RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299299.3

PCBD1-201, Transcript of pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PCBD1, Length 1,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBD1-201ENST00000299299 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.82■□□□□ 0.92
PCBD1-201ENST00000299299 ZMYM3Q14202 1370 aa20.82■□□□□ 0.92
PCBD1-201ENST00000299299 DAPK1P53355 1430 aa20.81■□□□□ 0.92
PCBD1-201ENST00000299299 KIF3BO15066 747 aa20.81■□□□□ 0.92
PCBD1-201ENST00000299299 NPATQ14207 1427 aa20.8■□□□□ 0.92
PCBD1-201ENST00000299299 NCOA1Q15788 1441 aa20.8■□□□□ 0.92
PCBD1-201ENST00000299299 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.8■□□□□ 0.92
PCBD1-201ENST00000299299 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PCBD1-201ENST00000299299 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.8■□□□□ 0.92
PCBD1-201ENST00000299299 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.79■□□□□ 0.92
PCBD1-201ENST00000299299 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.78■□□□□ 0.92
PCBD1-201ENST00000299299 ILDR2Q71H61 639 aa20.78■□□□□ 0.92
PCBD1-201ENST00000299299 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.78■□□□□ 0.92
PCBD1-201ENST00000299299 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.77■□□□□ 0.92
PCBD1-201ENST00000299299 KIF15Q9NS87 1388 aa20.76■□□□□ 0.91
PCBD1-201ENST00000299299 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PCBD1-201ENST00000299299 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PCBD1-201ENST00000299299 SOCS7O14512 581 aa20.76■□□□□ 0.91
PCBD1-201ENST00000299299 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.76■□□□□ 0.91
PCBD1-201ENST00000299299 PTPRKQ15262 1439 aa20.76■□□□□ 0.91
PCBD1-201ENST00000299299 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.73■□□□□ 0.91
PCBD1-201ENST00000299299 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.71■□□□□ 0.91
PCBD1-201ENST00000299299 ERBINQ96RT1 1412 aa20.71■□□□□ 0.91
PCBD1-201ENST00000299299 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
PCBD1-201ENST00000299299 PZPP20742 1482 aa20.71■□□□□ 0.91
PCBD1-201ENST00000299299 ABCC3O15438 1527 aa20.7■□□□□ 0.9
PCBD1-201ENST00000299299 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
PCBD1-201ENST00000299299 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.69■□□□□ 0.9
PCBD1-201ENST00000299299 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.68■□□□□ 0.9
PCBD1-201ENST00000299299 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
PCBD1-201ENST00000299299 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
PCBD1-201ENST00000299299 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.67■□□□□ 0.9
PCBD1-201ENST00000299299 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
PCBD1-201ENST00000299299 ADGRL2O95490 1459 aa20.67■□□□□ 0.9
PCBD1-201ENST00000299299 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
PCBD1-201ENST00000299299 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.66■□□□□ 0.9
PCBD1-201ENST00000299299 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.66■□□□□ 0.9
PCBD1-201ENST00000299299 PLA2R1Q13018 1463 aa20.66■□□□□ 0.9
PCBD1-201ENST00000299299 PKD2Q13563 968 aa20.64■□□□□ 0.89
PCBD1-201ENST00000299299 TNRQ92752 1358 aa20.63■□□□□ 0.89
PCBD1-201ENST00000299299 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PCBD1-201ENST00000299299 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.62■□□□□ 0.89
PCBD1-201ENST00000299299 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PCBD1-201ENST00000299299 DEPDC5O75140 1603 aa20.61■□□□□ 0.89
PCBD1-201ENST00000299299 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.61■□□□□ 0.89
PCBD1-201ENST00000299299 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
PCBD1-201ENST00000299299 CEP152O94986 1710 aa20.58■□□□□ 0.89
PCBD1-201ENST00000299299 ERVK-7P63135 1459 aa20.58■□□□□ 0.89
PCBD1-201ENST00000299299 NLRP1Q9C000 1473 aa20.55■□□□□ 0.88
PCBD1-201ENST00000299299 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.54■□□□□ 0.88
PCBD1-201ENST00000299299 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PCBD1-201ENST00000299299 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
PCBD1-201ENST00000299299 KANK1Q14678 1352 aa20.53■□□□□ 0.88
PCBD1-201ENST00000299299 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.53■□□□□ 0.88
PCBD1-201ENST00000299299 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.52■□□□□ 0.87
PCBD1-201ENST00000299299 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.52■□□□□ 0.87
PCBD1-201ENST00000299299 ROCK1Q13464 1354 aa20.51■□□□□ 0.87
PCBD1-201ENST00000299299 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.49■□□□□ 0.87
PCBD1-201ENST00000299299 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PCBD1-201ENST00000299299 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.48■□□□□ 0.87
PCBD1-201ENST00000299299 ITGAEP38570 1179 aa20.48■□□□□ 0.87
PCBD1-201ENST00000299299 CPS1P31327 1500 aa20.47■□□□□ 0.87
PCBD1-201ENST00000299299 UNC13BO14795 1591 aa20.45■□□□□ 0.86
PCBD1-201ENST00000299299 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.45■□□□□ 0.86
PCBD1-201ENST00000299299 TOM1O60784 492 aa20.42■□□□□ 0.86
PCBD1-201ENST00000299299 PIP4K2BP78356 416 aa20.42■□□□□ 0.86
PCBD1-201ENST00000299299 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PCBD1-201ENST00000299299 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PCBD1-201ENST00000299299 SYNMO15061 1565 aa20.39■□□□□ 0.85
PCBD1-201ENST00000299299 HSPA1LP34931 641 aa20.39■□□□□ 0.85
PCBD1-201ENST00000299299 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.39■□□□□ 0.85
PCBD1-201ENST00000299299 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
PCBD1-201ENST00000299299 NOS1P29475 1434 aa20.38■□□□□ 0.85
PCBD1-201ENST00000299299 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PCBD1-201ENST00000299299 UBR1Q8IWV7 1749 aa20.37■□□□□ 0.85
PCBD1-201ENST00000299299 TET3O43151 1660 aa20.37■□□□□ 0.85
PCBD1-201ENST00000299299 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.36■□□□□ 0.85
PCBD1-201ENST00000299299 PIK3C2BO00750 1634 aa20.35■□□□□ 0.85
PCBD1-201ENST00000299299 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PCBD1-201ENST00000299299 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.35■□□□□ 0.85
PCBD1-201ENST00000299299 MED14O60244 1454 aa20.34■□□□□ 0.85
PCBD1-201ENST00000299299 IQGAP1P46940 1657 aa20.33■□□□□ 0.85
PCBD1-201ENST00000299299 ARHGAP23Q9P227 1491 aa20.33■□□□□ 0.85
PCBD1-201ENST00000299299 SLIT1O75093 1534 aa20.32■□□□□ 0.84
PCBD1-201ENST00000299299 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PCBD1-201ENST00000299299 ADGRB3O60242 1522 aa20.32■□□□□ 0.84
PCBD1-201ENST00000299299 NUP155O75694 1391 aa20.31■□□□□ 0.84
PCBD1-201ENST00000299299 NAIPQ13075 1403 aa20.3■□□□□ 0.84
PCBD1-201ENST00000299299 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PCBD1-201ENST00000299299 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PCBD1-201ENST00000299299 IDI1Q13907 227 aa20.28■□□□□ 0.84
PCBD1-201ENST00000299299 TMEM2Q9UHN6 1383 aa20.28■□□□□ 0.84
PCBD1-201ENST00000299299 E9PCH4 1651 aa20.28■□□□□ 0.84
PCBD1-201ENST00000299299 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PCBD1-201ENST00000299299 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.27■□□□□ 0.84
PCBD1-201ENST00000299299 HFM1A2PYH4 1435 aa20.27■□□□□ 0.83
PCBD1-201ENST00000299299 LTKP29376 864 aa20.24■□□□□ 0.83
PCBD1-201ENST00000299299 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.24■□□□□ 0.83
PCBD1-201ENST00000299299 ALKQ9UM73 1620 aa20.24■□□□□ 0.83
PCBD1-201ENST00000299299 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms