RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRAK2O60296 914 aa18.8■□□□□ 0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 RRP9O43818 475 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 NBPF1Q3BBV0 1214 aa18.79■□□□□ 0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa18.79■□□□□ 0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 APAF1O14727 1248 aa18.78■□□□□ 0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 NCLP19338 710 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLEKHG5O94827 1062 aa18.77■□□□□ 0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 KDM2BQ8NHM5 1336 aa18.77■□□□□ 0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 ESPNB1AK53 854 aa18.76■□□□□ 0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM13BQ9NYF5 915 aa18.76■□□□□ 0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 NUP155O75694 1391 aa18.76■□□□□ 0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 MCM4P33991 863 aa18.75■□□□□ 0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 TBC1D2Q9BYX2 928 aa18.75■□□□□ 0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.75■□□□□ 0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 KDM6BO15054 1643 aa18.74■□□□□ 0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 CLCN1P35523 988 aa18.73■□□□□ 0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 DUSP27Q5VZP5 1158 aa18.73■□□□□ 0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 MIA2Q96PC5 1412 aa18.73■□□□□ 0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 GRPEL1Q9HAV7 217 aa18.71■□□□□ 0.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 CFAP43Q8NDM7 1665 aa18.7■□□□□ 0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 MRE11P49959 708 aa18.7■□□□□ 0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 HSCBQ8IWL3 235 aa18.7■□□□□ 0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa18.68■□□□□ 0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 MSNP26038 577 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMF1P82094 1093 aa18.67■□□□□ 0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 TSPY4P0CV99 314 aa18.67■□□□□ 0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 TSPY10P0CW01 314 aa18.67■□□□□ 0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 TEX14Q8IWB6 1497 aa18.66■□□□□ 0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHMP5Q9NZZ3 219 aa18.65■□□□□ 0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa18.65■□□□□ 0.58
CCNDBP1-201ENST00000300213 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 TPRNQ4KMQ1 711 aa18.64■□□□□ 0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa18.64■□□□□ 0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 CADPSQ9ULU8 1353 aa18.64■□□□□ 0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa18.63■□□□□ 0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 C22orf23Q9BZE7 217 aa18.63■□□□□ 0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 USP19O94966 1318 aa18.62■□□□□ 0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 TNNQ9UQP3 1299 aa18.61■□□□□ 0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 PPP2R1AP30153 589 aa18.61■□□□□ 0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRDM10Q9NQV6 1147 aa18.6■□□□□ 0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 ERBB4Q15303 1308 aa18.6■□□□□ 0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLFN5Q08AF3 891 aa18.6■□□□□ 0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 CGNL1Q0VF96 1302 aa18.58■□□□□ 0.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 BCORL1Q5H9F3 1711 aa18.57■□□□□ 0.56
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CCNDBP1-201ENST00000300213 DDX11L8A8MPP1 907 aa18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 TBC1D32Q96NH3 1257 aa18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 NESP48681 1621 aa18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANTXR1Q9H6X2 564 aa18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 PARD3Q8TEW0 1356 aa18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 EFCAB5A4FU69 1503 aa18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 ABCC5O15440 1437 aa18.54■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 GBP4Q96PP9 640 aa18.54■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa18.54■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.54■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 E9PSI1 815 aa18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 MPNDQ8N594 471 aa18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 GOLGA6L22H0YM25 854 aa18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 NASPP49321 788 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 PDCL3Q9H2J4 239 aa18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 GAS2L3Q86XJ1 694 aa18.52■□□□□ 0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 TPM2P07951 284 aa18.51■□□□□ 0.55
CCNDBP1-201ENST00000300213 DISP3Q9P2K9 1392 aa18.51■□□□□ 0.55
CCNDBP1-201ENST00000300213 FSD2A1L4K1 749 aa18.51■□□□□ 0.55
CCNDBP1-201ENST00000300213 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CCNDBP1-201ENST00000300213 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CCNDBP1-201ENST00000300213 HECW1Q76N89 1606 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-201ENST00000300213 ITPRIPQ8IWB1 547 aa18.5■□□□□ 0.55
CCNDBP1-201ENST00000300213 PTMAP06454 111 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.49■□□□□ 0.55
CCNDBP1-201ENST00000300213 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CCNDBP1-201ENST00000300213 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-201ENST00000300213 UGGT2Q9NYU1 1516 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-201ENST00000300213 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.48■□□□□ 0.55
CCNDBP1-201ENST00000300213 RLBP1P12271 317 aa18.47■□□□□ 0.55
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