RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 TMF1P82094 1093 aa24.5■■□□□ 1.51
LRP3-201ENST00000253193 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.48■■□□□ 1.51
LRP3-201ENST00000253193 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.47■■□□□ 1.51
LRP3-201ENST00000253193 KIF14Q15058 1648 aa24.47■■□□□ 1.51
LRP3-201ENST00000253193 PLIN1O60240 522 aa24.46■■□□□ 1.51
LRP3-201ENST00000253193 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.46■■□□□ 1.51
LRP3-201ENST00000253193 ATP10BO94823 1461 aa24.45■■□□□ 1.51
LRP3-201ENST00000253193 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.45■■□□□ 1.51
LRP3-201ENST00000253193 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
LRP3-201ENST00000253193 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
LRP3-201ENST00000253193 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
LRP3-201ENST00000253193 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
LRP3-201ENST00000253193 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
LRP3-201ENST00000253193 CEP170Q5SW79 1584 aa24.36■■□□□ 1.49
LRP3-201ENST00000253193 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.36■■□□□ 1.49
LRP3-201ENST00000253193 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.35■■□□□ 1.49
LRP3-201ENST00000253193 ADGRL2O95490 1459 aa24.34■■□□□ 1.49
LRP3-201ENST00000253193 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.33■■□□□ 1.49
LRP3-201ENST00000253193 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
LRP3-201ENST00000253193 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.31■■□□□ 1.48
LRP3-201ENST00000253193 PDE3BQ13370 1112 aa24.31■■□□□ 1.48
LRP3-201ENST00000253193 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.3■■□□□ 1.48
LRP3-201ENST00000253193 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
LRP3-201ENST00000253193 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
LRP3-201ENST00000253193 AFAP1Q8N556 730 aa24.27■■□□□ 1.48
LRP3-201ENST00000253193 NUP160Q12769 1436 aa24.27■■□□□ 1.48
LRP3-201ENST00000253193 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.26■■□□□ 1.47
LRP3-201ENST00000253193 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
LRP3-201ENST00000253193 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.26■■□□□ 1.47
LRP3-201ENST00000253193 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.25■■□□□ 1.47
LRP3-201ENST00000253193 CRBNQ96SW2 442 aa24.25■■□□□ 1.47
LRP3-201ENST00000253193 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.25■■□□□ 1.47
LRP3-201ENST00000253193 CDCA8Q53HL2 280 aa24.25■■□□□ 1.47
LRP3-201ENST00000253193 MBD5Q9P267 1494 aa24.25■■□□□ 1.47
LRP3-201ENST00000253193 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.24■■□□□ 1.47
LRP3-201ENST00000253193 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
LRP3-201ENST00000253193 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
LRP3-201ENST00000253193 SKAP1Q86WV1 359 aa24.23■■□□□ 1.47
LRP3-201ENST00000253193 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.23■■□□□ 1.47
LRP3-201ENST00000253193 KIF3BO15066 747 aa24.23■■□□□ 1.47
LRP3-201ENST00000253193 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
LRP3-201ENST00000253193 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.22■■□□□ 1.47
LRP3-201ENST00000253193 PDE4AP27815 886 aa24.22■■□□□ 1.47
LRP3-201ENST00000253193 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.2■■□□□ 1.46
LRP3-201ENST00000253193 NEUROD2Q15784 382 aa24.2■■□□□ 1.46
LRP3-201ENST00000253193 KDM5CP41229 1560 aa24.19■■□□□ 1.46
LRP3-201ENST00000253193 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
LRP3-201ENST00000253193 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.19■■□□□ 1.46
LRP3-201ENST00000253193 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.19■■□□□ 1.46
LRP3-201ENST00000253193 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
LRP3-201ENST00000253193 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.19■■□□□ 1.46
LRP3-201ENST00000253193 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.18■■□□□ 1.46
LRP3-201ENST00000253193 TESK2Q96S53 571 aa24.18■■□□□ 1.46
LRP3-201ENST00000253193 RGS3P49796 1198 aa24.17■■□□□ 1.46
LRP3-201ENST00000253193 ERBINQ96RT1 1412 aa24.17■■□□□ 1.46
LRP3-201ENST00000253193 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
LRP3-201ENST00000253193 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.15■■□□□ 1.46
LRP3-201ENST00000253193 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.14■■□□□ 1.45
LRP3-201ENST00000253193 GOLGA2Q08379 1002 aa24.14■■□□□ 1.45
LRP3-201ENST00000253193 PPP2R1AP30153 589 aa24.13■■□□□ 1.45
LRP3-201ENST00000253193 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.12■■□□□ 1.45
LRP3-201ENST00000253193 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.11■■□□□ 1.45
LRP3-201ENST00000253193 NEFMP07197 916 aa24.11■■□□□ 1.45
LRP3-201ENST00000253193 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
LRP3-201ENST00000253193 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.1■■□□□ 1.45
LRP3-201ENST00000253193 ABCA8O94911 1581 aa24.09■■□□□ 1.45
LRP3-201ENST00000253193 APAF1O14727 1248 aa24.09■■□□□ 1.45
LRP3-201ENST00000253193 KANK1Q14678 1352 aa24.08■■□□□ 1.45
LRP3-201ENST00000253193 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.07■■□□□ 1.44
LRP3-201ENST00000253193 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
LRP3-201ENST00000253193 IL27Q8NEV9 243 aa24.06■■□□□ 1.44
LRP3-201ENST00000253193 A2MP01023 1474 aa24.06■■□□□ 1.44
LRP3-201ENST00000253193 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.06■■□□□ 1.44
LRP3-201ENST00000253193 GGT6Q6P531 493 aa24.04■■□□□ 1.44
LRP3-201ENST00000253193 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
LRP3-201ENST00000253193 SLC4A3P48751 1232 aa24.03■■□□□ 1.44
LRP3-201ENST00000253193 BACH2Q9BYV9 841 aa24.02■■□□□ 1.44
LRP3-201ENST00000253193 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.01■■□□□ 1.43
LRP3-201ENST00000253193 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.01■■□□□ 1.43
LRP3-201ENST00000253193 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
LRP3-201ENST00000253193 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24■■□□□ 1.43
LRP3-201ENST00000253193 PLA2R1Q13018 1463 aa23.99■■□□□ 1.43
LRP3-201ENST00000253193 MS4A1P11836 297 aa23.99■■□□□ 1.43
LRP3-201ENST00000253193 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.99■■□□□ 1.43
LRP3-201ENST00000253193 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.99■■□□□ 1.43
LRP3-201ENST00000253193 MORC1Q86VD1 984 aa23.98■■□□□ 1.43
LRP3-201ENST00000253193 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.98■■□□□ 1.43
LRP3-201ENST00000253193 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
LRP3-201ENST00000253193 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
LRP3-201ENST00000253193 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.43
LRP3-201ENST00000253193 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
LRP3-201ENST00000253193 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.95■■□□□ 1.42
LRP3-201ENST00000253193 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
LRP3-201ENST00000253193 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.94■■□□□ 1.42
LRP3-201ENST00000253193 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
LRP3-201ENST00000253193 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.93■■□□□ 1.42
LRP3-201ENST00000253193 BCAR3O75815 825 aa23.92■■□□□ 1.42
LRP3-201ENST00000253193 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.92■■□□□ 1.42
LRP3-201ENST00000253193 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
LRP3-201ENST00000253193 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.92■■□□□ 1.42
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