RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253754.7

PDLIM4-201, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDLIM4, Length 2,282 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-201ENST00000253754 DIP2BQ9P265 1576 aa26.12■■□□□ 1.77
PDLIM4-201ENST00000253754 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PDLIM4-201ENST00000253754 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PDLIM4-201ENST00000253754 TSPOAP1O95153 1857 aa26.1■■□□□ 1.77
PDLIM4-201ENST00000253754 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.77
PDLIM4-201ENST00000253754 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.1■■□□□ 1.77
PDLIM4-201ENST00000253754 ATP7AQ04656 1500 aa26.09■■□□□ 1.77
PDLIM4-201ENST00000253754 CCDC7Q96M83 1385 aa26.09■■□□□ 1.77
PDLIM4-201ENST00000253754 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.09■■□□□ 1.77
PDLIM4-201ENST00000253754 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.09■■□□□ 1.77
PDLIM4-201ENST00000253754 ERBINQ96RT1 1412 aa26.08■■□□□ 1.77
PDLIM4-201ENST00000253754 GLI2P10070 1586 aa26.07■■□□□ 1.76
PDLIM4-201ENST00000253754 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.07■■□□□ 1.76
PDLIM4-201ENST00000253754 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.07■■□□□ 1.76
PDLIM4-201ENST00000253754 NEO1Q92859 1461 aa26.05■■□□□ 1.76
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.03■■□□□ 1.76
PDLIM4-201ENST00000253754 UNC13BO14795 1591 aa26.03■■□□□ 1.76
PDLIM4-201ENST00000253754 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.03■■□□□ 1.76
PDLIM4-201ENST00000253754 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.02■■□□□ 1.76
PDLIM4-201ENST00000253754 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.01■■□□□ 1.75
PDLIM4-201ENST00000253754 RAPGEF3O95398 923 aa26■■□□□ 1.75
PDLIM4-201ENST00000253754 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26■■□□□ 1.75
PDLIM4-201ENST00000253754 KDM5CP41229 1560 aa25.97■■□□□ 1.75
PDLIM4-201ENST00000253754 USP47Q96K76 1375 aa25.96■■□□□ 1.75
PDLIM4-201ENST00000253754 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PDLIM4-201ENST00000253754 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.94■■□□□ 1.74
PDLIM4-201ENST00000253754 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.94■■□□□ 1.74
PDLIM4-201ENST00000253754 KIF3BO15066 747 aa25.94■■□□□ 1.74
PDLIM4-201ENST00000253754 CCDC184Q52MB2 194 aa25.94■■□□□ 1.74
PDLIM4-201ENST00000253754 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.94■■□□□ 1.74
PDLIM4-201ENST00000253754 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.93■■□□□ 1.74
PDLIM4-201ENST00000253754 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.92■■□□□ 1.74
PDLIM4-201ENST00000253754 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.91■■□□□ 1.74
PDLIM4-201ENST00000253754 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PDLIM4-201ENST00000253754 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
PDLIM4-201ENST00000253754 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.89■■□□□ 1.74
PDLIM4-201ENST00000253754 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.89■■□□□ 1.74
PDLIM4-201ENST00000253754 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.88■■□□□ 1.73
PDLIM4-201ENST00000253754 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PDLIM4-201ENST00000253754 RICTORQ6R327 1708 aa25.87■■□□□ 1.73
PDLIM4-201ENST00000253754 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.87■■□□□ 1.73
PDLIM4-201ENST00000253754 A2MP01023 1474 aa25.87■■□□□ 1.73
PDLIM4-201ENST00000253754 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.73
PDLIM4-201ENST00000253754 DEPDC5O75140 1603 aa25.86■■□□□ 1.73
PDLIM4-201ENST00000253754 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.85■■□□□ 1.73
PDLIM4-201ENST00000253754 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PDLIM4-201ENST00000253754 PLA2R1Q13018 1463 aa25.84■■□□□ 1.73
PDLIM4-201ENST00000253754 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.83■■□□□ 1.73
PDLIM4-201ENST00000253754 ABCA6Q8N139 1617 aa25.83■■□□□ 1.72
PDLIM4-201ENST00000253754 FKBP8Q14318 412 aa25.83■■□□□ 1.72
PDLIM4-201ENST00000253754 KANK1Q14678 1352 aa25.82■■□□□ 1.72
PDLIM4-201ENST00000253754 BCANQ96GW7 911 aa25.81■■□□□ 1.72
PDLIM4-201ENST00000253754 RGL3Q3MIN7 710 aa25.8■■□□□ 1.72
PDLIM4-201ENST00000253754 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.79■■□□□ 1.72
PDLIM4-201ENST00000253754 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PDLIM4-201ENST00000253754 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PDLIM4-201ENST00000253754 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.77■■□□□ 1.72
PDLIM4-201ENST00000253754 MRS2Q9HD23 443 aa25.77■■□□□ 1.72
PDLIM4-201ENST00000253754 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
PDLIM4-201ENST00000253754 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.76■■□□□ 1.71
PDLIM4-201ENST00000253754 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.76■■□□□ 1.71
PDLIM4-201ENST00000253754 E9PCH4 1651 aa25.75■■□□□ 1.71
PDLIM4-201ENST00000253754 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.75■■□□□ 1.71
PDLIM4-201ENST00000253754 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.75■■□□□ 1.71
PDLIM4-201ENST00000253754 GGT6Q6P531 493 aa25.75■■□□□ 1.71
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.75■■□□□ 1.71
PDLIM4-201ENST00000253754 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
PDLIM4-201ENST00000253754 TET3O43151 1660 aa25.72■■□□□ 1.71
PDLIM4-201ENST00000253754 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.72■■□□□ 1.71
PDLIM4-201ENST00000253754 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PDLIM4-201ENST00000253754 ATP10AO60312 1499 aa25.7■■□□□ 1.71
PDLIM4-201ENST00000253754 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.69■■□□□ 1.7
PDLIM4-201ENST00000253754 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
PDLIM4-201ENST00000253754 NEFLP07196 543 aa25.67■■□□□ 1.7
PDLIM4-201ENST00000253754 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.67■■□□□ 1.7
PDLIM4-201ENST00000253754 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.66■■□□□ 1.7
PDLIM4-201ENST00000253754 CEP152O94986 1710 aa25.65■■□□□ 1.7
PDLIM4-201ENST00000253754 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.64■■□□□ 1.69
PDLIM4-201ENST00000253754 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.63■■□□□ 1.69
PDLIM4-201ENST00000253754 PTPRTO14522 1441 aa25.62■■□□□ 1.69
PDLIM4-201ENST00000253754 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.62■■□□□ 1.69
PDLIM4-201ENST00000253754 TRPM2O94759 1503 aa25.61■■□□□ 1.69
PDLIM4-201ENST00000253754 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.61■■□□□ 1.69
PDLIM4-201ENST00000253754 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
PDLIM4-201ENST00000253754 ABCC3O15438 1527 aa25.56■■□□□ 1.68
PDLIM4-201ENST00000253754 CLTCL1P53675 1640 aa25.55■■□□□ 1.68
PDLIM4-201ENST00000253754 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.55■■□□□ 1.68
PDLIM4-201ENST00000253754 NPATQ14207 1427 aa25.53■■□□□ 1.68
PDLIM4-201ENST00000253754 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PDLIM4-201ENST00000253754 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.52■■□□□ 1.68
PDLIM4-201ENST00000253754 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.5■■□□□ 1.67
PDLIM4-201ENST00000253754 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.49■■□□□ 1.67
PDLIM4-201ENST00000253754 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.49■■□□□ 1.67
PDLIM4-201ENST00000253754 MLECQ14165 292 aa25.48■■□□□ 1.67
PDLIM4-201ENST00000253754 TESK2Q96S53 571 aa25.47■■□□□ 1.67
PDLIM4-201ENST00000253754 REREQ9P2R6 1566 aa25.47■■□□□ 1.67
PDLIM4-201ENST00000253754 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.46■■□□□ 1.67
PDLIM4-201ENST00000253754 LAMC1P11047 1609 aa25.46■■□□□ 1.67
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