RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295314.8

TMOD4-201, Transcript of tropomodulin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD4, Length 1,267 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4-201ENST00000295314 KIF15Q9NS87 1388 aa18.27■□□□□ 0.51
TMOD4-201ENST00000295314 DUOX2Q9NRD8 1548 aa18.26■□□□□ 0.51
TMOD4-201ENST00000295314 FAM135AQ9P2D6 1515 aa18.25■□□□□ 0.51
TMOD4-201ENST00000295314 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.25■□□□□ 0.51
TMOD4-201ENST00000295314 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TMOD4-201ENST00000295314 PTPRKQ15262 1439 aa18.24■□□□□ 0.51
TMOD4-201ENST00000295314 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
TMOD4-201ENST00000295314 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
TMOD4-201ENST00000295314 KDM5DQ9BY66 1539 aa18.23■□□□□ 0.51
TMOD4-201ENST00000295314 ERBINQ96RT1 1412 aa18.22■□□□□ 0.51
TMOD4-201ENST00000295314 NCOA1Q15788 1441 aa18.21■□□□□ 0.51
TMOD4-201ENST00000295314 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
TMOD4-201ENST00000295314 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
TMOD4-201ENST00000295314 CROCC2H7BZ55 1655 aa18.18■□□□□ 0.5
TMOD4-201ENST00000295314 PZPP20742 1482 aa18.18■□□□□ 0.5
TMOD4-201ENST00000295314 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.17■□□□□ 0.5
TMOD4-201ENST00000295314 KANK1Q14678 1352 aa18.17■□□□□ 0.5
TMOD4-201ENST00000295314 TNRQ92752 1358 aa18.17■□□□□ 0.5
TMOD4-201ENST00000295314 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
TMOD4-201ENST00000295314 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.16■□□□□ 0.5
TMOD4-201ENST00000295314 ADGRL2O95490 1459 aa18.15■□□□□ 0.5
TMOD4-201ENST00000295314 ABCC3O15438 1527 aa18.13■□□□□ 0.49
TMOD4-201ENST00000295314 ITGAEP38570 1179 aa18.11■□□□□ 0.49
TMOD4-201ENST00000295314 PKD2Q13563 968 aa18.11■□□□□ 0.49
TMOD4-201ENST00000295314 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.11■□□□□ 0.49
TMOD4-201ENST00000295314 A2ML1A8K2U0 1454 aa18.11■□□□□ 0.49
TMOD4-201ENST00000295314 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
TMOD4-201ENST00000295314 PTPRTO14522 1441 aa18.1■□□□□ 0.49
TMOD4-201ENST00000295314 ROCK1Q13464 1354 aa18.1■□□□□ 0.49
TMOD4-201ENST00000295314 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
TMOD4-201ENST00000295314 MROH1Q8NDA8 1641 aa18.09■□□□□ 0.49
TMOD4-201ENST00000295314 MYO3AQ8NEV4 1616 aa18.09■□□□□ 0.49
TMOD4-201ENST00000295314 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
TMOD4-201ENST00000295314 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
TMOD4-201ENST00000295314 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa18.09■□□□□ 0.49
TMOD4-201ENST00000295314 NLRP1Q9C000 1473 aa18.08■□□□□ 0.49
TMOD4-201ENST00000295314 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa18.08■□□□□ 0.49
TMOD4-201ENST00000295314 PLA2R1Q13018 1463 aa18.07■□□□□ 0.48
TMOD4-201ENST00000295314 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa18.07■□□□□ 0.48
TMOD4-201ENST00000295314 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
TMOD4-201ENST00000295314 STRCQ7RTU9 1775 aa18.06■□□□□ 0.48
TMOD4-201ENST00000295314 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
TMOD4-201ENST00000295314 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
TMOD4-201ENST00000295314 ERVK-7P63135 1459 aa18.04■□□□□ 0.48
TMOD4-201ENST00000295314 ANKLE2Q86XL3 938 aa18.04■□□□□ 0.48
TMOD4-201ENST00000295314 DEPDC5O75140 1603 aa18.04■□□□□ 0.48
TMOD4-201ENST00000295314 CERKQ8TCT0 537 aa18.03■□□□□ 0.48
TMOD4-201ENST00000295314 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa18.03■□□□□ 0.48
TMOD4-201ENST00000295314 LMTK2Q8IWU2 1503 aa18.03■□□□□ 0.48
TMOD4-201ENST00000295314 FBXO41Q8TF61 875 aa18.02■□□□□ 0.48
TMOD4-201ENST00000295314 UGGT1Q9NYU2 1555 aa18.01■□□□□ 0.47
TMOD4-201ENST00000295314 CEP152O94986 1710 aa18.01■□□□□ 0.47
TMOD4-201ENST00000295314 VWDEQ8N2E2 1590 aa18■□□□□ 0.47
TMOD4-201ENST00000295314 STAG3Q9UJ98 1225 aa17.98■□□□□ 0.47
TMOD4-201ENST00000295314 SLC52A1Q9NWF4 448 aa17.96■□□□□ 0.47
TMOD4-201ENST00000295314 IDI1Q13907 227 aa17.95■□□□□ 0.46
TMOD4-201ENST00000295314 NUP155O75694 1391 aa17.94■□□□□ 0.46
TMOD4-201ENST00000295314 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
TMOD4-201ENST00000295314 EFCAB6Q5THR3 1501 aa17.93■□□□□ 0.46
TMOD4-201ENST00000295314 EID1Q9Y6B2 187 aa17.93■□□□□ 0.46
TMOD4-201ENST00000295314 NOS1P29475 1434 aa17.92■□□□□ 0.46
TMOD4-201ENST00000295314 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
TMOD4-201ENST00000295314 TXNDC2Q86VQ3 553 aa17.9■□□□□ 0.46
TMOD4-201ENST00000295314 UNC13BO14795 1591 aa17.9■□□□□ 0.46
TMOD4-201ENST00000295314 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
TMOD4-201ENST00000295314 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.46
TMOD4-201ENST00000295314 MED14O60244 1454 aa17.89■□□□□ 0.45
TMOD4-201ENST00000295314 NAIPQ13075 1403 aa17.88■□□□□ 0.45
TMOD4-201ENST00000295314 LTBP4Q8N2S1 1624 aa17.87■□□□□ 0.45
TMOD4-201ENST00000295314 TMEM2Q9UHN6 1383 aa17.87■□□□□ 0.45
TMOD4-201ENST00000295314 TET3O43151 1660 aa17.87■□□□□ 0.45
TMOD4-201ENST00000295314 LTKP29376 864 aa17.86■□□□□ 0.45
TMOD4-201ENST00000295314 HFM1A2PYH4 1435 aa17.85■□□□□ 0.45
TMOD4-201ENST00000295314 SLIT1O75093 1534 aa17.85■□□□□ 0.45
TMOD4-201ENST00000295314 HDGFP51858 240 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
TMOD4-201ENST00000295314 UBR1Q8IWV7 1749 aa17.85■□□□□ 0.45
TMOD4-201ENST00000295314 NEURL4Q96JN8 1562 aa17.85■□□□□ 0.45
TMOD4-201ENST00000295314 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
TMOD4-201ENST00000295314 ARHGAP23Q9P227 1491 aa17.85■□□□□ 0.45
TMOD4-201ENST00000295314 SYNMO15061 1565 aa17.84■□□□□ 0.45
TMOD4-201ENST00000295314 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
TMOD4-201ENST00000295314 IQGAP3Q86VI3 1631 aa17.83■□□□□ 0.45
TMOD4-201ENST00000295314 IQSEC2Q5JU85 1478 aa17.83■□□□□ 0.45
TMOD4-201ENST00000295314 TRIM52Q96A61 297 aa17.83■□□□□ 0.44
TMOD4-201ENST00000295314 PIK3C2BO00750 1634 aa17.83■□□□□ 0.44
TMOD4-201ENST00000295314 CHGAP10645 457 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
TMOD4-201ENST00000295314 GCC2Q8IWJ2 1684 aa17.81■□□□□ 0.44
TMOD4-201ENST00000295314 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
TMOD4-201ENST00000295314 ADGRB3O60242 1522 aa17.78■□□□□ 0.44
TMOD4-201ENST00000295314 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP17.78■□□□□ 0.44
TMOD4-201ENST00000295314 CPS1P31327 1500 aa17.77■□□□□ 0.44
TMOD4-201ENST00000295314 E9PCH4 1651 aa17.77■□□□□ 0.44
TMOD4-201ENST00000295314 IQGAP1P46940 1657 aa17.77■□□□□ 0.44
TMOD4-201ENST00000295314 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
TMOD4-201ENST00000295314 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
TMOD4-201ENST00000295314 BCANQ96GW7 911 aa17.77■□□□□ 0.44
TMOD4-201ENST00000295314 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
TMOD4-201ENST00000295314 UBAP1LF5GYI3 381 aa17.74■□□□□ 0.43
TMOD4-201ENST00000295314 RIMS2Q9UQ26 1411 aa17.73■□□□□ 0.43
TMOD4-201ENST00000295314 SLC26A8Q96RN1 970 aa17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms