RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287507.7

BCKDK-202, Transcript of branched chain ketoacid dehydrogenase kinase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene BCKDK, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDK-202ENST00000287507 RAPGEF3O95398 923 aa28.43■■■□□ 2.14
BCKDK-202ENST00000287507 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.41■■■□□ 2.14
BCKDK-202ENST00000287507 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.4■■■□□ 2.14
BCKDK-202ENST00000287507 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
BCKDK-202ENST00000287507 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
BCKDK-202ENST00000287507 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.37■■■□□ 2.13
BCKDK-202ENST00000287507 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.37■■■□□ 2.13
BCKDK-202ENST00000287507 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.36■■■□□ 2.13
BCKDK-202ENST00000287507 RICTORQ6R327 1708 aa28.35■■■□□ 2.13
BCKDK-202ENST00000287507 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.32■■■□□ 2.12
BCKDK-202ENST00000287507 KIF3BO15066 747 aa28.31■■■□□ 2.12
BCKDK-202ENST00000287507 A2MP01023 1474 aa28.28■■■□□ 2.12
BCKDK-202ENST00000287507 ABCA6Q8N139 1617 aa28.28■■■□□ 2.12
BCKDK-202ENST00000287507 DEPDC5O75140 1603 aa28.28■■■□□ 2.12
BCKDK-202ENST00000287507 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
BCKDK-202ENST00000287507 KANK1Q14678 1352 aa28.27■■■□□ 2.12
BCKDK-202ENST00000287507 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.27■■■□□ 2.12
BCKDK-202ENST00000287507 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.22■■■□□ 2.11
BCKDK-202ENST00000287507 PLA2R1Q13018 1463 aa28.22■■■□□ 2.11
BCKDK-202ENST00000287507 ATP10AO60312 1499 aa28.21■■■□□ 2.11
BCKDK-202ENST00000287507 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.2■■■□□ 2.11
BCKDK-202ENST00000287507 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.2■■■□□ 2.11
BCKDK-202ENST00000287507 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.2■■■□□ 2.1
BCKDK-202ENST00000287507 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.19■■■□□ 2.1
BCKDK-202ENST00000287507 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.19■■■□□ 2.1
BCKDK-202ENST00000287507 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
BCKDK-202ENST00000287507 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.15■■■□□ 2.1
BCKDK-202ENST00000287507 E9PCH4 1651 aa28.14■■■□□ 2.1
BCKDK-202ENST00000287507 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.13■■■□□ 2.09
BCKDK-202ENST00000287507 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
BCKDK-202ENST00000287507 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
BCKDK-202ENST00000287507 TET3O43151 1660 aa28.12■■■□□ 2.09
BCKDK-202ENST00000287507 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
BCKDK-202ENST00000287507 GGT6Q6P531 493 aa28.11■■■□□ 2.09
BCKDK-202ENST00000287507 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.09
BCKDK-202ENST00000287507 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.1■■■□□ 2.09
BCKDK-202ENST00000287507 PTPRTO14522 1441 aa28.09■■■□□ 2.09
BCKDK-202ENST00000287507 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.09■■■□□ 2.09
BCKDK-202ENST00000287507 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.08■■■□□ 2.09
BCKDK-202ENST00000287507 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.06■■■□□ 2.08
BCKDK-202ENST00000287507 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
BCKDK-202ENST00000287507 CEP152O94986 1710 aa28.06■■■□□ 2.08
BCKDK-202ENST00000287507 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
BCKDK-202ENST00000287507 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.05■■■□□ 2.08
BCKDK-202ENST00000287507 RGL3Q3MIN7 710 aa28.04■■■□□ 2.08
BCKDK-202ENST00000287507 MIER1Q8N108 512 aa28.03■■■□□ 2.08
BCKDK-202ENST00000287507 TRPM2O94759 1503 aa28.03■■■□□ 2.08
BCKDK-202ENST00000287507 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
BCKDK-202ENST00000287507 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.01■■■□□ 2.07
BCKDK-202ENST00000287507 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28■■■□□ 2.07
BCKDK-202ENST00000287507 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28■■■□□ 2.07
BCKDK-202ENST00000287507 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
BCKDK-202ENST00000287507 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.95■■■□□ 2.07
BCKDK-202ENST00000287507 ABCC3O15438 1527 aa27.95■■■□□ 2.06
BCKDK-202ENST00000287507 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.94■■■□□ 2.06
BCKDK-202ENST00000287507 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.94■■■□□ 2.06
BCKDK-202ENST00000287507 REREQ9P2R6 1566 aa27.91■■■□□ 2.06
BCKDK-202ENST00000287507 CLTCL1P53675 1640 aa27.91■■■□□ 2.06
BCKDK-202ENST00000287507 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.91■■■□□ 2.06
BCKDK-202ENST00000287507 STAC3Q96MF2 364 aa27.9■■■□□ 2.06
BCKDK-202ENST00000287507 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
BCKDK-202ENST00000287507 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.9■■■□□ 2.06
BCKDK-202ENST00000287507 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.89■■■□□ 2.06
BCKDK-202ENST00000287507 NPATQ14207 1427 aa27.89■■■□□ 2.06
BCKDK-202ENST00000287507 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.88■■■□□ 2.05
BCKDK-202ENST00000287507 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.88■■■□□ 2.05
BCKDK-202ENST00000287507 USP47Q96K76 1375 aa27.86■■■□□ 2.05
BCKDK-202ENST00000287507 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.85■■■□□ 2.05
BCKDK-202ENST00000287507 AGLP35573 1532 aa27.85■■■□□ 2.05
BCKDK-202ENST00000287507 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
BCKDK-202ENST00000287507 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.84■■■□□ 2.05
BCKDK-202ENST00000287507 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.83■■■□□ 2.05
BCKDK-202ENST00000287507 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
BCKDK-202ENST00000287507 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.82■■■□□ 2.04
BCKDK-202ENST00000287507 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.82■■■□□ 2.04
BCKDK-202ENST00000287507 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.82■■■□□ 2.04
BCKDK-202ENST00000287507 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
BCKDK-202ENST00000287507 MLECQ14165 292 aa27.79■■■□□ 2.04
BCKDK-202ENST00000287507 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.77■■■□□ 2.04
BCKDK-202ENST00000287507 NOS1P29475 1434 aa27.76■■■□□ 2.04
BCKDK-202ENST00000287507 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27.76■■■□□ 2.03
BCKDK-202ENST00000287507 KIF1BO60333 1816 aa27.76■■■□□ 2.03
BCKDK-202ENST00000287507 CCDC7Q96M83 1385 aa27.75■■■□□ 2.03
BCKDK-202ENST00000287507 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.75■■■□□ 2.03
BCKDK-202ENST00000287507 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
BCKDK-202ENST00000287507 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.7■■■□□ 2.02
BCKDK-202ENST00000287507 MROH2AA6NES4 1674 aa27.7■■■□□ 2.02
BCKDK-202ENST00000287507 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.7■■■□□ 2.02
BCKDK-202ENST00000287507 SYNMO15061 1565 aa27.69■■■□□ 2.02
BCKDK-202ENST00000287507 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
BCKDK-202ENST00000287507 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
BCKDK-202ENST00000287507 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.67■■■□□ 2.02
BCKDK-202ENST00000287507 LAMC1P11047 1609 aa27.67■■■□□ 2.02
BCKDK-202ENST00000287507 MADDQ8WXG6 1647 aa27.67■■■□□ 2.02
BCKDK-202ENST00000287507 ANP32CO43423 234 aa27.67■■■□□ 2.02
BCKDK-202ENST00000287507 ADGRB3O60242 1522 aa27.67■■■□□ 2.02
BCKDK-202ENST00000287507 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.66■■■□□ 2.02
BCKDK-202ENST00000287507 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
BCKDK-202ENST00000287507 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.65■■■□□ 2.02
BCKDK-202ENST00000287507 MYOM2P54296 1465 aa27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms