RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 NLRP13Q86W25 1043 aa29.57■■■□□ 2.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.56■■■□□ 2.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.55■■■□□ 2.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 GRIN2AQ12879 1464 aa29.55■■■□□ 2.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIAA0556O60303 1618 aa29.55■■■□□ 2.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.54■■■□□ 2.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.54■■■□□ 2.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDE3BQ13370 1112 aa29.53■■■□□ 2.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP35Q9P2H5 1018 aa29.53■■■□□ 2.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADGRL2O95490 1459 aa29.53■■■□□ 2.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 CRBNQ96SW2 442 aa29.52■■■□□ 2.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 SYNJ2O15056 1496 aa29.5■■■□□ 2.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.49■■■□□ 2.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 E9PCH4 1651 aa29.47■■■□□ 2.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC4A3P48751 1232 aa29.47■■■□□ 2.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.45■■■□□ 2.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 C20orf194Q5TEA3 1177 aa29.44■■■□□ 2.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.44■■■□□ 2.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.43■■■□□ 2.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.43■■■□□ 2.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.42■■■□□ 2.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.42■■■□□ 2.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 CEP170Q5SW79 1584 aa29.4■■■□□ 2.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 RGL3Q3MIN7 710 aa29.38■■■□□ 2.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 BRPF3Q9ULD4 1205 aa29.36■■■□□ 2.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.36■■■□□ 2.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDRGK1Q96HY6 314 aa29.36■■■□□ 2.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 NFKBIBQ15653 356 aa29.34■■■□□ 2.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 PANK3Q9H999 370 aa29.32■■■□□ 2.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 TSPY4P0CV99 314 aa29.32■■■□□ 2.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 TSPY10P0CW01 314 aa29.32■■■□□ 2.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.31■■■□□ 2.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 GSE1Q14687 1217 aa29.31■■■□□ 2.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.3■■■□□ 2.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 KDM2BQ8NHM5 1336 aa29.28■■■□□ 2.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.27■■■□□ 2.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADAMTS8Q9UP79 889 aa29.27■■■□□ 2.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 NUP160Q12769 1436 aa29.26■■■□□ 2.28
GRAMD1A-201ENST00000317991 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.26■■■□□ 2.27
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.26■■■□□ 2.27
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.25■■■□□ 2.27
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHD1O14646 1710 aa29.25■■■□□ 2.27
GRAMD1A-201ENST00000317991 TESK2Q96S53 571 aa29.25■■■□□ 2.27
GRAMD1A-201ENST00000317991 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.23■■■□□ 2.27
GRAMD1A-201ENST00000317991 PTPRGP23470 1445 aa29.23■■■□□ 2.27
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.22■■■□□ 2.27
GRAMD1A-201ENST00000317991 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
GRAMD1A-201ENST00000317991 JPH4Q96JJ6 628 aa29.2■■■□□ 2.27
GRAMD1A-201ENST00000317991 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.19■■■□□ 2.26
GRAMD1A-201ENST00000317991 C8orf34Q49A92 452 aa29.19■■■□□ 2.26
GRAMD1A-201ENST00000317991 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.18■■■□□ 2.26
GRAMD1A-201ENST00000317991 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.18■■■□□ 2.26
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.17■■■□□ 2.26
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM161AQ3B820 660 aa29.17■■■□□ 2.26
GRAMD1A-201ENST00000317991 RGS3P49796 1198 aa29.16■■■□□ 2.26
GRAMD1A-201ENST00000317991 DUSP27Q5VZP5 1158 aa29.16■■■□□ 2.26
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.15■■■□□ 2.26
GRAMD1A-201ENST00000317991 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.15■■■□□ 2.26
GRAMD1A-201ENST00000317991 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.14■■■□□ 2.264e-8■■■□□ 15.2
GRAMD1A-201ENST00000317991 INSRP06213 1382 aa29.13■■■□□ 2.25
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERBINQ96RT1 1412 aa29.13■■■□□ 2.25
GRAMD1A-201ENST00000317991 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.13■■■□□ 2.25
GRAMD1A-201ENST00000317991 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
GRAMD1A-201ENST00000317991 A2MP01023 1474 aa29.11■■■□□ 2.25
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMF1P82094 1093 aa29.1■■■□□ 2.25
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.1■■■□□ 2.25
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLA2R1Q13018 1463 aa29.09■■■□□ 2.25
GRAMD1A-201ENST00000317991 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP29.07■■■□□ 2.24
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP2R1AP30153 589 aa29.06■■■□□ 2.24
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP10BO94823 1461 aa29.05■■■□□ 2.24
GRAMD1A-201ENST00000317991 GOLGA2Q08379 1002 aa29.05■■■□□ 2.24
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF521Q96K83 1311 aa29.03■■■□□ 2.24
GRAMD1A-201ENST00000317991 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.02■■■□□ 2.24
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC146Q8IYE0 955 aa29■■■□□ 2.23
GRAMD1A-201ENST00000317991 KNSTRNQ9Y448 316 aa29■■■□□ 2.23
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAGI2Q86UL8 1455 aa29■■■□□ 2.23
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
GRAMD1A-201ENST00000317991 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLFN5Q08AF3 891 aa28.97■■■□□ 2.23
GRAMD1A-201ENST00000317991 ABCA8O94911 1581 aa28.97■■■□□ 2.23
GRAMD1A-201ENST00000317991 BCAR3O75815 825 aa28.97■■■□□ 2.23
GRAMD1A-201ENST00000317991 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.95■■■□□ 2.22
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.95■■■□□ 2.22
GRAMD1A-201ENST00000317991 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.93■■■□□ 2.22
GRAMD1A-201ENST00000317991 IGHDP01880 384 aa28.92■■■□□ 2.22
GRAMD1A-201ENST00000317991 LAMC1P11047 1609 aa28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms