RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 PLA2R1Q13018 1463 aa31.9■■■□□ 2.7
SNX18-201ENST00000326277 CCDC144AA2RUR9 1427 aa31.89■■■□□ 2.7
SNX18-201ENST00000326277 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.89■■■□□ 2.7
SNX18-201ENST00000326277 KIF7Q2M1P5 1343 aa31.88■■■□□ 2.69
SNX18-201ENST00000326277 KDM5CP41229 1560 aa31.86■■■□□ 2.69
SNX18-201ENST00000326277 DCAF11Q8TEB1 546 aa31.86■■■□□ 2.69
SNX18-201ENST00000326277 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa31.86■■■□□ 2.69
SNX18-201ENST00000326277 ADGRL1O94910 1474 aa31.79■■■□□ 2.68
SNX18-201ENST00000326277 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.79■■■□□ 2.68
SNX18-201ENST00000326277 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
SNX18-201ENST00000326277 ATP10AO60312 1499 aa31.78■■■□□ 2.68
SNX18-201ENST00000326277 ATP7AQ04656 1500 aa31.77■■■□□ 2.68
SNX18-201ENST00000326277 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.77■■■□□ 2.68
SNX18-201ENST00000326277 CARD11Q9BXL7 1154 aa31.77■■■□□ 2.68
SNX18-201ENST00000326277 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.77■■■□□ 2.68
SNX18-201ENST00000326277 RGL3Q3MIN7 710 aa31.73■■■□□ 2.67
SNX18-201ENST00000326277 PRAG1Q86YV5 1406 aa31.72■■■□□ 2.67
SNX18-201ENST00000326277 A2MP01023 1474 aa31.71■■■□□ 2.67
SNX18-201ENST00000326277 DEPDC5O75140 1603 aa31.69■■■□□ 2.66
SNX18-201ENST00000326277 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
SNX18-201ENST00000326277 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
SNX18-201ENST00000326277 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa31.67■■■□□ 2.66
SNX18-201ENST00000326277 E9PCH4 1651 aa31.67■■■□□ 2.66
SNX18-201ENST00000326277 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
SNX18-201ENST00000326277 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.65■■■□□ 2.66
SNX18-201ENST00000326277 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa31.62■■■□□ 2.65
SNX18-201ENST00000326277 POLR3GLQ9BT43 218 aa31.61■■■□□ 2.65
SNX18-201ENST00000326277 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
SNX18-201ENST00000326277 CD109Q6YHK3 1445 aa31.6■■■□□ 2.65
SNX18-201ENST00000326277 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
SNX18-201ENST00000326277 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.58■■■□□ 2.65
SNX18-201ENST00000326277 KIF3BO15066 747 aa31.58■■■□□ 2.65
SNX18-201ENST00000326277 CCDC184Q52MB2 194 aa31.58■■■□□ 2.65
SNX18-201ENST00000326277 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.58■■■□□ 2.65
SNX18-201ENST00000326277 TET3O43151 1660 aa31.57■■■□□ 2.64
SNX18-201ENST00000326277 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.57■■■□□ 2.64
SNX18-201ENST00000326277 KANK1Q14678 1352 aa31.57■■■□□ 2.64
SNX18-201ENST00000326277 TRPM2O94759 1503 aa31.56■■■□□ 2.64
SNX18-201ENST00000326277 NBPF1Q3BBV0 1214 aa31.56■■■□□ 2.64
SNX18-201ENST00000326277 GPRASP1Q5JY77 1395 aa31.55■■■□□ 2.64
SNX18-201ENST00000326277 PTPRTO14522 1441 aa31.55■■■□□ 2.64
SNX18-201ENST00000326277 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.55■■■□□ 2.64
SNX18-201ENST00000326277 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa31.54■■■□□ 2.64
SNX18-201ENST00000326277 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
SNX18-201ENST00000326277 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
SNX18-201ENST00000326277 MROH1Q8NDA8 1641 aa31.53■■■□□ 2.64
SNX18-201ENST00000326277 LAMC1P11047 1609 aa31.5■■■□□ 2.63
SNX18-201ENST00000326277 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.48■■■□□ 2.63
SNX18-201ENST00000326277 CLTCL1P53675 1640 aa31.48■■■□□ 2.63
SNX18-201ENST00000326277 CEP152O94986 1710 aa31.47■■■□□ 2.63
