RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 NEO1Q92859 1461 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 NUP155O75694 1391 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 ATP7AQ04656 1500 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXA3-201ENST00000317201 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXA3-201ENST00000317201 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXA3-201ENST00000317201 KDM5CP41229 1560 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXA3-201ENST00000317201 AFAP1Q8N556 730 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXA3-201ENST00000317201 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 PKD2Q13563 968 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 PLEKHG5O94827 1062 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 DEPDC5O75140 1603 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 FOXD1Q16676 465 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 DIP2BQ9P265 1576 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXA3-201ENST00000317201 ATP10AO60312 1499 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXA3-201ENST00000317201 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXA3-201ENST00000317201 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA3-201ENST00000317201 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA3-201ENST00000317201 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXA3-201ENST00000317201 RICTORQ6R327 1708 aa20.51■□□□□ 0.87
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HOXA3-201ENST00000317201 A2MP01023 1474 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 TET3O43151 1660 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 KANK1Q14678 1352 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 PLA2R1Q13018 1463 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 ABCA6Q8N139 1617 aa20.45■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 IL27Q8NEV9 243 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 E9PCH4 1651 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 PTPRTO14522 1441 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 KIF3BO15066 747 aa20.41■□□□□ 0.86
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HOXA3-201ENST00000317201 NBR1Q14596 966 aa20.39■□□□□ 0.85
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HOXA3-201ENST00000317201 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXA3-201ENST00000317201 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA3-201ENST00000317201 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA3-201ENST00000317201 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA3-201ENST00000317201 REREQ9P2R6 1566 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXA3-201ENST00000317201 TSPOAP1O95153 1857 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA3-201ENST00000317201 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXA3-201ENST00000317201 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXA3-201ENST00000317201 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
HOXA3-201ENST00000317201 CEP152O94986 1710 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXA3-201ENST00000317201 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HOXA3-201ENST00000317201 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXA3-201ENST00000317201 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXA3-201ENST00000317201 STAC3Q96MF2 364 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXA3-201ENST00000317201 ABCC3O15438 1527 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXA3-201ENST00000317201 CLTCL1P53675 1640 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXA3-201ENST00000317201 AGLP35573 1532 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 LAMC1P11047 1609 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 NPATQ14207 1427 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
HOXA3-201ENST00000317201 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA3-201ENST00000317201 GGT6Q6P531 493 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA3-201ENST00000317201 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA3-201ENST00000317201 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA3-201ENST00000317201 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXA3-201ENST00000317201 KIF1BO60333 1816 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA3-201ENST00000317201 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXA3-201ENST00000317201 USP47Q96K76 1375 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA3-201ENST00000317201 NOS1P29475 1434 aa20.16■□□□□ 0.82
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