RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261206.7

ACSS3-201, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACSS3, Length 2,666 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3-201ENST00000261206 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
ACSS3-201ENST00000261206 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.91■■□□□ 1.58
ACSS3-201ENST00000261206 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
ACSS3-201ENST00000261206 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.91■■□□□ 1.58
ACSS3-201ENST00000261206 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
ACSS3-201ENST00000261206 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.9■■□□□ 1.58
ACSS3-201ENST00000261206 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.89■■□□□ 1.58
ACSS3-201ENST00000261206 ADGRL2O95490 1459 aa24.89■■□□□ 1.57
ACSS3-201ENST00000261206 ERCC6Q03468 1493 aa24.88■■□□□ 1.57
ACSS3-201ENST00000261206 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
ACSS3-201ENST00000261206 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.88■■□□□ 1.57
ACSS3-201ENST00000261206 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.87■■□□□ 1.57
ACSS3-201ENST00000261206 PBRM1Q86U86 1689 aa24.87■■□□□ 1.57
ACSS3-201ENST00000261206 NUP155O75694 1391 aa24.86■■□□□ 1.57
ACSS3-201ENST00000261206 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.86■■□□□ 1.57
ACSS3-201ENST00000261206 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
ACSS3-201ENST00000261206 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
ACSS3-201ENST00000261206 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
ACSS3-201ENST00000261206 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.84■■□□□ 1.57
ACSS3-201ENST00000261206 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
ACSS3-201ENST00000261206 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
ACSS3-201ENST00000261206 ADAMTS12P58397 1594 aa24.83■■□□□ 1.56
ACSS3-201ENST00000261206 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.82■■□□□ 1.56
ACSS3-201ENST00000261206 C8orf34Q49A92 452 aa24.82■■□□□ 1.56
ACSS3-201ENST00000261206 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
ACSS3-201ENST00000261206 FAM161AQ3B820 660 aa24.81■■□□□ 1.56
ACSS3-201ENST00000261206 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
ACSS3-201ENST00000261206 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.81■■□□□ 1.56
ACSS3-201ENST00000261206 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
ACSS3-201ENST00000261206 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.81■■□□□ 1.56
ACSS3-201ENST00000261206 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
ACSS3-201ENST00000261206 KIAA0556O60303 1618 aa24.79■■□□□ 1.56
ACSS3-201ENST00000261206 DISP1Q96F81 1524 aa24.78■■□□□ 1.56
ACSS3-201ENST00000261206 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.77■■□□□ 1.56
ACSS3-201ENST00000261206 INSRP06213 1382 aa24.76■■□□□ 1.55
ACSS3-201ENST00000261206 CEP170Q5SW79 1584 aa24.76■■□□□ 1.55
ACSS3-201ENST00000261206 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.75■■□□□ 1.55
ACSS3-201ENST00000261206 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ACSS3-201ENST00000261206 FBLN2P98095 1184 aa24.74■■□□□ 1.55
ACSS3-201ENST00000261206 RGS3P49796 1198 aa24.71■■□□□ 1.55
ACSS3-201ENST00000261206 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.71■■□□□ 1.55
ACSS3-201ENST00000261206 PANK3Q9H999 370 aa24.7■■□□□ 1.54
ACSS3-201ENST00000261206 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.7■■□□□ 1.54
ACSS3-201ENST00000261206 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.7■■□□□ 1.54
ACSS3-201ENST00000261206 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.69■■□□□ 1.54
ACSS3-201ENST00000261206 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.69■■□□□ 1.54
ACSS3-201ENST00000261206 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.68■■□□□ 1.54
ACSS3-201ENST00000261206 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.68■■□□□ 1.54
ACSS3-201ENST00000261206 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.68■■□□□ 1.54
ACSS3-201ENST00000261206 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
ACSS3-201ENST00000261206 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.67■■□□□ 1.54
ACSS3-201ENST00000261206 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.67■■□□□ 1.54
ACSS3-201ENST00000261206 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.66■■□□□ 1.54
ACSS3-201ENST00000261206 TESK2Q96S53 571 aa24.64■■□□□ 1.53
ACSS3-201ENST00000261206 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.63■■□□□ 1.53
ACSS3-201ENST00000261206 RGL3Q3MIN7 710 aa24.63■■□□□ 1.53
ACSS3-201ENST00000261206 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.63■■□□□ 1.53
ACSS3-201ENST00000261206 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.62■■□□□ 1.53
ACSS3-201ENST00000261206 PTPRGP23470 1445 aa24.62■■□□□ 1.53
ACSS3-201ENST00000261206 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.61■■□□□ 1.53
ACSS3-201ENST00000261206 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.61■■□□□ 1.53
ACSS3-201ENST00000261206 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
ACSS3-201ENST00000261206 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.59■■□□□ 1.53
ACSS3-201ENST00000261206 TSPY4P0CV99 314 aa24.58■■□□□ 1.53
ACSS3-201ENST00000261206 TSPY10P0CW01 314 aa24.58■■□□□ 1.53
ACSS3-201ENST00000261206 GOLGA2Q08379 1002 aa24.58■■□□□ 1.53
ACSS3-201ENST00000261206 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.57■■□□□ 1.52
ACSS3-201ENST00000261206 ERBINQ96RT1 1412 aa24.57■■□□□ 1.52
ACSS3-201ENST00000261206 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
ACSS3-201ENST00000261206 POGKQ9P215 609 aa24.57■■□□□ 1.52
ACSS3-201ENST00000261206 ZNF521Q96K83 1311 aa24.57■■□□□ 1.52
ACSS3-201ENST00000261206 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
ACSS3-201ENST00000261206 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
ACSS3-201ENST00000261206 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.54■■□□□ 1.52
ACSS3-201ENST00000261206 USP19O94966 1318 aa24.54■■□□□ 1.52
ACSS3-201ENST00000261206 TMF1P82094 1093 aa24.54■■□□□ 1.52
ACSS3-201ENST00000261206 A2MP01023 1474 aa24.51■■□□□ 1.51
ACSS3-201ENST00000261206 PPP2R1AP30153 589 aa24.51■■□□□ 1.51
ACSS3-201ENST00000261206 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
ACSS3-201ENST00000261206 SLFN5Q08AF3 891 aa24.5■■□□□ 1.51
ACSS3-201ENST00000261206 LAMC1P11047 1609 aa24.5■■□□□ 1.51
ACSS3-201ENST00000261206 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.514e-6■■■■□ 23.3
ACSS3-201ENST00000261206 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
ACSS3-201ENST00000261206 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
ACSS3-201ENST00000261206 SEC24BO95487 1268 aa24.48■■□□□ 1.51
ACSS3-201ENST00000261206 IGHDP01880 384 aa24.48■■□□□ 1.51
ACSS3-201ENST00000261206 BCAR3O75815 825 aa24.47■■□□□ 1.51
ACSS3-201ENST00000261206 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
ACSS3-201ENST00000261206 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.46■■□□□ 1.51
ACSS3-201ENST00000261206 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.46■■□□□ 1.51
ACSS3-201ENST00000261206 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
ACSS3-201ENST00000261206 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
ACSS3-201ENST00000261206 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.45■■□□□ 1.5
ACSS3-201ENST00000261206 GRIN2AQ12879 1464 aa24.44■■□□□ 1.5
ACSS3-201ENST00000261206 PLA2R1Q13018 1463 aa24.44■■□□□ 1.5
ACSS3-201ENST00000261206 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.44■■□□□ 1.5
ACSS3-201ENST00000261206 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.44■■□□□ 1.5
ACSS3-201ENST00000261206 BECN1Q14457 450 aa24.43■■□□□ 1.5
ACSS3-201ENST00000261206 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
ACSS3-201ENST00000261206 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms