RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322326.12

IFT20-201, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 2

Gene IFT20, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-201ENST00000322326 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.66■■□□□ 1.54
IFT20-201ENST00000322326 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.64■■□□□ 1.54
IFT20-201ENST00000322326 KIF3BO15066 747 aa24.63■■□□□ 1.53
IFT20-201ENST00000322326 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.63■■□□□ 1.53
IFT20-201ENST00000322326 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
IFT20-201ENST00000322326 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.62■■□□□ 1.53
IFT20-201ENST00000322326 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.61■■□□□ 1.53
IFT20-201ENST00000322326 SOCS7O14512 581 aa24.61■■□□□ 1.53
IFT20-201ENST00000322326 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.61■■□□□ 1.53
IFT20-201ENST00000322326 NCOA2Q15596 1464 aa24.61■■□□□ 1.53
IFT20-201ENST00000322326 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.6■■□□□ 1.53
IFT20-201ENST00000322326 TNRQ92752 1358 aa24.59■■□□□ 1.53
IFT20-201ENST00000322326 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
IFT20-201ENST00000322326 PZPP20742 1482 aa24.58■■□□□ 1.52
IFT20-201ENST00000322326 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.56■■□□□ 1.52
IFT20-201ENST00000322326 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
IFT20-201ENST00000322326 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
IFT20-201ENST00000322326 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.54■■□□□ 1.52
IFT20-201ENST00000322326 TSPY4P0CV99 314 aa24.53■■□□□ 1.52
IFT20-201ENST00000322326 TSPY10P0CW01 314 aa24.53■■□□□ 1.52
IFT20-201ENST00000322326 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
IFT20-201ENST00000322326 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.5■■□□□ 1.51
IFT20-201ENST00000322326 NLRP1Q9C000 1473 aa24.49■■□□□ 1.51
IFT20-201ENST00000322326 CPS1P31327 1500 aa24.49■■□□□ 1.51
IFT20-201ENST00000322326 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.48■■□□□ 1.51
IFT20-201ENST00000322326 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
IFT20-201ENST00000322326 MIA2Q96PC5 1412 aa24.48■■□□□ 1.51
IFT20-201ENST00000322326 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
IFT20-201ENST00000322326 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.46■■□□□ 1.51
IFT20-201ENST00000322326 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.45■■□□□ 1.51
IFT20-201ENST00000322326 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
IFT20-201ENST00000322326 TOM1O60784 492 aa24.43■■□□□ 1.5
IFT20-201ENST00000322326 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
IFT20-201ENST00000322326 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.42■■□□□ 1.5
IFT20-201ENST00000322326 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
IFT20-201ENST00000322326 DEPDC5O75140 1603 aa24.41■■□□□ 1.5
IFT20-201ENST00000322326 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
IFT20-201ENST00000322326 MED14O60244 1454 aa24.39■■□□□ 1.5
IFT20-201ENST00000322326 PIP4K2BP78356 416 aa24.39■■□□□ 1.49
IFT20-201ENST00000322326 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
IFT20-201ENST00000322326 ABCC3O15438 1527 aa24.38■■□□□ 1.49
IFT20-201ENST00000322326 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.37■■□□□ 1.49
IFT20-201ENST00000322326 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.35■■□□□ 1.49
IFT20-201ENST00000322326 HSPA1LP34931 641 aa24.35■■□□□ 1.49
IFT20-201ENST00000322326 IQGAP1P46940 1657 aa24.34■■□□□ 1.49
IFT20-201ENST00000322326 ERVK-7P63135 1459 aa24.32■■□□□ 1.48
IFT20-201ENST00000322326 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.3■■□□□ 1.48
IFT20-201ENST00000322326 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.29■■□□□ 1.48
IFT20-201ENST00000322326 CEP152O94986 1710 aa24.29■■□□□ 1.48
IFT20-201ENST00000322326 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
IFT20-201ENST00000322326 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.27■■□□□ 1.48
IFT20-201ENST00000322326 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
IFT20-201ENST00000322326 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.24■■□□□ 1.47
IFT20-201ENST00000322326 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
IFT20-201ENST00000322326 SYNMO15061 1565 aa24.24■■□□□ 1.47
IFT20-201ENST00000322326 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.23■■□□□ 1.47
IFT20-201ENST00000322326 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.22■■□□□ 1.47
IFT20-201ENST00000322326 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.22■■□□□ 1.47
IFT20-201ENST00000322326 ALKQ9UM73 1620 aa24.21■■□□□ 1.47
IFT20-201ENST00000322326 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
IFT20-201ENST00000322326 KIF15Q9NS87 1388 aa24.21■■□□□ 1.47
IFT20-201ENST00000322326 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
IFT20-201ENST00000322326 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.2■■□□□ 1.46
IFT20-201ENST00000322326 ERBINQ96RT1 1412 aa24.2■■□□□ 1.46
IFT20-201ENST00000322326 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.19■■□□□ 1.46
IFT20-201ENST00000322326 SLIT1O75093 1534 aa24.17■■□□□ 1.46
IFT20-201ENST00000322326 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.17■■□□□ 1.46
IFT20-201ENST00000322326 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.17■■□□□ 1.46
IFT20-201ENST00000322326 ABCC5O15440 1437 aa24.17■■□□□ 1.46
IFT20-201ENST00000322326 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
IFT20-201ENST00000322326 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
IFT20-201ENST00000322326 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.16■■□□□ 1.46
IFT20-201ENST00000322326 EID1Q9Y6B2 187 aa24.15■■□□□ 1.46
IFT20-201ENST00000322326 KANK1Q14678 1352 aa24.15■■□□□ 1.46
IFT20-201ENST00000322326 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.453e-6■■□□□ 11.7
IFT20-201ENST00000322326 LTKP29376 864 aa24.13■■□□□ 1.45
IFT20-201ENST00000322326 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
IFT20-201ENST00000322326 DAPK1P53355 1430 aa24.12■■□□□ 1.45
IFT20-201ENST00000322326 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.11■■□□□ 1.45
IFT20-201ENST00000322326 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
IFT20-201ENST00000322326 PIK3C2BO00750 1634 aa24.1■■□□□ 1.45
IFT20-201ENST00000322326 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.07■■□□□ 1.44
IFT20-201ENST00000322326 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.07■■□□□ 1.44
IFT20-201ENST00000322326 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
IFT20-201ENST00000322326 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.05■■□□□ 1.44
IFT20-201ENST00000322326 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.04■■□□□ 1.44
IFT20-201ENST00000322326 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
IFT20-201ENST00000322326 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.03■■□□□ 1.44
IFT20-201ENST00000322326 IDI1Q13907 227 aa24.01■■□□□ 1.43
IFT20-201ENST00000322326 NOS1P29475 1434 aa23.96■■□□□ 1.43
IFT20-201ENST00000322326 KCNA6P17658 529 aa23.96■■□□□ 1.43
IFT20-201ENST00000322326 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.95■■□□□ 1.42
IFT20-201ENST00000322326 TMEM94Q12767 1356 aa23.95■■□□□ 1.42
IFT20-201ENST00000322326 ITGAEP38570 1179 aa23.95■■□□□ 1.42
IFT20-201ENST00000322326 ADGRB3O60242 1522 aa23.94■■□□□ 1.42
IFT20-201ENST00000322326 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.94■■□□□ 1.42
IFT20-201ENST00000322326 ADGRL2O95490 1459 aa23.94■■□□□ 1.42
IFT20-201ENST00000322326 TET3O43151 1660 aa23.93■■□□□ 1.42
IFT20-201ENST00000322326 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
IFT20-201ENST00000322326 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.93■■□□□ 1.42
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