SNX18-201ENST00000326277 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP31.47■■■□□ 2.63
SNX18-201ENST00000326277 MRS2Q9HD23 443 aa31.47■■■□□ 2.63
SNX18-201ENST00000326277 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.41■■■□□ 2.62
SNX18-201ENST00000326277 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
SNX18-201ENST00000326277 MADDQ8WXG6 1647 aa31.39■■■□□ 2.62
SNX18-201ENST00000326277 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.38■■■□□ 2.61
SNX18-201ENST00000326277 EFCAB6Q5THR3 1501 aa31.37■■■□□ 2.61
SNX18-201ENST00000326277 FAM9BQ8IZU0 186 aa31.37■■■□□ 2.61
SNX18-201ENST00000326277 NEO1Q92859 1461 aa31.36■■■□□ 2.61
SNX18-201ENST00000326277 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
SNX18-201ENST00000326277 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa31.35■■■□□ 2.61
SNX18-201ENST00000326277 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
SNX18-201ENST00000326277 LMTK2Q8IWU2 1503 aa31.33■■■□□ 2.61
SNX18-201ENST00000326277 TESK2Q96S53 571 aa31.33■■■□□ 2.61
SNX18-201ENST00000326277 STAC3Q96MF2 364 aa31.32■■■□□ 2.6
SNX18-201ENST00000326277 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
SNX18-201ENST00000326277 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.3■■■□□ 2.6
SNX18-201ENST00000326277 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.3■■■□□ 2.6
SNX18-201ENST00000326277 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.29■■■□□ 2.6
SNX18-201ENST00000326277 ABCA6Q8N139 1617 aa31.29■■■□□ 2.6
SNX18-201ENST00000326277 DISP3Q9P2K9 1392 aa31.28■■■□□ 2.6
SNX18-201ENST00000326277 RAPGEF3O95398 923 aa31.27■■■□□ 2.6
SNX18-201ENST00000326277 FKBP8Q14318 412 aa31.25■■■□□ 2.59
SNX18-201ENST00000326277 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.25■■■□□ 2.59
SNX18-201ENST00000326277 IQGAP1P46940 1657 aa31.23■■■□□ 2.59
SNX18-201ENST00000326277 GGT6Q6P531 493 aa31.22■■■□□ 2.59
SNX18-201ENST00000326277 KIF1BO60333 1816 aa31.21■■■□□ 2.59
SNX18-201ENST00000326277 TMF1P82094 1093 aa31.2■■■□□ 2.59
SNX18-201ENST00000326277 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.2■■■□□ 2.58
SNX18-201ENST00000326277 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.2■■■□□ 2.58
SNX18-201ENST00000326277 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.2■■■□□ 2.58
SNX18-201ENST00000326277 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
SNX18-201ENST00000326277 NEFLP07196 543 aa31.18■■■□□ 2.58
SNX18-201ENST00000326277 NPATQ14207 1427 aa31.17■■■□□ 2.58
SNX18-201ENST00000326277 ZBED9Q6R2W3 1325 aa31.17■■■□□ 2.58
SNX18-201ENST00000326277 RICTORQ6R327 1708 aa31.17■■■□□ 2.58
SNX18-201ENST00000326277 RALBP1Q15311 655 aa31.17■■■□□ 2.58
SNX18-201ENST00000326277 GLI2P10070 1586 aa31.16■■■□□ 2.58
SNX18-201ENST00000326277 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.16■■■□□ 2.58
SNX18-201ENST00000326277 MYOM2P54296 1465 aa31.16■■■□□ 2.58
SNX18-201ENST00000326277 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
SNX18-201ENST00000326277 MROH2AA6NES4 1674 aa31.15■■■□□ 2.58
SNX18-201ENST00000326277 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa31.15■■■□□ 2.58
SNX18-201ENST00000326277 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
SNX18-201ENST00000326277 ABCC3O15438 1527 aa31.14■■■□□ 2.58
SNX18-201ENST00000326277 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
SNX18-201ENST00000326277 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31.12■■■□□ 2.57
SNX18-201ENST00000326277 IFT172Q9UG01 1749 aa31.12■■■□□ 2.57
SNX18-201ENST00000326277 TMC1Q8TDI8 760 aa31.12■■■□□ 2.57
SNX18-201ENST00000326277 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
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