RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308478.9

LRRN3-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN3, Length 3,099 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 ADAMTS8Q9UP79 889 aa8.08□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.08□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 ESPNB1AK53 854 aa8.08□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa8.07□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 IGHDP01880 384 aa8.07□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 MCM4P33991 863 aa8.07□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 ANTXR1Q9H6X2 564 aa8.07□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 FSD2A1L4K1 749 aa8.06□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 TRAK2O60296 914 aa8.06□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.06□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa8.06□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.06□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 MRE11P49959 708 aa8.06□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 GOLGA2Q08379 1002 aa8.06□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.06□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 PARD3Q8TEW0 1356 aa8.05□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.05□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 KDM5CP41229 1560 aa8.05□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 NPM3O75607 178 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 BCAR3O75815 825 aa8.05□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 GRIN2BQ13224 1484 aa8.05□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 ERBB4Q15303 1308 aa8.05□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 PANK3Q9H999 370 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 GRPEL1Q9HAV7 217 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 PDCL3Q9H2J4 239 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 CANXP27824 592 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 DAPK1P53355 1430 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 RBM10P98175 930 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa8.02□□□□□ -1.12
LRRN3-201ENST00000308478 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 CCDC146Q8IYE0 955 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 COG6Q9Y2V7 657 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 ABCC5O15440 1437 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 ROCK1Q13464 1354 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 TPM2P07951 284 aa8.01□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 ARHGEF11O15085 1522 aa8.01□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 MBD5Q9P267 1494 aa8.01□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa8.01□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 RGL3Q3MIN7 710 aa8.01□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 PANK1Q8TE04 598 aa8.01□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.01□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 ARID3AQ99856 593 aa8.01□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 CHMP5Q9NZZ3 219 aa8.01□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 PZPP20742 1482 aa8.01□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 CADPSQ9ULU8 1353 aa8□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 KIF14Q15058 1648 aa8□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 SLFN5Q08AF3 891 aa8□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa8□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 CLUAP1Q96AJ1 413 aa8□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 FAM13BQ9NYF5 915 aa8□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 HMGXB3Q12766 1538 aa8□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 RALGAPBQ86X10 1494 aa8□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 APAF1O14727 1248 aa7.99□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 ZBTB22O15209 634 aa7.99□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa7.98□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 NUP155O75694 1391 aa7.98□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 GAS2L3Q86XJ1 694 aa7.98□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 DDX11L8A8MPP1 907 aa7.98□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 CGNL1Q0VF96 1302 aa7.98□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 SLC24A1O60721 1099 aa7.97□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa7.97□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 PPP2R1AP30153 589 aa7.97□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 C22orf23Q9BZE7 217 aa7.97□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.97□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 KNSTRNQ9Y448 316 aa7.97□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 MSNP26038 577 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 SAMD9Q5K651 1589 aa7.96□□□□□ -1.13
LRRN3-201ENST00000308478 HSCBQ8IWL3 235 aa7.96□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 PRDM4Q9UKN5 801 aa7.96□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF521Q96K83 1311 aa7.96□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa7.96□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 DISP3Q9P2K9 1392 aa7.95□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 NLRP1Q9C000 1473 aa7.95□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 TMF1P82094 1093 aa7.95□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 PDE3AQ14432 1141 aa7.95□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms