1.25
ITM2C-201ENST00000326407 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.85■■□□□ 1.25
ITM2C-201ENST00000326407 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
ITM2C-201ENST00000326407 NPATQ14207 1427 aa22.84■■□□□ 1.25
ITM2C-201ENST00000326407 MRS2Q9HD23 443 aa22.83■■□□□ 1.25
ITM2C-201ENST00000326407 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.81■■□□□ 1.24
ITM2C-201ENST00000326407 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.81■■□□□ 1.24
ITM2C-201ENST00000326407 E9PCH4 1651 aa22.81■■□□□ 1.24
ITM2C-201ENST00000326407 PLA2R1Q13018 1463 aa22.81■■□□□ 1.24
ITM2C-201ENST00000326407 PTPRMP28827 1452 aa22.8■■□□□ 1.24
ITM2C-201ENST00000326407 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
ITM2C-201ENST00000326407 C3P01024 1663 aa22.79■■□□□ 1.24
ITM2C-201ENST00000326407 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
ITM2C-201ENST00000326407 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms