RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300013.8

SAAL1-201, Transcript of serum amyloid A like 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene SAAL1, Length 1,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAAL1-201ENST00000300013 RAPGEF3O95398 923 aa26.98■■□□□ 1.91
SAAL1-201ENST00000300013 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.98■■□□□ 1.91
SAAL1-201ENST00000300013 A2MP01023 1474 aa26.97■■□□□ 1.91
SAAL1-201ENST00000300013 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.97■■□□□ 1.91
SAAL1-201ENST00000300013 ABCA6Q8N139 1617 aa26.97■■□□□ 1.91
SAAL1-201ENST00000300013 PKD2Q13563 968 aa26.96■■□□□ 1.91
SAAL1-201ENST00000300013 FOXD1Q16676 465 aa26.95■■□□□ 1.91
SAAL1-201ENST00000300013 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.95■■□□□ 1.91
SAAL1-201ENST00000300013 TONSLQ96HA7 1378 aa26.94■■□□□ 1.9
SAAL1-201ENST00000300013 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.94■■□□□ 1.95e-6■■■■□ 19.5
SAAL1-201ENST00000300013 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.91■■□□□ 1.9
SAAL1-201ENST00000300013 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.9■■□□□ 1.9
SAAL1-201ENST00000300013 KANK1Q14678 1352 aa26.89■■□□□ 1.89
SAAL1-201ENST00000300013 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SAAL1-201ENST00000300013 KIF3BO15066 747 aa26.88■■□□□ 1.89
SAAL1-201ENST00000300013 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SAAL1-201ENST00000300013 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SAAL1-201ENST00000300013 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.85■■□□□ 1.89
SAAL1-201ENST00000300013 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.84■■□□□ 1.89
SAAL1-201ENST00000300013 TET3O43151 1660 aa26.83■■□□□ 1.89
SAAL1-201ENST00000300013 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.8■■□□□ 1.88
SAAL1-201ENST00000300013 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
SAAL1-201ENST00000300013 E9PCH4 1651 aa26.77■■□□□ 1.88
SAAL1-201ENST00000300013 ATP10AO60312 1499 aa26.76■■□□□ 1.87
SAAL1-201ENST00000300013 REREQ9P2R6 1566 aa26.75■■□□□ 1.87
SAAL1-201ENST00000300013 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SAAL1-201ENST00000300013 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.74■■□□□ 1.87
SAAL1-201ENST00000300013 CEP152O94986 1710 aa26.73■■□□□ 1.87
SAAL1-201ENST00000300013 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SAAL1-201ENST00000300013 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.71■■□□□ 1.87
SAAL1-201ENST00000300013 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.7■■□□□ 1.87
SAAL1-201ENST00000300013 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.7■■□□□ 1.87
SAAL1-201ENST00000300013 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
SAAL1-201ENST00000300013 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.69■■□□□ 1.86
SAAL1-201ENST00000300013 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.69■■□□□ 1.86
SAAL1-201ENST00000300013 PLA2R1Q13018 1463 aa26.68■■□□□ 1.86
SAAL1-201ENST00000300013 GGT6Q6P531 493 aa26.68■■□□□ 1.86
SAAL1-201ENST00000300013 AGLP35573 1532 aa26.67■■□□□ 1.86
SAAL1-201ENST00000300013 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SAAL1-201ENST00000300013 TRPM2O94759 1503 aa26.65■■□□□ 1.86
SAAL1-201ENST00000300013 ABCC3O15438 1527 aa26.63■■□□□ 1.85
SAAL1-201ENST00000300013 PTPRTO14522 1441 aa26.63■■□□□ 1.85
SAAL1-201ENST00000300013 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.61■■□□□ 1.85
SAAL1-201ENST00000300013 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.61■■□□□ 1.85
SAAL1-201ENST00000300013 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.54■■□□□ 1.84
SAAL1-201ENST00000300013 CLTCL1P53675 1640 aa26.53■■□□□ 1.84
SAAL1-201ENST00000300013 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.53■■□□□ 1.84
SAAL1-201ENST00000300013 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SAAL1-201ENST00000300013 NPATQ14207 1427 aa26.52■■□□□ 1.84
SAAL1-201ENST00000300013 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.51■■□□□ 1.83
SAAL1-201ENST00000300013 KIF1BO60333 1816 aa26.49■■□□□ 1.83
SAAL1-201ENST00000300013 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.48■■□□□ 1.83
SAAL1-201ENST00000300013 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.48■■□□□ 1.83
SAAL1-201ENST00000300013 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.47■■□□□ 1.83
SAAL1-201ENST00000300013 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.46■■□□□ 1.83
SAAL1-201ENST00000300013 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.45■■□□□ 1.83
SAAL1-201ENST00000300013 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.45■■□□□ 1.83
SAAL1-201ENST00000300013 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
SAAL1-201ENST00000300013 RGL3Q3MIN7 710 aa26.43■■□□□ 1.82
SAAL1-201ENST00000300013 NOS1P29475 1434 aa26.41■■□□□ 1.82
SAAL1-201ENST00000300013 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.4■■□□□ 1.82
SAAL1-201ENST00000300013 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.4■■□□□ 1.82
SAAL1-201ENST00000300013 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.4■■□□□ 1.82
SAAL1-201ENST00000300013 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
SAAL1-201ENST00000300013 STAC3Q96MF2 364 aa26.38■■□□□ 1.81
SAAL1-201ENST00000300013 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.37■■□□□ 1.81
SAAL1-201ENST00000300013 PIK3C2BO00750 1634 aa26.36■■□□□ 1.81
SAAL1-201ENST00000300013 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
SAAL1-201ENST00000300013 SYNMO15061 1565 aa26.36■■□□□ 1.81
SAAL1-201ENST00000300013 MLECQ14165 292 aa26.36■■□□□ 1.81
SAAL1-201ENST00000300013 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
SAAL1-201ENST00000300013 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.35■■□□□ 1.81
SAAL1-201ENST00000300013 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.34■■□□□ 1.81
SAAL1-201ENST00000300013 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
SAAL1-201ENST00000300013 MROH2AA6NES4 1674 aa26.33■■□□□ 1.81
SAAL1-201ENST00000300013 ADGRB3O60242 1522 aa26.33■■□□□ 1.81
SAAL1-201ENST00000300013 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.32■■□□□ 1.8
SAAL1-201ENST00000300013 IFT172Q9UG01 1749 aa26.31■■□□□ 1.8
SAAL1-201ENST00000300013 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.29■■□□□ 1.8
SAAL1-201ENST00000300013 ERVK-7P63135 1459 aa26.29■■□□□ 1.8
SAAL1-201ENST00000300013 MADDQ8WXG6 1647 aa26.27■■□□□ 1.8
SAAL1-201ENST00000300013 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
SAAL1-201ENST00000300013 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.25■■□□□ 1.79
SAAL1-201ENST00000300013 MYOM2P54296 1465 aa26.25■■□□□ 1.79
SAAL1-201ENST00000300013 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
SAAL1-201ENST00000300013 LAMC1P11047 1609 aa26.24■■□□□ 1.79
SAAL1-201ENST00000300013 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
SAAL1-201ENST00000300013 PPLO60437 1756 aa26.23■■□□□ 1.79
SAAL1-201ENST00000300013 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SAAL1-201ENST00000300013 ZMYM3Q14202 1370 aa26.22■■□□□ 1.79
SAAL1-201ENST00000300013 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.22■■□□□ 1.79
SAAL1-201ENST00000300013 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.21■■□□□ 1.79
SAAL1-201ENST00000300013 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.21■■□□□ 1.79
SAAL1-201ENST00000300013 IDI1Q13907 227 aa26.2■■□□□ 1.79
SAAL1-201ENST00000300013 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
SAAL1-201ENST00000300013 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.2■■□□□ 1.78
SAAL1-201ENST00000300013 USP47Q96K76 1375 aa26.2■■□□□ 1.78
SAAL1-201ENST00000300013 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.19■■□□□ 1.78
SAAL1-201ENST00000300013 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.18■■□□□ 1.78
SAAL1-201ENST00000300013 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms