RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.5■■□□□ 1.83
USP21-201ENST00000289865 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.5■■□□□ 1.83
USP21-201ENST00000289865 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.49■■□□□ 1.83
USP21-201ENST00000289865 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.48■■□□□ 1.83
USP21-201ENST00000289865 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
USP21-201ENST00000289865 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
USP21-201ENST00000289865 ABCC1P33527 1531 aa26.47■■□□□ 1.83
USP21-201ENST00000289865 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.46■■□□□ 1.83
USP21-201ENST00000289865 PLA2R1Q13018 1463 aa26.45■■□□□ 1.82
USP21-201ENST00000289865 ERBINQ96RT1 1412 aa26.43■■□□□ 1.82
USP21-201ENST00000289865 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
USP21-201ENST00000289865 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.41■■□□□ 1.82
USP21-201ENST00000289865 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.41■■□□□ 1.82
USP21-201ENST00000289865 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.4■■□□□ 1.82
USP21-201ENST00000289865 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.4■■□□□ 1.82
USP21-201ENST00000289865 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.4■■□□□ 1.82
USP21-201ENST00000289865 RGL3Q3MIN7 710 aa26.39■■□□□ 1.81
USP21-201ENST00000289865 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
USP21-201ENST00000289865 A2MP01023 1474 aa26.36■■□□□ 1.81
USP21-201ENST00000289865 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.35■■□□□ 1.81
USP21-201ENST00000289865 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.34■■□□□ 1.81
USP21-201ENST00000289865 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
USP21-201ENST00000289865 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.31■■□□□ 1.8
USP21-201ENST00000289865 ATP10AO60312 1499 aa26.31■■□□□ 1.8
USP21-201ENST00000289865 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.31■■□□□ 1.8
USP21-201ENST00000289865 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.29■■□□□ 1.8
USP21-201ENST00000289865 AFAP1Q8N556 730 aa26.29■■□□□ 1.8
USP21-201ENST00000289865 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.28■■□□□ 1.8
USP21-201ENST00000289865 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.27■■□□□ 1.8
USP21-201ENST00000289865 E9PCH4 1651 aa26.27■■□□□ 1.8
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USP21-201ENST00000289865 LAMC1P11047 1609 aa26.24■■□□□ 1.79
USP21-201ENST00000289865 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
USP21-201ENST00000289865 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.24■■□□□ 1.79
USP21-201ENST00000289865 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
USP21-201ENST00000289865 FANCAO15360 1455 aa26.22■■□□□ 1.79
USP21-201ENST00000289865 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
USP21-201ENST00000289865 ATP7AQ04656 1500 aa26.18■■□□□ 1.78
USP21-201ENST00000289865 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
USP21-201ENST00000289865 DEPDC5O75140 1603 aa26.18■■□□□ 1.78
USP21-201ENST00000289865 TMC1Q8TDI8 760 aa26.15■■□□□ 1.78
USP21-201ENST00000289865 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
USP21-201ENST00000289865 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.14■■□□□ 1.78
USP21-201ENST00000289865 TRPM2O94759 1503 aa26.14■■□□□ 1.78
USP21-201ENST00000289865 ADGRL1O94910 1474 aa26.14■■□□□ 1.78
USP21-201ENST00000289865 ASXL2Q76L83 1435 aa26.14■■□□□ 1.77
USP21-201ENST00000289865 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
USP21-201ENST00000289865 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
USP21-201ENST00000289865 RALBP1Q15311 655 aa26.13■■□□□ 1.77
USP21-201ENST00000289865 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
USP21-201ENST00000289865 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
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USP21-201ENST00000289865 CEP152O94986 1710 aa26.11■■□□□ 1.77
USP21-201ENST00000289865 TET3O43151 1660 aa26.11■■□□□ 1.77
USP21-201ENST00000289865 TESK2Q96S53 571 aa26.11■■□□□ 1.77
USP21-201ENST00000289865 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.11■■□□□ 1.77
USP21-201ENST00000289865 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.1■■□□□ 1.77
USP21-201ENST00000289865 CLTCL1P53675 1640 aa26.09■■□□□ 1.77
USP21-201ENST00000289865 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
USP21-201ENST00000289865 PTPRTO14522 1441 aa26.09■■□□□ 1.77
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USP21-201ENST00000289865 KANK1Q14678 1352 aa26.08■■□□□ 1.77
USP21-201ENST00000289865 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.07■■□□□ 1.76
USP21-201ENST00000289865 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.07■■□□□ 1.76
USP21-201ENST00000289865 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
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USP21-201ENST00000289865 TMF1P82094 1093 aa26.03■■□□□ 1.76
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USP21-201ENST00000289865 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.03■■□□□ 1.76
USP21-201ENST00000289865 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
USP21-201ENST00000289865 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.01■■□□□ 1.75
USP21-201ENST00000289865 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26■■□□□ 1.75
USP21-201ENST00000289865 NUDCQ9Y266 331 aa26■■□□□ 1.75
USP21-201ENST00000289865 IQGAP1P46940 1657 aa26■■□□□ 1.75
USP21-201ENST00000289865 PPP4R2Q9NY27 417 aa26■■□□□ 1.75
USP21-201ENST00000289865 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.99■■□□□ 1.75
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USP21-201ENST00000289865 OSCARQ8IYS5 282 aa25.96■■□□□ 1.75
USP21-201ENST00000289865 STAC3Q96MF2 364 aa25.95■■□□□ 1.74
USP21-201ENST00000289865 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.94■■□□□ 1.74
USP21-201ENST00000289865 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.94■■□□□ 1.74
USP21-201ENST00000289865 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
USP21-201ENST00000289865 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
USP21-201ENST00000289865 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.91■■□□□ 1.74
USP21-201ENST00000289865 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.91■■□□□ 1.74
USP21-201ENST00000289865 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
USP21-201ENST00000289865 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.9■■□□□ 1.74
USP21-201ENST00000289865 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.88■■□□□ 1.73
USP21-201ENST00000289865 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
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USP21-201ENST00000289865 CD109Q6YHK3 1445 aa25.88■■□□□ 1.73
USP21-201ENST00000289865 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.88■■□□□ 1.73
USP21-201ENST00000289865 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.85■■□□□ 1.73
USP21-201ENST00000289865 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.85■■□□□ 1.73
USP21-201ENST00000289865 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.84■■□□□ 1.73
USP21-201ENST00000289865 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.84■■□□□ 1.73
USP21-201ENST00000289865 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.83■■□□□ 1.73
USP21-201ENST00000289865 MYOM2P54296 1465 aa25.82■■□□□ 1.72
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