RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 CHMP3Q9Y3E7 222 aa30.02■■■□□ 2.4
GNPTAB-201ENST00000299314 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.01■■■□□ 2.4
GNPTAB-201ENST00000299314 HDAC5Q9UQL6 1122 aa30.01■■■□□ 2.39
GNPTAB-201ENST00000299314 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa30■■■□□ 2.39
GNPTAB-201ENST00000299314 RSPH6AQ9H0K4 717 aa30■■■□□ 2.39
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC4A3P48751 1232 aa30■■■□□ 2.39
GNPTAB-201ENST00000299314 GSE1Q14687 1217 aa30■■■□□ 2.39
GNPTAB-201ENST00000299314 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
GNPTAB-201ENST00000299314 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF16BQ96L93 1317 aa29.99■■■□□ 2.39
GNPTAB-201ENST00000299314 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.99■■■□□ 2.39
GNPTAB-201ENST00000299314 RRP1P56182 461 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
GNPTAB-201ENST00000299314 EXOC6Q8TAG9 804 aa29.94■■■□□ 2.38
GNPTAB-201ENST00000299314 PLIN1O60240 522 aa29.94■■■□□ 2.38
GNPTAB-201ENST00000299314 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
GNPTAB-201ENST00000299314 TAF7LQ5H9L4 462 aa29.93■■■□□ 2.38
GNPTAB-201ENST00000299314 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.93■■■□□ 2.38
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
GNPTAB-201ENST00000299314 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
GNPTAB-201ENST00000299314 RASSF8Q8NHQ8 419 aa29.91■■■□□ 2.38
GNPTAB-201ENST00000299314 CREBRFQ8IUR6 639 aa29.9■■■□□ 2.38
GNPTAB-201ENST00000299314 CRBNQ96SW2 442 aa29.9■■■□□ 2.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.89■■■□□ 2.37
GNPTAB-201ENST00000299314 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
GNPTAB-201ENST00000299314 PANK3Q9H999 370 aa29.88■■■□□ 2.37
GNPTAB-201ENST00000299314 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.88■■■□□ 2.37
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF3AQ9Y496 699 aa29.87■■■□□ 2.37
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD45Q5TZF3 282 aa29.87■■■□□ 2.37
GNPTAB-201ENST00000299314 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF3BO15066 747 aa29.86■■■□□ 2.37
GNPTAB-201ENST00000299314 TPM3P06753 285 aa29.86■■■□□ 2.37
GNPTAB-201ENST00000299314 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.85■■■□□ 2.37
GNPTAB-201ENST00000299314 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.84■■■□□ 2.37
GNPTAB-201ENST00000299314 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.84■■■□□ 2.37
GNPTAB-201ENST00000299314 BCL2L13Q9BXK5 485 aa29.84■■■□□ 2.37
GNPTAB-201ENST00000299314 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
GNPTAB-201ENST00000299314 E9PSI1 815 aa29.84■■■□□ 2.37
GNPTAB-201ENST00000299314 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
GNPTAB-201ENST00000299314 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.83■■■□□ 2.37
GNPTAB-201ENST00000299314 RILPL2Q969X0 211 aa29.83■■■□□ 2.37
GNPTAB-201ENST00000299314 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa29.82■■■□□ 2.36
GNPTAB-201ENST00000299314 H3BQV1 296 aa29.82■■■□□ 2.36
GNPTAB-201ENST00000299314 IFFO2Q5TF58 517 aa29.82■■■□□ 2.36
GNPTAB-201ENST00000299314 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.82■■■□□ 2.36
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa29.79■■■□□ 2.36
GNPTAB-201ENST00000299314 AMPHP49418 695 aa29.79■■■□□ 2.36
GNPTAB-201ENST00000299314 TOMM22Q9NS69 142 aa29.78■■■□□ 2.36
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.77■■■□□ 2.36
GNPTAB-201ENST00000299314 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
GNPTAB-201ENST00000299314 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
GNPTAB-201ENST00000299314 COG6Q9Y2V7 657 aa29.77■■■□□ 2.36
GNPTAB-201ENST00000299314 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.77■■■□□ 2.36
GNPTAB-201ENST00000299314 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa29.76■■■□□ 2.36
GNPTAB-201ENST00000299314 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.76■■■□□ 2.35
GNPTAB-201ENST00000299314 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
GNPTAB-201ENST00000299314 PDE4CQ08493 712 aa29.75■■■□□ 2.35
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM184AQ8NB25 1140 aa29.74■■■□□ 2.35
GNPTAB-201ENST00000299314 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
GNPTAB-201ENST00000299314 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
GNPTAB-201ENST00000299314 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.72■■■□□ 2.35
GNPTAB-201ENST00000299314 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
GNPTAB-201ENST00000299314 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.72■■■□□ 2.35
GNPTAB-201ENST00000299314 BECN2A8MW95 431 aa29.71■■■□□ 2.35
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.71■■■□□ 2.35
GNPTAB-201ENST00000299314 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
GNPTAB-201ENST00000299314 VSIG10Q8N0Z9 540 aa29.7■■■□□ 2.34
GNPTAB-201ENST00000299314 PES1O00541 588 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
GNPTAB-201ENST00000299314 USP47Q96K76 1375 aa29.68■■■□□ 2.34
GNPTAB-201ENST00000299314 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
GNPTAB-201ENST00000299314 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
GNPTAB-201ENST00000299314 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.67■■■□□ 2.34
GNPTAB-201ENST00000299314 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
GNPTAB-201ENST00000299314 CHMP4CQ96CF2 233 aa29.66■■■□□ 2.34
GNPTAB-201ENST00000299314 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
GNPTAB-201ENST00000299314 CHMP5Q9NZZ3 219 aa29.64■■■□□ 2.33
GNPTAB-201ENST00000299314 CEP89Q96ST8 783 aa29.63■■■□□ 2.33
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX19BQ9UMR2 479 aa29.63■■■□□ 2.33
GNPTAB-201ENST00000299314 SMARCA2P51531 1590 aa29.63■■■□□ 2.33
GNPTAB-201ENST00000299314 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa29.63■■■□□ 2.33
GNPTAB-201ENST00000299314 APAF1O14727 1248 aa29.62■■■□□ 2.33
GNPTAB-201ENST00000299314 REC8O95072 547 aa29.62■■■□□ 2.33
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF592Q92610 1267 aa29.62■■■□□ 2.33
GNPTAB-201ENST00000299314 MARCH6O60337 910 aa29.62■■■□□ 2.33
GNPTAB-201ENST00000299314 SETQ01105 290 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
GNPTAB-201ENST00000299314 MCTP1Q6DN14 999 aa29.61■■■□□ 2.33
GNPTAB-201ENST00000299314 EID1Q9Y6B2 187 aa29.6■■■□□ 2.33
GNPTAB-201ENST00000299314 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.6■■■□□ 2.33
GNPTAB-201ENST00000299314 NUTM2FA1L443 756 aa29.59■■■□□ 2.33
GNPTAB-201ENST00000299314 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
GNPTAB-201ENST00000299314 TPM1P09493 284 aa29.59■■■□□ 2.33
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
GNPTAB-201ENST00000299314 UACAQ9BZF9 1416 aa29.58■■■□□ 2.33
GNPTAB-201ENST00000299314 GPS2Q13227 327 aa29.58■■■□□ 2.33
GNPTAB-201ENST00000299314 COG3Q96JB2 828 aa29.57■■■□□ 2.32
GNPTAB-201ENST00000299314 RUFY2Q8WXA3 655 aa29.56■■■□□ 2.32
GNPTAB-201ENST00000299314 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
GNPTAB-201ENST00000299314 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS53Q5VIR6 699 aa29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.4 ms