RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263434.5

PTPRH-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRH, Length 3,343 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-201ENST00000263434 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.41■□□□□ 0.86
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PTPRH-201ENST00000263434 NLRP13Q86W25 1043 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRH-201ENST00000263434 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
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PTPRH-201ENST00000263434 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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PTPRH-201ENST00000263434 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRH-201ENST00000263434 IFT140Q96RY7 1462 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRH-201ENST00000263434 SLC4A3P48751 1232 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRH-201ENST00000263434 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRH-201ENST00000263434 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.32■□□□□ 0.84
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PTPRH-201ENST00000263434 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
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PTPRH-201ENST00000263434 ERCC6Q03468 1493 aa20.28■□□□□ 0.84
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PTPRH-201ENST00000263434 CEP170Q5SW79 1584 aa20.25■□□□□ 0.83
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PTPRH-201ENST00000263434 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PTPRH-201ENST00000263434 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.2■□□□□ 0.82
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PTPRH-201ENST00000263434 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRH-201ENST00000263434 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRH-201ENST00000263434 SYNJ2O15056 1496 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRH-201ENST00000263434 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.16■□□□□ 0.82
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PTPRH-201ENST00000263434 A2MP01023 1474 aa20.12■□□□□ 0.81
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PTPRH-201ENST00000263434 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.09■□□□□ 0.81
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PTPRH-201ENST00000263434 NEUROD2Q15784 382 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRH-201ENST00000263434 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRH-201ENST00000263434 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRH-201ENST00000263434 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRH-201ENST00000263434 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRH-201ENST00000263434 APAF1O14727 1248 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRH-201ENST00000263434 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRH-201ENST00000263434 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRH-201ENST00000263434 E9PCH4 1651 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRH-201ENST00000263434 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRH-201ENST00000263434 BCAR3O75815 825 aa20.05■□□□□ 0.8
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PTPRH-201ENST00000263434 ABCA8O94911 1581 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRH-201ENST00000263434 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRH-201ENST00000263434 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRH-201ENST00000263434 NFKBIBQ15653 356 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRH-201ENST00000263434 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
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PTPRH-201ENST00000263434 NUP160Q12769 1436 aa20.02■□□□□ 0.79
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PTPRH-201ENST00000263434 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
PTPRH-201ENST00000263434 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
PTPRH-201ENST00000263434 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20■□□□□ 0.79
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PTPRH-201ENST00000263434 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
PTPRH-201ENST00000263434 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
PTPRH-201ENST00000263434 FAM161AQ3B820 660 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRH-201ENST00000263434 GPRASP1Q5JY77 1395 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRH-201ENST00000263434 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRH-201ENST00000263434 AFAP1Q8N556 730 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRH-201ENST00000263434 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
PTPRH-201ENST00000263434 KDM2BQ8NHM5 1336 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRH-201ENST00000263434 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRH-201ENST00000263434 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRH-201ENST00000263434 CHGAP10645 457 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
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